src/jalview/io/FileParse.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
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   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.io;
  20
  21 import java.io.*;
  22 import java.net.*;
  23
  24 public class FileParse
  25 {
  26   public File inFile;
  27   protected String type;
  28   protected BufferedReader dataIn;
  29
  30   public FileParse()
  31   {
  32   }
  33
  34   public FileParse(String fileStr, String type)
  35       throws MalformedURLException, IOException
  36   {
  37     this.type = type;
  38
  39     if (type.equals(AppletFormatAdapter.FILE))
  40     {
  41       this.inFile = new File(fileStr);
  42       dataIn = new BufferedReader(new FileReader(fileStr));
  43     }
  44     else if (type.equals(AppletFormatAdapter.URL))
  45     {
  46       URL url = new URL(fileStr);
  47       dataIn = new BufferedReader(new InputStreamReader(url.openStream()));
  48     }
  49    else if (type.equals(AppletFormatAdapter.PASTE))
  50     {
  51       dataIn = new BufferedReader(new StringReader(fileStr));
  52     }
  53     else if (type.equals(AppletFormatAdapter.CLASSLOADER))
  54     {
  55       java.io.InputStream is = getClass().getResourceAsStream("/" + fileStr);
  56       if (is != null)
  57       {
  58         dataIn = new BufferedReader(new java.io.InputStreamReader(is));
  59       }
  60     }
  61   }
  62
  63   public String nextLine()
  64       throws IOException
  65   {
  66     return dataIn.readLine();
  67   }
  68 }