src/jalview/io/FileParse.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.io;
  22
  23 import java.io.BufferedInputStream;
  24 import java.io.BufferedReader;
  25 import java.io.ByteArrayInputStream;
  26 import java.io.File;
  27 import java.io.FileInputStream;
  28 import java.io.FileNotFoundException;
  29 import java.io.FileReader;
  30 import java.io.IOException;
  31 import java.io.InputStream;
  32 import java.io.InputStreamReader;
  33 import java.io.Reader;
  34 import java.io.StringReader;
  35 import java.net.HttpURLConnection;
  36 import java.net.MalformedURLException;
  37 import java.net.URL;
  38 import java.net.URLConnection;
  39 import java.net.UnknownHostException;
  40 import java.util.zip.GZIPInputStream;
  41
  42 import jalview.api.AlignExportSettingsI;
  43 import jalview.api.AlignViewportI;
  44 import jalview.api.AlignmentViewPanel;
  45 import jalview.api.FeatureSettingsModelI;
  46 import jalview.bin.Console;
  47 import jalview.util.HttpUtils;
  48 import jalview.util.MessageManager;
  49 import jalview.util.Platform;
  50
  51 /**
  52  * implements a random access wrapper around a particular datasource, for
  53  * passing to identifyFile and AlignFile objects.
  54  */
  55 public class FileParse
  56 {
  57   protected static final String SPACE = " ";
  58
  59   protected static final String TAB = "\t";
  60
  61   /**
  62    * text specifying source of data. usually filename or url.
  63    */
  64   private String dataName = "unknown source";
  65
  66   public File inFile = null;
  67
  68   private byte[] bytes; // from JavaScript
  69
  70   public byte[] getBytes()
  71   {
  72     return bytes;
  73   }
  74
  75   /**
  76    * a viewport associated with the current file operation. May be null. May
  77    * move to different object.
  78    */
  79   private AlignViewportI viewport;
  80
  81   /**
  82    * specific settings for exporting data from the current context
  83    */
  84   private AlignExportSettingsI exportSettings;
  85
  86   /**
  87    * sequence counter for FileParse object created from same data source
  88    */
  89   public int index = 1;
  90
  91   /**
  92    * separator for extracting specific 'frame' of a datasource for formats that
  93    * support multiple records (e.g. BLC, Stockholm, etc)
  94    */
  95   protected char suffixSeparator = '#';
  96
  97   /**
  98    * character used to write newlines
  99    */
 100   protected String newline = System.getProperty("line.separator");
 101
 102   public void setNewlineString(String nl)
 103   {
 104     newline = nl;
 105   }
 106
 107   public String getNewlineString()
 108   {
 109     return newline;
 110   }
 111
 112   /**
 113    * '#' separated string tagged on to end of filename or url that was clipped
 114    * off to resolve to valid filename
 115    */
 116   protected String suffix = null;
 117
 118   protected DataSourceType dataSourceType = null;
 119
 120   protected BufferedReader dataIn = null;
 121
 122   protected String errormessage = "UNINITIALISED SOURCE";
 123
 124   protected boolean error = true;
 125
 126   protected String warningMessage = null;
 127
 128   /**
 129    * size of readahead buffer used for when initial stream position is marked.
 130    */
 131   final int READAHEAD_LIMIT = 2048;
 132
 133   public FileParse()
 134   {
 135   }
 136
 137   /**
 138    * Create a new FileParse instance reading from the same datasource starting
 139    * at the current position. WARNING! Subsequent reads from either object will
 140    * affect the read position of the other, but not the error state.
 141    *
 142    * @param from
 143    */
 144   public FileParse(FileParse from) throws IOException
 145   {
 146     if (from == null)
 147     {
 148       throw new Error(MessageManager
 149               .getString("error.implementation_error_null_fileparse"));
 150     }
 151     if (from == this)
 152     {
 153       return;
 154     }
 155     index = ++from.index;
 156     inFile = from.inFile;
 157     suffixSeparator = from.suffixSeparator;
 158     suffix = from.suffix;
 159     errormessage = from.errormessage; // inherit potential error messages
 160     error = false; // reset any error condition.
 161     dataSourceType = from.dataSourceType;
 162     dataIn = from.dataIn;
 163     if (dataIn != null)
 164     {
 165       mark();
 166     }
 167     dataName = from.dataName;
 168   }
 169
 170   /**
 171    * Attempt to open a file as a datasource. Sets error and errormessage if
 172    * fileStr was invalid.
 173    *
 174    * @param fileStr
 175    * @return this.error (true if the source was invalid)
 176    */
 177   private boolean checkFileSource(String fileStr) throws IOException
 178   {
 179     error = false;
 180     this.inFile = new File(fileStr);
 181     // check to see if it's a Jar file in disguise.
 182     if (!inFile.exists())
 183     {
 184       errormessage = "FILE NOT FOUND";
 185       error = true;
 186     }
 187     if (!inFile.canRead())
 188     {
 189       errormessage = "FILE CANNOT BE OPENED FOR READING";
 190       error = true;
 191     }
 192     if (inFile.isDirectory())
 193     {
 194       // this is really a 'complex' filetype - but we don't handle directory
 195       // reads yet.
 196       errormessage = "FILE IS A DIRECTORY";
 197       error = true;
 198     }
 199     if (!error)
 200     {
 201       try
 202       {
 203         dataIn = checkForGzipStream(new FileInputStream(fileStr));
 204         dataName = fileStr;
 205       } catch (Exception x)
 206       {
 207         warningMessage = "Failed to resolve " + fileStr
 208                 + " as a data source. (" + x.getMessage() + ")";
 209         // x.printStackTrace();
 210         error = true;
 211       }
 212       ;
 213     }
 214     return error;
 215   }
 216
 217   /**
 218    * Recognise the 2-byte magic header for gzip streams
 219    *
 220    * https://recalll.co/ask/v/topic/java-How-to-check-if-InputStream-is-Gzipped/555aadd62bd27354438b90f6
 221    *
 222    * @param bytes
 223    *          - at least two bytes
 224    * @return
 225    * @throws IOException
 226    */
 227   public static boolean isGzipStream(InputStream input) throws IOException
 228   {
 229     if (!input.markSupported())
 230     {
 231       Console.error(
 232               "FileParse.izGzipStream: input stream must support mark/reset");
 233       return false;
 234     }
 235     input.mark(4);
 236
 237     // get first 2 bytes or return false
 238     byte[] bytes = new byte[2];
 239     int read = input.read(bytes);
 240     input.reset();
 241     if (read != bytes.length)
 242     {
 243       return false;
 244     }
 245
 246     int header = (bytes[0] & 0xff) | ((bytes[1] << 8) & 0xff00);
 247     return (GZIPInputStream.GZIP_MAGIC == header);
 248   }
 249
 250   /**
 251    * Returns a Reader for the given input after wrapping it in a buffered input
 252    * stream, and then checking if it needs to be wrapped by a GZipInputStream
 253    *
 254    * @param input
 255    * @return
 256    */
 257   private BufferedReader checkForGzipStream(InputStream input)
 258           throws Exception
 259   {
 260     // NB: stackoverflow
 261     // https://stackoverflow.com/questions/4818468/how-to-check-if-inputstream-is-gzipped
 262     // could use a PushBackInputStream rather than a BufferedInputStream
 263     if (!input.markSupported())
 264     {
 265       input = new BufferedInputStream(input, 16);
 266     }
 267     if (isGzipStream(input))
 268     {
 269       return getGzipReader(input);
 270     }
 271     // return a buffered reader for the stream.
 272     InputStreamReader isReader = new InputStreamReader(input);
 273     BufferedReader toReadFrom = new BufferedReader(isReader);
 274     return toReadFrom;
 275   }
 276
 277   /**
 278    * Returns a {@code BufferedReader} which wraps the input stream with a
 279    * GZIPInputStream. Throws a {@code ZipException} if a GZIP format error
 280    * occurs or the compression method used is unsupported.
 281    *
 282    * @param inputStream
 283    * @return
 284    * @throws Exception
 285    */
 286   private BufferedReader getGzipReader(InputStream inputStream)
 287           throws Exception
 288   {
 289     BufferedReader inData = new BufferedReader(
 290             new InputStreamReader(new GZIPInputStream(inputStream)));
 291     inData.mark(2048);
 292     inData.read();
 293     inData.reset();
 294     return inData;
 295   }
 296
 297   /**
 298    * Tries to read from the given URL. If successful, saves a reader to the
 299    * response in field {@code dataIn}, otherwise (on exception, or HTTP response
 300    * status not 200), throws an exception.
 301    * <p>
 302    * If the response status includes
 303    *
 304    * <pre>
 305    * Content-Type : application/x-gzip
 306    * </pre>
 307    *
 308    * then tries to read as gzipped content.
 309    *
 310    * @param urlStr
 311    * @throws IOException
 312    * @throws MalformedURLException
 313    */
 314   private void checkURLSource(String urlStr)
 315           throws IOException, MalformedURLException
 316   {
 317     errormessage = "URL NOT FOUND";
 318     URL url = new URL(urlStr);
 319     URLConnection _conn = HttpUtils.openConnection(url);
 320     if (_conn instanceof HttpURLConnection)
 321     {
 322       HttpURLConnection conn = HttpUtils
 323               .followConnection((HttpURLConnection) _conn);
 324       int rc = conn.getResponseCode();
 325       if (rc != HttpURLConnection.HTTP_OK)
 326       {
 327         throw new FileNotFoundException("Response status from " + urlStr
 328                 + " was " + conn.getResponseCode());
 329       }
 330       _conn = conn;
 331     }
 332     else
 333     {
 334       try
 335       {
 336         dataIn = checkForGzipStream(_conn.getInputStream());
 337         dataName = urlStr;
 338       } catch (IOException ex)
 339       {
 340         throw new IOException("Failed to handle non-HTTP URI stream", ex);
 341       } catch (Exception ex)
 342       {
 343         throw new IOException(
 344                 "Failed to determine type of input stream for given URI",
 345                 ex);
 346       }
 347       return;
 348     }
 349     String encoding = _conn.getContentEncoding();
 350     String contentType = _conn.getContentType();
 351     boolean isgzipped = "application/x-gzip".equalsIgnoreCase(contentType)
 352             || contentType.endsWith("gzip") || "gzip".equals(encoding);
 353     Exception e = null;
 354     InputStream inputStream = _conn.getInputStream();
 355     if (isgzipped)
 356     {
 357       try
 358       {
 359         dataIn = getGzipReader(inputStream);
 360         dataName = urlStr;
 361       } catch (Exception e1)
 362       {
 363         throw new IOException(MessageManager
 364                 .getString("exception.failed_to_resolve_gzip_stream"), e);
 365       }
 366       return;
 367     }
 368
 369     dataIn = new BufferedReader(new InputStreamReader(inputStream));
 370     dataName = urlStr;
 371     return;
 372   }
 373
 374   /**
 375    * sets the suffix string (if any) and returns remainder (if suffix was
 376    * detected)
 377    *
 378    * @param fileStr
 379    * @return truncated fileStr or null
 380    */
 381   private String extractSuffix(String fileStr)
 382   {
 383     // first check that there wasn't a suffix string tagged on.
 384     int sfpos = fileStr.lastIndexOf(suffixSeparator);
 385     if (sfpos > -1 && sfpos < fileStr.length() - 1)
 386     {
 387       suffix = fileStr.substring(sfpos + 1);
 388       // jalview.bin.Console.errPrintln("DEBUG: Found Suffix:"+suffix);
 389       return fileStr.substring(0, sfpos);
 390     }
 391     return null;
 392   }
 393
 394   /**
 395    * not for general use, creates a fileParse object for an existing reader with
 396    * configurable values for the origin and the type of the source
 397    */
 398   public FileParse(BufferedReader source, String originString,
 399           DataSourceType sourceType)
 400   {
 401     dataSourceType = sourceType;
 402     error = false;
 403     inFile = null;
 404     dataName = originString;
 405     dataIn = source;
 406     try
 407     {
 408       if (dataIn.markSupported())
 409       {
 410         dataIn.mark(READAHEAD_LIMIT);
 411       }
 412     } catch (IOException q)
 413     {
 414
 415     }
 416   }
 417
 418   /**
 419    * Create a datasource for input to Jalview. See AppletFormatAdapter for the
 420    * types of sources that are handled.
 421    *
 422    * @param file
 423    *          - datasource locator/content as File or String
 424    * @param sourceType
 425    *          - protocol of source
 426    * @throws MalformedURLException
 427    * @throws IOException
 428    */
 429   public FileParse(Object file, DataSourceType sourceType)
 430           throws MalformedURLException, FileNotFoundException, IOException
 431   {
 432     if (file instanceof File)
 433     {
 434       parse((File) file, ((File) file).getPath(), sourceType, true);
 435     }
 436     else
 437     {
 438       parse(null, file.toString(), sourceType, false);
 439     }
 440   }
 441
 442   private void parse(File file, String fileStr, DataSourceType sourceType,
 443           boolean isFileObject) throws FileNotFoundException, IOException
 444   {
 445     bytes = Platform.getFileBytes(file);
 446     dataSourceType = sourceType;
 447     error = false;
 448     boolean filenotfound = false;
 449
 450     if (sourceType == DataSourceType.FILE)
 451     {
 452
 453       if (bytes != null)
 454       {
 455         // this will be from JavaScript
 456         inFile = file;
 457         dataIn = new BufferedReader(
 458                 new InputStreamReader(new ByteArrayInputStream(bytes)));
 459         dataName = fileStr;
 460       }
 461       else if (checkFileSource(fileStr))
 462       {
 463         String suffixLess = extractSuffix(fileStr);
 464         if (suffixLess != null)
 465         {
 466           if (checkFileSource(suffixLess))
 467           {
 468             throw new IOException(MessageManager.formatMessage(
 469                     "exception.problem_opening_file_also_tried",
 470                     new String[]
 471                     { inFile.getName(), suffixLess, errormessage }));
 472           }
 473         }
 474         else
 475         {
 476           throw new IOException(MessageManager.formatMessage(
 477                   "exception.problem_opening_file", new String[]
 478                   { inFile.getName(), errormessage }));
 479         }
 480       }
 481     }
 482     else if (sourceType == DataSourceType.RELATIVE_URL)
 483     {
 484       // BH 2018 hack for no support for access-origin
 485       bytes = Platform.getFileAsBytes(fileStr);
 486       dataIn = new BufferedReader(
 487               new InputStreamReader(new ByteArrayInputStream(bytes)));
 488       dataName = fileStr;
 489
 490     }
 491     else if (sourceType == DataSourceType.URL)
 492     {
 493       try
 494       {
 495         try
 496         {
 497           checkURLSource(fileStr);
 498           if (suffixSeparator == '#')
 499           {
 500             extractSuffix(fileStr); // URL lref is stored for later reference.
 501           }
 502         } catch (IOException e)
 503         {
 504           String suffixLess = extractSuffix(fileStr);
 505           if (suffixLess == null)
 506           {
 507             if (e instanceof FileNotFoundException
 508                     || e instanceof UnknownHostException)
 509             {
 510               errormessage = "File at URL '" + fileStr + "' not found";
 511               filenotfound = true;
 512             }
 513             throw (e);
 514           }
 515           else
 516           {
 517             try
 518             {
 519               checkURLSource(suffixLess);
 520             } catch (IOException e2)
 521             {
 522               errormessage = "BAD URL WITH OR WITHOUT SUFFIX '" + fileStr
 523                       + "'";
 524               if (e instanceof FileNotFoundException)
 525               {
 526                 filenotfound = true;
 527               }
 528               throw (e); // just pass back original - everything was wrong.
 529             }
 530           }
 531         }
 532       } catch (Exception e)
 533       {
 534         errormessage = "CANNOT ACCESS DATA AT URL '" + fileStr + "' ("
 535                 + e.getMessage() + ")";
 536         error = true;
 537       }
 538     }
 539     else if (sourceType == DataSourceType.PASTE)
 540     {
 541       errormessage = "PASTE INACCESSIBLE!";
 542       dataIn = new BufferedReader(new StringReader(fileStr));
 543       dataName = "Paste";
 544     }
 545     else if (sourceType == DataSourceType.CLASSLOADER)
 546     {
 547       errormessage = "RESOURCE CANNOT BE LOCATED";
 548       InputStream is = getClass().getResourceAsStream("/" + fileStr);
 549       if (is == null)
 550       {
 551         String suffixLess = extractSuffix(fileStr);
 552         if (suffixLess != null)
 553         {
 554           is = getClass().getResourceAsStream("/" + suffixLess);
 555         }
 556       }
 557       if (is != null)
 558       {
 559         dataIn = new BufferedReader(new InputStreamReader(is));
 560         dataName = fileStr;
 561       }
 562       else
 563       {
 564         error = true;
 565       }
 566     }
 567     else
 568     {
 569       errormessage = "PROBABLE IMPLEMENTATION ERROR : Datasource Type given as '"
 570               + (sourceType != null ? sourceType : "null") + "'";
 571       error = true;
 572     }
 573     if (dataIn == null || error)
 574     {
 575       // pass up the reason why we have no source to read from
 576       if (filenotfound)
 577       {
 578         throw new FileNotFoundException(MessageManager
 579                 .formatMessage("label.url_not_found", new String[]
 580                 { errormessage }));
 581       }
 582       throw new IOException(MessageManager.formatMessage(
 583               "exception.failed_to_read_data_from_source", new String[]
 584               { errormessage }));
 585     }
 586     error = false;
 587     dataIn.mark(READAHEAD_LIMIT);
 588   }
 589
 590   /**
 591    * mark the current position in the source as start for the purposes of it
 592    * being analysed by IdentifyFile().identify
 593    *
 594    * @throws IOException
 595    */
 596   public void mark() throws IOException
 597   {
 598     if (dataIn != null)
 599     {
 600       dataIn.mark(READAHEAD_LIMIT);
 601     }
 602     else
 603     {
 604       throw new IOException(
 605               MessageManager.getString("exception.no_init_source_stream"));
 606     }
 607   }
 608
 609   public String nextLine() throws IOException
 610   {
 611     if (!error)
 612     {
 613       return dataIn.readLine();
 614     }
 615     throw new IOException(MessageManager
 616             .formatMessage("exception.invalid_source_stream", new String[]
 617             { errormessage }));
 618   }
 619
 620   /**
 621    *
 622    * @return true if this FileParse is configured for Export only
 623    */
 624   public boolean isExporting()
 625   {
 626     return !error && dataIn == null;
 627   }
 628
 629   /**
 630    *
 631    * @return true if the data source is valid
 632    */
 633   public boolean isValid()
 634   {
 635     return !error;
 636   }
 637
 638   /**
 639    * closes the datasource and tidies up. source will be left in an error state
 640    */
 641   public void close() throws IOException
 642   {
 643     errormessage = "EXCEPTION ON CLOSE";
 644     error = true;
 645     dataIn.close();
 646     dataIn = null;
 647     errormessage = "SOURCE IS CLOSED";
 648   }
 649
 650   /**
 651    * Rewinds the datasource to the marked point if possible
 652    *
 653    * @param bytesRead
 654    *
 655    */
 656   public void reset(int bytesRead) throws IOException
 657   {
 658     if (bytesRead >= READAHEAD_LIMIT)
 659     {
 660       jalview.bin.Console.errPrintln(String.format(
 661               "File reset error: read %d bytes but reset limit is %d",
 662               bytesRead, READAHEAD_LIMIT));
 663     }
 664     if (dataIn != null && !error)
 665     {
 666       dataIn.reset();
 667     }
 668     else
 669     {
 670       throw new IOException(MessageManager.getString(
 671               "error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source"));
 672     }
 673   }
 674
 675   /**
 676    *
 677    * @return true if there is a warning for the user
 678    */
 679   public boolean hasWarningMessage()
 680   {
 681     return (warningMessage != null && warningMessage.length() > 0);
 682   }
 683
 684   /**
 685    *
 686    * @return empty string or warning message about file that was just parsed.
 687    */
 688   public String getWarningMessage()
 689   {
 690     return warningMessage;
 691   }
 692
 693   public String getInFile()
 694   {
 695     if (inFile != null)
 696     {
 697       return inFile.getAbsolutePath() + " (" + index + ")";
 698     }
 699     else
 700     {
 701       return "From Paste + (" + index + ")";
 702     }
 703   }
 704
 705   /**
 706    * @return the dataName
 707    */
 708   public String getDataName()
 709   {
 710     return dataName;
 711   }
 712
 713   /**
 714    * set the (human readable) name or URI for this datasource
 715    *
 716    * @param dataname
 717    */
 718   protected void setDataName(String dataname)
 719   {
 720     dataName = dataname;
 721   }
 722
 723   /**
 724    * get the underlying bufferedReader for this data source.
 725    *
 726    * @return null if no reader available
 727    * @throws IOException
 728    */
 729   public Reader getReader()
 730   {
 731     if (dataIn != null) // Probably don't need to test for readiness &&
 732                         // dataIn.ready())
 733     {
 734       return dataIn;
 735     }
 736     return null;
 737   }
 738
 739   public AlignViewportI getViewport()
 740   {
 741     return viewport;
 742   }
 743
 744   public void setViewport(AlignViewportI viewport)
 745   {
 746     this.viewport = viewport;
 747   }
 748
 749   /**
 750    * @return the currently configured exportSettings for writing data.
 751    */
 752   public AlignExportSettingsI getExportSettings()
 753   {
 754     return exportSettings;
 755   }
 756
 757   /**
 758    * Set configuration for export of data.
 759    *
 760    * @param exportSettings
 761    *          the exportSettings to set
 762    */
 763   public void setExportSettings(AlignExportSettingsI exportSettings)
 764   {
 765     this.exportSettings = exportSettings;
 766   }
 767
 768   /**
 769    * method overridden by complex file exporter/importers which support
 770    * exporting visualisation and layout settings for a view
 771    *
 772    * @param avpanel
 773    */
 774   public void configureForView(AlignmentViewPanel avpanel)
 775   {
 776     if (avpanel != null)
 777     {
 778       setViewport(avpanel.getAlignViewport());
 779     }
 780     // could also set export/import settings
 781   }
 782
 783   /**
 784    * Returns the preferred feature colour configuration if there is one, else
 785    * null
 786    *
 787    * @return
 788    */
 789   public FeatureSettingsModelI getFeatureColourScheme()
 790   {
 791     return null;
 792   }
 793
 794   public DataSourceType getDataSourceType()
 795   {
 796     return dataSourceType;
 797   }
 798
 799   /**
 800    * Returns a buffered reader for the input object. Returns null, or throws
 801    * IOException, on failure.
 802    *
 803    * @param file
 804    *          a File, or a String which is a name of a file
 805    * @param sourceType
 806    * @return
 807    * @throws IOException
 808    */
 809   public BufferedReader getBufferedReader(Object file,
 810           DataSourceType sourceType) throws IOException
 811   {
 812     BufferedReader in = null;
 813     byte[] bytes;
 814
 815     switch (sourceType)
 816     {
 817     case FILE:
 818       if (file instanceof String)
 819       {
 820         return new BufferedReader(new FileReader((String) file));
 821       }
 822       bytes = Platform.getFileBytes((File) file);
 823       if (bytes != null)
 824       {
 825         return new BufferedReader(
 826                 new InputStreamReader(new ByteArrayInputStream(bytes)));
 827       }
 828       return new BufferedReader(new FileReader((File) file));
 829     case URL:
 830       URL url = new URL(file.toString());
 831       in = new BufferedReader(
 832               new InputStreamReader(HttpUtils.openStream(url)));
 833       break;
 834     case RELATIVE_URL: // JalviewJS only
 835       bytes = Platform.getFileAsBytes(file.toString());
 836       if (bytes != null)
 837       {
 838         in = new BufferedReader(
 839                 new InputStreamReader(new ByteArrayInputStream(bytes)));
 840       }
 841       break;
 842     case PASTE:
 843       in = new BufferedReader(new StringReader(file.toString()));
 844       break;
 845     case CLASSLOADER:
 846       InputStream is = getClass().getResourceAsStream("/" + file);
 847       if (is != null)
 848       {
 849         in = new BufferedReader(new InputStreamReader(is));
 850       }
 851       break;
 852     }
 853
 854     return in;
 855   }
 856 }