src/jalview/gui/ScalePanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import java.awt.*;\r
  22 import java.awt.event.*;\r
  23 import javax.swing.*;\r
  24 \r
  25 import jalview.datamodel.*;\r
  26 \r
  27 public class ScalePanel\r
  28     extends JPanel\r
  29 {\r
  30   protected int offy = 4;\r
  31   public int width;\r
  32   protected AlignViewport av;\r
  33   AlignmentPanel ap;\r
  34   boolean stretchingGroup = false;\r
  35 \r
  36   int min, max; //used by mouseDragged to see if user\r
  37   // wants to delete columns\r
  38 \r
  39   public ScalePanel(AlignViewport av, AlignmentPanel ap)\r
  40   {\r
  41     this.av = av;\r
  42     this.ap = ap;\r
  43 \r
  44     addMouseListener(new MouseAdapter()\r
  45     {\r
  46       public void mousePressed(MouseEvent evt)\r
  47       {\r
  48         doMousePressed(evt);\r
  49       }\r
  50 \r
  51       public void mouseReleased(MouseEvent evt)\r
  52       {\r
  53         doMouseReleased(evt);\r
  54       }\r
  55     });\r
  56     addMouseMotionListener(new MouseMotionAdapter()\r
  57     {\r
  58       public void mouseDragged(MouseEvent evt)\r
  59       {\r
  60         doMouseDragged(evt);\r
  61       }\r
  62     });\r
  63   }\r
  64 \r
  65   public void doMousePressed(MouseEvent evt)\r
  66   {\r
  67     int x = evt.getX();\r
  68     int res = (x / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
  69     SequenceGroup sg = null;\r
  70 \r
  71     min=res;\r
  72     max=res;\r
  73 \r
  74     if (av.getColumnSelection().contains(res))\r
  75     {\r
  76       av.getColumnSelection().removeElement(res);\r
  77       ap.annotationPanel.removeEditableColumn(res);\r
  78     }\r
  79     else\r
  80     {\r
  81       av.getColumnSelection().addElement(res);\r
  82       sg = new SequenceGroup();\r
  83 \r
  84       for (int i = 0; i < av.alignment.getSequences().size(); i++)\r
  85       {\r
  86         sg.addSequence(av.alignment.getSequenceAt(i), false);\r
  87       }\r
  88 \r
  89       sg.setStartRes(res);\r
  90       sg.setEndRes(res);\r
  91 \r
  92     }\r
  93 \r
  94     av.setSelectionGroup(sg);\r
  95     ap.repaint();\r
  96   }\r
  97 \r
  98   public void doMouseReleased(MouseEvent evt)\r
  99   {\r
 100     int x = evt.getX();\r
 101     int res = (x / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
 102 \r
 103     if(av.getColumnSelection()!=null)\r
 104     {\r
 105       for(int i=0; i<av.getColumnSelection().size(); i++)\r
 106       {\r
 107         ap.annotationPanel.addEditableColumn(\r
 108             av.getColumnSelection().columnAt(i));\r
 109       }\r
 110     }\r
 111 \r
 112     if (!stretchingGroup)\r
 113     {\r
 114       ap.repaint();\r
 115       return;\r
 116     }\r
 117 \r
 118     SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
 119 \r
 120     if (res > sg.getStartRes())\r
 121     {\r
 122       sg.setEndRes(res);\r
 123     }\r
 124     else if (res < sg.getStartRes())\r
 125     {\r
 126       sg.setStartRes(res);\r
 127     }\r
 128 \r
 129     stretchingGroup = false;\r
 130     ap.repaint();\r
 131   }\r
 132 \r
 133   public void doMouseDragged(MouseEvent evt)\r
 134   {\r
 135     int x = evt.getX();\r
 136     int res = (x / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
 137 \r
 138     if(res < min)\r
 139       min = res;\r
 140     if(res>max)\r
 141       max = res;\r
 142 \r
 143     SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
 144 \r
 145     if (sg != null)\r
 146     {\r
 147       stretchingGroup = true;\r
 148       if (!av.getColumnSelection().contains(res))\r
 149       {\r
 150         av.getColumnSelection().addElement(res);\r
 151       }\r
 152 \r
 153 \r
 154       if (res > sg.getStartRes())\r
 155       {\r
 156         sg.setEndRes(res);\r
 157       }\r
 158       else if (res < sg.getStartRes())\r
 159       {\r
 160         sg.setStartRes(res);\r
 161       }\r
 162 \r
 163       for(int i=min; i<=max; i++)\r
 164       {\r
 165         if (i < sg.getStartRes() || i > sg.getEndRes())\r
 166          {\r
 167            av.getColumnSelection().removeElement(i);\r
 168            ap.annotationPanel.removeEditableColumn(res);\r
 169          }\r
 170         else\r
 171           av.getColumnSelection().addElement(i);\r
 172       }\r
 173       ap.repaint();\r
 174     }\r
 175   }\r
 176 \r
 177   public void paintComponent(Graphics g)\r
 178   {\r
 179     drawScale(g, av.getStartRes(), av.getEndRes(), getWidth(), getHeight());\r
 180   }\r
 181 \r
 182   // scalewidth will normally be screenwidth,\r
 183   public void drawScale(Graphics g, int startx, int endx, int width,\r
 184                         int height)\r
 185   {\r
 186     Graphics2D gg = (Graphics2D) g;\r
 187     gg.setFont(av.getFont());\r
 188     gg.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,\r
 189                         RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_ON);\r
 190 \r
 191     //Fill in the background\r
 192     gg.setColor(Color.white);\r
 193     gg.fillRect(0, 0, width, height);\r
 194     gg.setColor(Color.black);\r
 195 \r
 196     //Fill the selected columns\r
 197     ColumnSelection cs = av.getColumnSelection();\r
 198     gg.setColor(new Color(220, 0, 0));\r
 199 \r
 200     for (int i = 0; i < cs.size(); i++)\r
 201     {\r
 202       int sel = cs.columnAt(i);\r
 203 \r
 204       if ( (sel >= startx) && (sel <= endx))\r
 205       {\r
 206         gg.fillRect( (sel - startx) * av.charWidth, 0, av.charWidth,\r
 207                     getHeight());\r
 208       }\r
 209     }\r
 210 \r
 211     // Draw the scale numbers\r
 212     gg.setColor(Color.black);\r
 213 \r
 214     int scalestartx = (startx / 10) * 10;\r
 215 \r
 216     FontMetrics fm = gg.getFontMetrics(av.getFont());\r
 217     int y = av.charHeight - fm.getDescent();\r
 218 \r
 219     if ( (scalestartx % 10) == 0)\r
 220     {\r
 221       scalestartx += 5;\r
 222     }\r
 223 \r
 224     for (int i = scalestartx; i < endx; i += 5)\r
 225     {\r
 226       if ( (i % 10) == 0)\r
 227       {\r
 228         gg.drawString(String.valueOf(i),\r
 229                       (i - startx - 1) * av.charWidth, y);\r
 230         gg.drawLine( (int) ( ( (i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 231                             (av.charWidth / 2)), y + 2,\r
 232                     (int) ( ( (i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 233                            (av.charWidth / 2)), y + (fm.getDescent() * 2));\r
 234       }\r
 235       else\r
 236       {\r
 237         gg.drawLine( (int) ( ( (i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 238                             (av.charWidth / 2)), y + fm.getDescent(),\r
 239                     (int) ( ( (i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 240                            (av.charWidth / 2)), y + (fm.getDescent() * 2));\r
 241       }\r
 242     }\r
 243   }\r
 244 }\r