Remove paintFlag ref
[jalview.git] / src / jalview / gui / UserDefinedColours.java
1 package jalview.gui;\r
2 \r
3 import jalview.jbgui.GUserDefinedColours;\r
4 import jalview.datamodel.*;\r
5 import jalview.io.*;\r
6 import javax.swing.*;\r
7 import java.awt.*;\r
8 import java.awt.event.*;\r
9 import javax.swing.event.*;\r
10 import jalview.schemes.*;\r
11 import java.io.*;\r
12 import java.util.*;\r
13 \r
14 \r
15 public class UserDefinedColours extends GUserDefinedColours implements ChangeListener\r
16 {\r
17 \r
18   AlignmentPanel ap;\r
19   SequenceGroup seqGroup;\r
20   JButton selectedButton;\r
21   Vector oldColours = new Vector();\r
22   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
23   JInternalFrame frame;\r
24 \r
25 \r
26   public UserDefinedColours(JInternalFrame f, AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
27   {\r
28     super();\r
29     colorChooser.getSelectionModel().addChangeListener(this);\r
30     this.ap = ap;\r
31     frame = f;\r
32     seqGroup = sg;\r
33 \r
34 \r
35       if (seqGroup != null)\r
36         oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
37       else\r
38         oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
39 \r
40       for (int i = 0; i < 20; i++)\r
41         makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
42                    "", ResidueProperties.aa[i]);\r
43 \r
44       makeButton("B", "B");\r
45       makeButton("Z", "Z");\r
46       makeButton("X", "X");\r
47       makeButton("'.','-',' '", "-");\r
48 \r
49       if(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR")!=null)\r
50       {\r
51         loadColour(jalview.bin.Cache.getProperty("USER_DEFINED_COLOUR"));\r
52       }\r
53 \r
54 \r
55   }\r
56 \r
57  public void stateChanged(ChangeEvent evt)\r
58  {\r
59    if(selectedButton!=null)\r
60      selectedButton.setBackground( colorChooser.getColor() );\r
61  }\r
62 \r
63   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
64   {\r
65      selectedButton = (JButton)e.getSource();\r
66      colorChooser.setColor(selectedButton.getBackground());\r
67   }\r
68 \r
69   void makeButton(String label, String aa)\r
70   {\r
71     final JButton button = new JButton();\r
72     Color col = Color.white;\r
73 \r
74 \r
75     try{\r
76       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1, null);\r
77     }catch(Exception ex){}\r
78 \r
79     button.setBackground(  col );\r
80     oldColours.addElement( col );\r
81     button.setText( label );\r
82     button.setForeground( col.darker().darker().darker() );\r
83     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
84     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
85     {\r
86       public void mouseClicked(MouseEvent e)\r
87       {\r
88         colourButtonPressed(e);\r
89       }\r
90     });\r
91 \r
92     buttonPanel.add(button);\r
93   }\r
94 \r
95 \r
96   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
97   {\r
98     applyButton_actionPerformed(null);\r
99     try{\r
100       frame.setClosed(true);\r
101     }catch(Exception ex){}\r
102   }\r
103 \r
104   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
105   {\r
106     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme();\r
107     Color [] newColours = new Color[24];\r
108     for(int i=0; i<24; i++)\r
109     {\r
110           JButton button = (JButton)buttonPanel.getComponent(i);\r
111           newColours[i] = button.getBackground();\r
112     }\r
113 \r
114     ucs.setThreshold(0);\r
115     ucs.setColourScheme( newColours );\r
116 \r
117     if(seqGroup!=null)\r
118       seqGroup.cs = ucs;\r
119     else\r
120       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
121 \r
122     ap.RefreshPanels();\r
123   }\r
124 \r
125   protected void loadbutton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
126   {\r
127     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"),\r
128         new String[]{".jvuc"}, "Jalview User Colours");\r
129     chooser.setFileView(new jalview.io.JalviewFileView());\r
130     chooser.setDialogTitle("Load colour scheme");\r
131     chooser.setToolTipText("Load");\r
132     int value = chooser.showOpenDialog(this);\r
133     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
134     {\r
135       String choice = chooser.getSelectedFile().getPath();\r
136       jalview.bin.Cache.setProperty("LAST_DIRECTORY",  choice);\r
137       loadColour(choice);\r
138     }\r
139 \r
140   }\r
141 \r
142   void loadColour(String file)\r
143   {\r
144     try\r
145     {\r
146       BufferedReader in = new BufferedReader(new FileReader(file));\r
147       for (int i = 0; i < 24; i++)\r
148       {\r
149         JButton button = (JButton) buttonPanel.getComponent(i);\r
150         Color c = new Color(Integer.parseInt(in.readLine()));\r
151         button.setBackground(c);\r
152       }\r
153     }\r
154     catch (Exception ex)\r
155     {}\r
156 \r
157   }\r
158 \r
159   protected void savebutton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
160   {\r
161     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"));\r
162     chooser.setFileView(new jalview.io.JalviewFileView());\r
163     chooser.setDialogTitle("Save colour scheme");\r
164     chooser.setToolTipText("Save");\r
165     int value = chooser.showSaveDialog(this);\r
166     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
167     {\r
168       String choice = chooser.getSelectedFile().getPath();\r
169       jalview.bin.Cache.setProperty("USER_DEFINED_COLOUR", choice);\r
170 \r
171       try{\r
172         PrintWriter out = new PrintWriter(new FileWriter(choice));\r
173         for(int i=0; i<24; i++)\r
174         {\r
175           JButton button = (JButton)buttonPanel.getComponent(i);\r
176           out.println(button.getBackground().getRGB() + "");\r
177         }\r
178 \r
179         out.close();\r
180       }\r
181       catch(Exception ex)\r
182       {ex.printStackTrace();}\r
183     }\r
184 \r
185   }\r
186 \r
187   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
188   {\r
189     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme();\r
190     Color [] newColours = new Color[24];\r
191     for(int i=0; i<24; i++)\r
192     {\r
193           newColours[i] = (Color)oldColours.elementAt(i);\r
194           buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
195     }\r
196 \r
197     ucs.setColourScheme( newColours );\r
198     if (seqGroup != null)\r
199       seqGroup.cs = ucs;\r
200     else\r
201       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
202 \r
203     ap.RefreshPanels();\r
204 \r
205   }\r
206 \r
207 \r
208 }\r