src/jalview/io/FileParse.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.io;\r
  20 \r
  21 import java.io.*;\r
  22 import java.net.*;\r
  23 \r
  24 public class FileParse\r
  25 {\r
  26   public File inFile;\r
  27   protected String type;\r
  28   protected BufferedReader dataIn;\r
  29 \r
  30   public FileParse()\r
  31   {\r
  32   }\r
  33 \r
  34   public FileParse(String fileStr, String type)\r
  35       throws MalformedURLException, IOException\r
  36   {\r
  37     this.type = type;\r
  38 \r
  39     if (type.equals(AppletFormatAdapter.FILE))\r
  40     {\r
  41       this.inFile = new File(fileStr);\r
  42       dataIn = new BufferedReader(new FileReader(fileStr));\r
  43     }\r
  44     else if (type.equals(AppletFormatAdapter.URL))\r
  45     {\r
  46       URL url = new URL(fileStr);\r
  47       dataIn = new BufferedReader(new InputStreamReader(url.openStream()));\r
  48     }\r
  49    else if (type.equals(AppletFormatAdapter.PASTE))\r
  50     {\r
  51       dataIn = new BufferedReader(new StringReader(fileStr));\r
  52     }\r
  53     else if (type.equals(AppletFormatAdapter.CLASSLOADER))\r
  54     {\r
  55       java.io.InputStream is = getClass().getResourceAsStream("/" + fileStr);\r
  56       if (is != null)\r
  57       {\r
  58         dataIn = new BufferedReader(new java.io.InputStreamReader(is));\r
  59       }\r
  60     }\r
  61   }\r
  62 \r
  63   public String nextLine()\r
  64       throws IOException\r
  65   {\r
  66     return dataIn.readLine();\r
  67   }\r
  68 }\r