JAL-2994 put ‘\’ first in character class clause of regex - otherwise doesn’t compile...
[jalview.git] / src / jalview / io / DBRefFile.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
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8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
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13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.io;
22
23 import jalview.datamodel.SequenceI;
24
25 import java.io.IOException;
26
27 /**
28  * jalview flatfile for io of sequence ID mapping data
29  * DATABASE\t<nickname>\t<name>\t<version>... properties?jdbc, url, handler
30  * DBREF
31  * <seqID>\tDBID\taccno\t|seqstart,seqend,start,end...|\t|dbstart,dbend,...|
32  * 
33  */
34 public class DBRefFile extends AlignFile
35 {
36
37   @Override
38   public void parse() throws IOException
39   {
40     // TODO Auto-generated method stub
41
42   }
43
44   @Override
45   public String print(SequenceI[] sqs, boolean jvsuffix)
46   {
47     // TODO Auto-generated method stub
48     return null;
49   }
50
51 }