JAL-2759 Rationalise VisibleColsIterator and HiddenColsIterator
[jalview.git] / src / jalview / gui / UserQuestionnaireCheck.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
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6  * 
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10  * of the License, or (at your option) any later version.
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15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.gui;
22
23 import jalview.util.MessageManager;
24
25 import java.io.BufferedReader;
26 import java.io.InputStreamReader;
27 import java.net.URL;
28
29 import javax.swing.JOptionPane;
30
31 public class UserQuestionnaireCheck implements Runnable
32 {
33   /**
34    * Implements the client side machinery for detecting a new questionnaire,
35    * checking if the user has responded to an existing one, and prompting the
36    * user for responding to a questionnaire. This is intended to work with the
37    * perl CGI scripts checkresponder.pl and questionnaire.pl
38    */
39   String url = null;
40
41   UserQuestionnaireCheck(String url)
42   {
43     if (url.indexOf("questionnaire.pl") == -1)
44     {
45       jalview.bin.Cache.log.error("'" + url
46               + "' is an Invalid URL for the checkForQuestionnaire() method.\n"
47               + "This argument is only for questionnaires derived from jalview's questionnaire.pl cgi interface.");
48     }
49     else
50     {
51       this.url = url;
52     }
53   }
54
55   String qid = null, rid = null;
56
57   private boolean checkresponse(URL qurl) throws Exception
58   {
59     jalview.bin.Cache.log.debug("Checking Response for : " + qurl);
60     boolean prompt = false;
61     // see if we have already responsed to this questionnaire or get a new
62     // qid/rid pair
63     BufferedReader br = new BufferedReader(
64             new InputStreamReader(qurl.openStream()));
65     String qresp;
66     while ((qresp = br.readLine()) != null)
67     {
68       if (qresp.indexOf("NOTYET:") == 0)
69       {
70         prompt = true; // not yet responded under that ID
71       }
72       else
73       {
74         if (qresp.indexOf("QUESTIONNAIRE:") == 0)
75         {
76           // QUESTIONNAIRE:qid:rid for the latest questionnaire.
77           int p = qresp.indexOf(':', 14);
78           if (p > -1)
79           {
80             rid = null;
81             qid = qresp.substring(14, p);
82             if (p < (qresp.length() - 1))
83             {
84               rid = qresp.substring(p + 1);
85               prompt = true; // this is a new qid/rid pair
86             }
87           }
88         }
89       }
90     }
91     return prompt;
92   }
93
94   public void run()
95   {
96     if (url == null)
97     {
98       return;
99     }
100     boolean prompt = false;
101     try
102     {
103       // First - check to see if wee have an old questionnaire/response id pair.
104       String lastq = jalview.bin.Cache.getProperty("QUESTIONNAIRE");
105       if (lastq == null)
106       {
107         prompt = checkresponse(new URL(url
108                 + (url.indexOf('?') > -1 ? "&" : "?") + "checkresponse=1"));
109       }
110       else
111       {
112         String qurl = url + (url.indexOf('?') > -1 ? "&" : "?")
113                 + "checkresponse=1";
114         // query the server with the old qid/id pair
115         String qqid = lastq.indexOf(':') > -1
116                 ? lastq.substring(0, lastq.indexOf(':'))
117                 : null;
118         if (qqid != null && qqid != "null" && qqid.length() > 0)
119         {
120           qurl += "&qid=" + qqid;
121           qid = qqid;
122           String qrid = lastq.substring(lastq.indexOf(':') + 1); // retrieve
123           // old rid
124           if (qrid != null && !qrid.equals("null"))
125           {
126             rid = qrid;
127             qurl += "&rid=" + qrid;
128           }
129         }
130         // see if we have already responsed to this questionnaire.
131         prompt = checkresponse(new URL(qurl));
132       }
133       if (qid != null && rid != null)
134       {
135         // Update our local property cache with latest qid and rid
136         jalview.bin.Cache.setProperty("QUESTIONNAIRE", qid + ":" + rid);
137       }
138       if (prompt)
139       {
140         String qurl = url + (url.indexOf('?') > -1 ? "&" : "?") + "qid="
141                 + qid + "&rid=" + rid;
142         jalview.bin.Cache.log
143                 .info("Prompting user for questionnaire at " + qurl);
144         int reply = JvOptionPane.showInternalConfirmDialog(Desktop.desktop,
145                 MessageManager.getString("label.jalview_new_questionnaire"),
146                 MessageManager.getString("label.jalview_user_survey"),
147                 JvOptionPane.YES_NO_OPTION, JvOptionPane.QUESTION_MESSAGE);
148
149         if (reply == JvOptionPane.YES_OPTION)
150         {
151           jalview.bin.Cache.log.debug("Opening " + qurl);
152           jalview.util.BrowserLauncher.openURL(qurl);
153         }
154       }
155     } catch (Exception e)
156     {
157       jalview.bin.Cache.log
158               .warn("When trying to access questionnaire URL " + url, e);
159     }
160   }
161
162 }