src/jalview/io/JalviewFileView.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.io;
  20
  21 import java.io.*;
  22 import java.util.*;
  23
  24 import javax.swing.*;
  25 import javax.swing.filechooser.*;
  26
  27 public class JalviewFileView
  28     extends FileView
  29 {
  30   static Hashtable alignSuffix = new Hashtable();
  31
  32   static
  33   {
  34     alignSuffix.put("fasta", "Fasta file");
  35     alignSuffix.put("fa", "Fasta file");
  36     alignSuffix.put("fastq", "Fasta file");
  37     alignSuffix.put("blc", "BLC file");
  38     alignSuffix.put("msf", "MSF file");
  39     alignSuffix.put("pfam", "PFAM file");
  40     alignSuffix.put("aln", "Clustal file");
  41     alignSuffix.put("pir", "PIR file");
  42     alignSuffix.put("jar", "Jalview file");
  43   }
  44
  45   public String getTypeDescription(File f)
  46   {
  47     String extension = getExtension(f);
  48     String type = null;
  49
  50     if (extension != null)
  51     {
  52       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  53       {
  54         type = alignSuffix.get(extension).toString();
  55       }
  56     }
  57
  58     return type;
  59   }
  60
  61   public Icon getIcon(File f)
  62   {
  63     String extension = getExtension(f);
  64     Icon icon = null;
  65
  66     if (extension != null)
  67     {
  68       if (alignSuffix.containsKey(extension))
  69       {
  70         icon = createImageIcon("/images/file.png");
  71       }
  72     }
  73
  74     return icon;
  75   }
  76
  77   /*
  78    * Get the extension of a file.
  79    */
  80   public static String getExtension(File f)
  81   {
  82     String ext = null;
  83     String s = f.getName();
  84     int i = s.lastIndexOf('.');
  85
  86     if ( (i > 0) && (i < (s.length() - 1)))
  87     {
  88       ext = s.substring(i + 1).toLowerCase();
  89     }
  90
  91     return ext;
  92   }
  93
  94   /** Returns an ImageIcon, or null if the path was invalid. */
  95   protected static ImageIcon createImageIcon(String path)
  96   {
  97     java.net.URL imgURL = JalviewFileView.class.getResource(path);
  98
  99     if (imgURL != null)
 100     {
 101       return new ImageIcon(imgURL);
 102     }
 103     else
 104     {
 105       System.err.println(
 106           "JalviewFileView.createImageIcon: Couldn't find file: " + path);
 107
 108       return null;
 109     }
 110   }
 111 }