JAL-2629 add hmmbuild validation check which also gets the HMMER version
[jalview.git] / src / jalview / io / packed / SimpleDataProvider.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.io.packed;
22
23 import jalview.io.FileParse;
24
25 /**
26  * minimal implementation of the DataProvider interface. Allows a FileParse
27  * datasource to be specified as one of the DataProvider.JvDataType content
28  * types, with or without some other associated object as external reference.
29  */
30 public class SimpleDataProvider implements DataProvider
31 {
32   DataProvider.JvDataType jvtype;
33
34   FileParse source;
35
36   Object assocseq;
37
38   /**
39    * create a SimpleDataProvider
40    * 
41    * @param type
42    *          - contents of resource accessible via fp
43    * @param fp
44    *          - datasource
45    * @param assoc
46    *          - external object that fp's content should be associated with (may
47    *          be null)
48    */
49   public SimpleDataProvider(DataProvider.JvDataType type, FileParse fp,
50           Object assoc)
51   {
52     jvtype = type;
53     source = fp;
54     assocseq = assoc;
55   }
56
57   @Override
58   public FileParse getDataSource()
59   {
60     return source;
61   }
62
63   @Override
64   public Object getSequenceTarget()
65   {
66     return assocseq;
67   }
68
69   @Override
70   public DataProvider.JvDataType getType()
71   {
72     return jvtype;
73   }
74
75 }