src/jalview/javascript/JsSelectionSender.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
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  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.javascript;
  22
  23 import jalview.appletgui.AlignFrame;
  24 import jalview.bin.JalviewLite;
  25 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
  26 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
  27 import jalview.structure.SelectionSource;
  28
  29 public class JsSelectionSender extends JSFunctionExec implements
  30         jalview.structure.SelectionListener, JsCallBack
  31 {
  32
  33   AlignFrame _af;
  34
  35   String _listener;
  36
  37   public JsSelectionSender(JalviewLite jvlite, AlignFrame af,
  38           String listener)
  39   {
  40     super(jvlite);
  41     _af = af;
  42     _listener = listener;
  43   }
  44
  45   @Override
  46   public void selection(SequenceGroup seqsel, ColumnSelection colsel,
  47           SelectionSource source)
  48   {
  49     // System.err.println("Testing selection event relay to jsfunction:"+_listener);
  50     try
  51     {
  52       String setid = "";
  53       AlignFrame src = _af;
  54       if (source != null)
  55       {
  56         if (source instanceof jalview.appletgui.AlignViewport
  57                 && ((jalview.appletgui.AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame.viewport == source)
  58         {
  59           // should be valid if it just generated an event!
  60           src = ((jalview.appletgui.AlignViewport) source).applet.currentAlignFrame;
  61
  62         }
  63       }
  64       String[] seqs = new String[] {};
  65       String[] cols = new String[] {};
  66       int strt = 0, end = (src == null) ? -1 : src.alignPanel.av
  67               .getAlignment().getWidth();
  68       if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
  69       {
  70         seqs = new String[seqsel.getSize()];
  71         for (int i = 0; i < seqs.length; i++)
  72         {
  73           seqs[i] = seqsel.getSequenceAt(i).getName();
  74         }
  75         if (strt < seqsel.getStartRes())
  76         {
  77           strt = seqsel.getStartRes();
  78         }
  79         if (end == -1 || end > seqsel.getEndRes())
  80         {
  81           end = seqsel.getEndRes();
  82         }
  83       }
  84       if (colsel != null && !colsel.isEmpty())
  85       {
  86         if (end == -1)
  87         {
  88           end = colsel.getMax() + 1;
  89         }
  90         cols = new String[colsel.getSelected().size()];
  91         for (int i = 0; i < cols.length; i++)
  92         {
  93           cols[i] = "" + (1 + colsel.getSelected().get(i).intValue());
  94         }
  95       }
  96       else
  97       {
  98         if (seqsel != null && seqsel.getSize() > 0)
  99         {
 100           // send a valid range, otherwise we send the empty selection
 101           cols = new String[2];
 102           cols[0] = "" + (1 + strt) + "-" + (1 + end);
 103         }
 104         ;
 105
 106       }
 107       System.err.println("Relaying selection to jsfunction:" + _listener);
 108       executeJavascriptFunction(_listener,
 109               new Object[] { src, setid, jvlite.arrayToSeparatorList(seqs),
 110                   jvlite.arrayToSeparatorList(cols) });
 111     } catch (Exception ex)
 112     {
 113       System.err
 114               .println("Jalview Javascript exec error: Couldn't send selection message using function '"
 115                       + _listener + "'");
 116       ex.printStackTrace();
 117       if (ex instanceof netscape.javascript.JSException)
 118       {
 119         System.err.println("Javascript Exception: "
 120                 + ((netscape.javascript.JSException) ex).getCause()
 121                         .toString());
 122       }
 123
 124     }
 125   }
 126
 127   @Override
 128   public AlignFrame getAlignFrame()
 129   {
 130     return _af;
 131   }
 132
 133   @Override
 134   public String getListenerFunction()
 135   {
 136     return _listener;
 137   }
 138
 139 }