src/jalview/io/FileParse.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.io;\r
  20 \r
  21 import java.io.*;\r
  22 import java.net.*;\r
  23 \r
  24 public class FileParse\r
  25 {\r
  26   public File inFile;\r
  27   public int fileSize;\r
  28   public int noLines;\r
  29   protected String type;\r
  30   protected BufferedReader dataIn;\r
  31 \r
  32   public FileParse()\r
  33   {\r
  34   }\r
  35 \r
  36   public FileParse(String fileStr, String type)\r
  37       throws MalformedURLException, IOException\r
  38   {\r
  39     this.type = type;\r
  40 \r
  41     if (type.equals("File"))\r
  42     {\r
  43       this.inFile = new File(fileStr);\r
  44       this.fileSize = (int) inFile.length();\r
  45 \r
  46       dataIn = new BufferedReader(new FileReader(fileStr));\r
  47     }\r
  48     else if (type.equals("URL"))\r
  49     {\r
  50       URL url = new URL(fileStr);\r
  51       this.fileSize = 0;\r
  52       dataIn = new BufferedReader(new InputStreamReader(url.openStream()));\r
  53     }\r
  54     else if (type.equals("Paste"))\r
  55     {\r
  56       dataIn = new BufferedReader(new StringReader(fileStr));\r
  57     }\r
  58   }\r
  59 \r
  60   public String nextLine()\r
  61       throws IOException\r
  62   {\r
  63     String next = dataIn.readLine();\r
  64 \r
  65     if (next != null)\r
  66     {\r
  67       noLines++;\r
  68     }\r
  69 \r
  70     return next;\r
  71   }\r
  72 }\r