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[jalview.git] / src / jalview / javascript / JsSelectionSender.java
1 /*******************************************************************************
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
4  *
5  * This file is part of Jalview.
6  *
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
10  *
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
15  *
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
17  *******************************************************************************/
18 package jalview.javascript;
19
20 import java.net.URL;
21 import jalview.appletgui.AlignFrame;
22 import jalview.appletgui.AlignViewport;
23 import jalview.bin.JalviewLite;
24 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
25 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
26 import jalview.structure.SelectionSource;
27 import netscape.javascript.JSObject;
28
29 public class JsSelectionSender extends JSFunctionExec implements
30         jalview.structure.SelectionListener, JsCallBack
31 {
32
33   AlignFrame _af;
34
35   String _listener;
36
37   public JsSelectionSender(JalviewLite jvlite, AlignFrame af,
38           String listener)
39   {
40     super(jvlite);
41     _af = af;
42     _listener = listener;
43   }
44
45   @Override
46   public void selection(SequenceGroup seqsel, ColumnSelection colsel,
47           SelectionSource source)
48   {
49     // System.err.println("Testing selection event relay to jsfunction:"+_listener);
50     try
51     {
52       String setid = "";
53       String viewid = "";
54       AlignFrame src = _af;
55       if (source != null)
56       {
57         if (source instanceof jalview.appletgui.AlignViewport
58                 && ((jalview.appletgui.AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame.viewport == source)
59         {
60           // should be valid if it just generated an event!
61           src = ((jalview.appletgui.AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame;
62
63         }
64       }
65       String[] seqs = new String[]
66       {};
67       String[] cols = new String[]
68       {};
69       int strt = 0, end = (src == null) ? -1 : src.alignPanel.av
70               .getAlignment().getWidth();
71       if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
72       {
73         seqs = new String[seqsel.getSize()];
74         for (int i = 0; i < seqs.length; i++)
75         {
76           seqs[i] = seqsel.getSequenceAt(i).getName();
77         }
78         if (strt < seqsel.getStartRes())
79         {
80           strt = seqsel.getStartRes();
81         }
82         if (end==-1 || end > seqsel.getEndRes())
83         {
84           end = seqsel.getEndRes();
85         }
86       }
87       if (colsel != null && colsel.size() > 0)
88       {
89         if (end == -1)
90         {
91           end = colsel.getMax() + 1;
92         }
93         cols = new String[colsel.getSelected().size()];
94         int d = 0, r = -1;
95         for (int i = 0; i < cols.length; i++)
96         {
97           cols[i] = ""
98                   + (1 + ((Integer) colsel.getSelected().elementAt(i))
99                           .intValue());
100         }
101       }
102       else
103       {
104         if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
105         {
106           // send a valid range, otherwise we send the empty selection
107           cols = new String[2];
108           cols[0] = "" + (1 + strt) + "-" + (1 + end);
109         }
110         ;
111
112       }
113       System.err.println("Relaying selection to jsfunction:" + _listener);
114       executeJavascriptFunction( _listener,
115                 new Object[]
116                 { src, setid, jvlite.arrayToSeparatorList(seqs),
117                     jvlite.arrayToSeparatorList(cols) });
118     } catch (Exception ex)
119     {
120       System.err
121               .println("Jalview Javascript exec error: Couldn't send selection message using function '"
122                       + _listener + "'");
123       ex.printStackTrace();
124       if (ex instanceof netscape.javascript.JSException)
125       {
126         System.err.println("Javascript Exception: "
127                 + ((netscape.javascript.JSException) ex).getCause()
128                         .toString());
129       }
130
131     }
132   }
133
134
135   @Override
136   public AlignFrame getAlignFrame()
137   {
138     return _af;
139   }
140
141   @Override
142   public String getListenerFunction()
143   {
144     return _listener;
145   }
146
147 }