After merge
[jalview.git] / src / jalview / io / FileParse.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  *\r
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
9  *\r
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
13  * GNU General Public License for more details.\r
14  *\r
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
18  */\r
19 package jalview.io;\r
20 \r
21 import java.io.*;\r
22 import java.net.*;\r
23 \r
24 public class FileParse\r
25 {\r
26   public File inFile;\r
27   public int fileSize;\r
28   public int noLines;\r
29   protected String type;\r
30   protected BufferedReader dataIn;\r
31 \r
32   public FileParse()\r
33   {\r
34   }\r
35 \r
36   public FileParse(String fileStr, String type)\r
37       throws MalformedURLException, IOException\r
38   {\r
39     this.type = type;\r
40 \r
41     if (type.equals("File"))\r
42     {\r
43       this.inFile = new File(fileStr);\r
44       this.fileSize = (int) inFile.length();\r
45 \r
46       dataIn = new BufferedReader(new FileReader(fileStr));\r
47     }\r
48     else if (type.equals("URL"))\r
49     {\r
50       URL url = new URL(fileStr);\r
51       this.fileSize = 0;\r
52       dataIn = new BufferedReader(new InputStreamReader(url.openStream()));\r
53     }\r
54     else if (type.equals("Paste"))\r
55     {\r
56       dataIn = new BufferedReader(new StringReader(fileStr));\r
57     }\r
58   }\r
59 \r
60   public String nextLine()\r
61       throws IOException\r
62   {\r
63     String next = dataIn.readLine();\r
64 \r
65     if (next != null)\r
66     {\r
67       noLines++;\r
68     }\r
69 \r
70     return next;\r
71   }\r
72 }\r