src/jalview/gui/ScalePanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import jalview.datamodel.*;\r
  22 \r
  23 import java.awt.*;\r
  24 import java.awt.event.*;\r
  25 \r
  26 import javax.swing.*;\r
  27 \r
  28 \r
  29 /**\r
  30  * DOCUMENT ME!\r
  31  *\r
  32  * @author $author$\r
  33  * @version $Revision$\r
  34  */\r
  35 public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener, MouseListener\r
  36 {\r
  37     protected int offy = 4;\r
  38 \r
  39     /** DOCUMENT ME!! */\r
  40     public int width;\r
  41     protected AlignViewport av;\r
  42     AlignmentPanel ap;\r
  43     boolean stretchingGroup = false;\r
  44     int min; //used by mouseDragged to see if user\r
  45     int max; //used by mouseDragged to see if user\r
  46     boolean mouseDragging = false;\r
  47 \r
  48     // wants to delete columns\r
  49     public ScalePanel(AlignViewport av, AlignmentPanel ap)\r
  50     {\r
  51         this.av = av;\r
  52         this.ap = ap;\r
  53 \r
  54         addMouseListener(this);\r
  55         addMouseMotionListener(this);\r
  56     }\r
  57 \r
  58     /**\r
  59      * DOCUMENT ME!\r
  60      *\r
  61      * @param evt DOCUMENT ME!\r
  62      */\r
  63     public void mousePressed(MouseEvent evt)\r
  64     {\r
  65         int x = (evt.getX() / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
  66         final int res;\r
  67 \r
  68         if(av.hasHiddenColumns)\r
  69           res = av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(x);\r
  70         else\r
  71           res = x;\r
  72 \r
  73         min = res;\r
  74         max = res;\r
  75 \r
  76       /*  if(reveal != null && SwingUtilities.isRightMouseButton(evt))\r
  77           {\r
  78             JPopupMenu pop = new JPopupMenu();\r
  79             JMenuItem item = new JMenuItem("Reveal");\r
  80             item.addActionListener(new ActionListener()\r
  81             {\r
  82               public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  83               {\r
  84                 av.getColumnSelection().revealHiddenColumns(reveal[0], av);\r
  85                 reveal = null;\r
  86                 ap.repaint();\r
  87                 if(ap.overviewPanel != null)\r
  88                     ap.overviewPanel.updateOverviewImage();\r
  89               }\r
  90             });\r
  91             pop.add(item);\r
  92 \r
  93             if(av.getColumnSelection().hiddenColumns.size()>1)\r
  94             {\r
  95               item = new JMenuItem("Reveal All");\r
  96               item.addActionListener(new ActionListener()\r
  97               {\r
  98                 public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  99                 {\r
 100                   av.getColumnSelection().revealAllHiddenColumns(av);\r
 101                   reveal = null;\r
 102                   ap.repaint();\r
 103                   if(ap.overviewPanel != null)\r
 104                     ap.overviewPanel.updateOverviewImage();\r
 105                 }\r
 106               });\r
 107               pop.add(item);\r
 108             }\r
 109 \r
 110             pop.show(this, evt.getX(), evt.getY());\r
 111 \r
 112           }\r
 113         else*/\r
 114       if (av.getColumnSelection().contains(res))\r
 115         {\r
 116         /*  if( SwingUtilities.isRightMouseButton(evt))\r
 117           {\r
 118             JPopupMenu pop = new JPopupMenu();\r
 119             JMenuItem item = new JMenuItem("Hide Columns");\r
 120             item.addActionListener(new ActionListener()\r
 121             {\r
 122               public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 123               {\r
 124                 av.getColumnSelection().hideColumns(res, av);\r
 125                 ap.repaint();\r
 126                 if(ap.overviewPanel != null)\r
 127                   ap.overviewPanel.updateOverviewImage();\r
 128               }\r
 129             });\r
 130             pop.add(item);\r
 131             pop.show(this, evt.getX(), evt.getY());\r
 132 \r
 133           }\r
 134           else*/\r
 135           {\r
 136             av.getColumnSelection().removeElement(res);\r
 137             av.setSelectionGroup(null);\r
 138           }\r
 139         }\r
 140         else\r
 141         {\r
 142             av.getColumnSelection().addElement(res);\r
 143             SequenceGroup sg = new SequenceGroup();\r
 144 \r
 145             for (int i = 0; i < av.alignment.getSequences().size(); i++)\r
 146             {\r
 147                 sg.addSequence(av.alignment.getSequenceAt(i), false);\r
 148             }\r
 149 \r
 150             sg.setStartRes(res);\r
 151             sg.setEndRes(res);\r
 152             av.setSelectionGroup(sg);\r
 153         }\r
 154 \r
 155 \r
 156         ap.repaint();\r
 157     }\r
 158 \r
 159     /**\r
 160      * DOCUMENT ME!\r
 161      *\r
 162      * @param evt DOCUMENT ME!\r
 163      */\r
 164     public void mouseReleased(MouseEvent evt)\r
 165     {\r
 166         mouseDragging = false;\r
 167 \r
 168         int res = (evt.getX() / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
 169 \r
 170         if(av.hasHiddenColumns)\r
 171           res = av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(res);\r
 172 \r
 173         if (!stretchingGroup)\r
 174         {\r
 175             ap.repaint();\r
 176 \r
 177             return;\r
 178         }\r
 179 \r
 180         SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
 181 \r
 182         if (res > sg.getStartRes())\r
 183         {\r
 184             sg.setEndRes(res);\r
 185         }\r
 186         else if (res < sg.getStartRes())\r
 187         {\r
 188             sg.setStartRes(res);\r
 189         }\r
 190 \r
 191         stretchingGroup = false;\r
 192         ap.repaint();\r
 193     }\r
 194 \r
 195     /**\r
 196      * DOCUMENT ME!\r
 197      *\r
 198      * @param evt DOCUMENT ME!\r
 199      */\r
 200     public void mouseDragged(MouseEvent evt)\r
 201     {\r
 202         mouseDragging = true;\r
 203 \r
 204         int res = (evt.getX() / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
 205 \r
 206         if(av.hasHiddenColumns)\r
 207           res = av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(res);\r
 208 \r
 209         if (res < min)\r
 210         {\r
 211             min = res;\r
 212         }\r
 213 \r
 214         if (res > max)\r
 215         {\r
 216             max = res;\r
 217         }\r
 218 \r
 219 \r
 220         SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
 221 \r
 222         if (sg != null)\r
 223         {\r
 224             stretchingGroup = true;\r
 225 \r
 226             if (!av.getColumnSelection().contains(res))\r
 227             {\r
 228                 av.getColumnSelection().addElement(res);\r
 229             }\r
 230 \r
 231             if (res > sg.getStartRes())\r
 232             {\r
 233                 sg.setEndRes(res);\r
 234             }\r
 235             if (res < sg.getStartRes())\r
 236             {\r
 237                 sg.setStartRes(res);\r
 238             }\r
 239 \r
 240             for (int i = min; i <= max; i++)\r
 241             {\r
 242                 if ((i < sg.getStartRes()) || (i > sg.getEndRes()))\r
 243                 {\r
 244                     av.getColumnSelection().removeElement(i);\r
 245                 }\r
 246                 else\r
 247                 {\r
 248                     av.getColumnSelection().addElement(i);\r
 249                 }\r
 250             }\r
 251 \r
 252             ap.repaint();\r
 253         }\r
 254     }\r
 255 \r
 256     public void mouseEntered(MouseEvent evt)\r
 257     {\r
 258       if(mouseDragging)\r
 259         ap.seqPanel.scrollCanvas(null);\r
 260     }\r
 261 \r
 262     public void mouseExited(MouseEvent evt)\r
 263     {\r
 264       if(mouseDragging)\r
 265         ap.seqPanel.scrollCanvas(evt);\r
 266     }\r
 267 \r
 268     public void mouseClicked(MouseEvent evt){}\r
 269 \r
 270     public void mouseMoved(MouseEvent evt)\r
 271     {\r
 272       if(!av.hasHiddenColumns)\r
 273         return;\r
 274 \r
 275       int res = (evt.getX() / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
 276 \r
 277       res = av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(res);\r
 278 \r
 279       reveal = null;\r
 280       for(int i=0; i<av.getColumnSelection().getHiddenColumns().size(); i++)\r
 281       {\r
 282         int [] region = (int[])av.getColumnSelection().getHiddenColumns().elementAt(i);\r
 283         if(res+1==region[0] || res-1==region[1])\r
 284         {\r
 285           reveal = region;\r
 286           ToolTipManager.sharedInstance().registerComponent(this);\r
 287           this.setToolTipText("Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button");\r
 288           break;\r
 289         }\r
 290         else\r
 291           this.setToolTipText(null);\r
 292 \r
 293       }\r
 294 \r
 295       repaint();\r
 296     }\r
 297 \r
 298     int [] reveal;\r
 299 \r
 300     /**\r
 301      * DOCUMENT ME!\r
 302      *\r
 303      * @param g DOCUMENT ME!\r
 304      */\r
 305     public void paintComponent(Graphics g)\r
 306     {\r
 307         drawScale(g, av.getStartRes(), av.getEndRes(), getWidth(), getHeight());\r
 308     }\r
 309 \r
 310     // scalewidth will normally be screenwidth,\r
 311     public void drawScale(Graphics g, int startx, int endx, int width,\r
 312         int height)\r
 313     {\r
 314         Graphics2D gg = (Graphics2D) g;\r
 315         gg.setFont(av.getFont());\r
 316 \r
 317         if(av.antiAlias)\r
 318           gg.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,\r
 319                               RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_ON);\r
 320 \r
 321         //Fill in the background\r
 322         gg.setColor(Color.white);\r
 323         gg.fillRect(0, 0, width, height);\r
 324         gg.setColor(Color.black);\r
 325 \r
 326         //Fill the selected columns\r
 327         ColumnSelection cs = av.getColumnSelection();\r
 328         gg.setColor(new Color(220, 0, 0));\r
 329 \r
 330         for (int i = 0; i < cs.size(); i++)\r
 331         {\r
 332             int sel = cs.columnAt(i);\r
 333             if(av.hasHiddenColumns)\r
 334                 sel = av.getColumnSelection().findColumnPosition(sel);\r
 335 \r
 336             if ((sel >= startx) && (sel <= endx))\r
 337             {\r
 338                 gg.fillRect((sel - startx) * av.charWidth, 0, av.charWidth,\r
 339                     getHeight());\r
 340             }\r
 341         }\r
 342 \r
 343         // Draw the scale numbers\r
 344         gg.setColor(Color.black);\r
 345 \r
 346         int scalestartx = (startx / 10) * 10;\r
 347 \r
 348         FontMetrics fm = gg.getFontMetrics(av.getFont());\r
 349         int y = av.charHeight - fm.getDescent();\r
 350 \r
 351         if ((scalestartx % 10) == 0)\r
 352         {\r
 353             scalestartx += 5;\r
 354         }\r
 355 \r
 356         for (int i = scalestartx; i < endx; i += 5)\r
 357         {\r
 358             if ((i % 10) == 0)\r
 359             {\r
 360                 gg.drawString(String.valueOf(av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(i)),\r
 361                     (i - startx - 1) * av.charWidth, y);\r
 362                 gg.drawLine((int) (((i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 363                     (av.charWidth / 2)), y + 2,\r
 364                     (int) (((i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 365                     (av.charWidth / 2)), y + (fm.getDescent() * 2));\r
 366             }\r
 367             else\r
 368             {\r
 369                 gg.drawLine((int) (((i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 370                     (av.charWidth / 2)), y + fm.getDescent(),\r
 371                     (int) (((i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 372                     (av.charWidth / 2)), y + (fm.getDescent() * 2));\r
 373             }\r
 374         }\r
 375 \r
 376         if (av.hasHiddenColumns)\r
 377         {\r
 378           gg.setColor(Color.blue);\r
 379           int res;\r
 380           for (int i = 0; i < av.getColumnSelection().getHiddenColumns().size(); i++)\r
 381           {\r
 382             res = av.getColumnSelection().findHiddenRegionPosition( i )-startx;\r
 383 \r
 384             gg.fillPolygon(new int[] { res*av.charWidth - av.charHeight/4,\r
 385                                          res*av.charWidth + av.charHeight/4,\r
 386                                          res*av.charWidth },\r
 387                                 new int[]\r
 388                                 {\r
 389                                     y-av.charHeight/2 , y-av.charHeight/2 ,\r
 390                                     y + 8\r
 391                                 }, 3);\r
 392 \r
 393 \r
 394           }\r
 395 \r
 396           if (reveal != null && reveal[0] > startx && reveal[0] < endx)\r
 397           {\r
 398             gg.drawString("Reveal Columns", reveal[0] * av.charWidth, 0);\r
 399           }\r
 400         }\r
 401 \r
 402 \r
 403     }\r
 404 }\r