src/jalview/io/gff/SequenceOntologyFactory.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
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  11  *
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  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.io.gff;
  22
  23 /**
  24  * A factory class that returns a model of the Sequence Ontology. By default a
  25  * hard-coded subset is used (for the applet, or testing), or setInstance() can
  26  * be used to set full Ontology data.
  27  *
  28  * @author gmcarstairs
  29  *
  30  */
  31 public class SequenceOntologyFactory
  32 {
  33   private static SequenceOntologyI instance;
  34
  35   public static synchronized SequenceOntologyI getInstance()
  36   {
  37     if (instance == null)
  38     {
  39       instance = new SequenceOntologyLite();
  40     }
  41     return instance;
  42   }
  43
  44   public static void setInstance(SequenceOntologyI so)
  45   {
  46     instance = so;
  47   }
  48 }