added help and documentation for annotation editing.
[jalview.git] / src / jalview / jbgui / GFinder.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  *\r
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
9  *\r
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
13  * GNU General Public License for more details.\r
14  *\r
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
18  */\r
19 package jalview.jbgui;\r
20 \r
21 import java.awt.*;\r
22 import java.awt.event.*;\r
23 import javax.swing.*;\r
24 import javax.swing.event.*;\r
25 \r
26 public class GFinder\r
27     extends JPanel\r
28 {\r
29   JLabel jLabel1 = new JLabel();\r
30   protected JButton findAll = new JButton();\r
31   protected JButton findNext = new JButton();\r
32   JPanel jPanel1 = new JPanel();\r
33   GridLayout gridLayout1 = new GridLayout();\r
34   protected JButton createNewGroup = new JButton();\r
35   JScrollPane jScrollPane1 = new JScrollPane();\r
36   protected JTextArea textfield = new JTextArea();\r
37   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();\r
38   JPanel jPanel2 = new JPanel();\r
39   JPanel jPanel3 = new JPanel();\r
40   JPanel jPanel4 = new JPanel();\r
41   BorderLayout borderLayout2 = new BorderLayout();\r
42   JPanel jPanel5 = new JPanel();\r
43   JPanel jPanel6 = new JPanel();\r
44   public GFinder()\r
45   {\r
46     try\r
47     {\r
48       jbInit();\r
49     }\r
50     catch (Exception e)\r
51     {\r
52       e.printStackTrace();\r
53     }\r
54   }\r
55 \r
56   private void jbInit()\r
57       throws Exception\r
58   {\r
59     jLabel1.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));\r
60     jLabel1.setText("Find");\r
61     this.setLayout(borderLayout1);\r
62     findAll.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));\r
63     findAll.setText("Find all");\r
64     findAll.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
65     {\r
66       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
67       {\r
68         findAll_actionPerformed(e);\r
69       }\r
70     });\r
71     findNext.setEnabled(false);\r
72     findNext.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));\r
73     findNext.setText("Find Next");\r
74     findNext.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
75     {\r
76       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
77       {\r
78         findNext_actionPerformed(e);\r
79       }\r
80     });\r
81     jPanel1.setLayout(gridLayout1);\r
82     gridLayout1.setHgap(0);\r
83     gridLayout1.setRows(3);\r
84     gridLayout1.setVgap(2);\r
85     createNewGroup.setEnabled(false);\r
86     createNewGroup.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));\r
87     createNewGroup.setToolTipText("");\r
88     createNewGroup.setMargin(new Insets(0, 0, 0, 0));\r
89     createNewGroup.setText("Create new group");\r
90     createNewGroup.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
91     {\r
92       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
93       {\r
94         createNewGroup_actionPerformed(e);\r
95       }\r
96     });\r
97     textfield.setFont(new java.awt.Font("Verdana", Font.PLAIN, 12));\r
98     textfield.setText("");\r
99     textfield.setLineWrap(true);\r
100     textfield.addCaretListener(new CaretListener()\r
101     {\r
102       public void caretUpdate(CaretEvent e)\r
103       {\r
104         textfield_caretUpdate(e);\r
105       }\r
106     });\r
107     borderLayout1.setHgap(5);\r
108     borderLayout1.setVgap(5);\r
109     jPanel4.setLayout(borderLayout2);\r
110     jPanel2.setPreferredSize(new Dimension(10, 1));\r
111     jPanel3.setPreferredSize(new Dimension(10, 1));\r
112     jPanel1.add(findNext, null);\r
113     jPanel1.add(findAll, null);\r
114     jPanel1.add(createNewGroup, null);\r
115     this.add(jLabel1, java.awt.BorderLayout.WEST);\r
116     this.add(jPanel1, java.awt.BorderLayout.EAST);\r
117     this.add(jPanel2, java.awt.BorderLayout.SOUTH);\r
118     this.add(jPanel3, java.awt.BorderLayout.NORTH);\r
119     this.add(jPanel4, java.awt.BorderLayout.CENTER);\r
120     jPanel4.add(jScrollPane1, java.awt.BorderLayout.CENTER);\r
121     jPanel4.add(jPanel5, java.awt.BorderLayout.SOUTH);\r
122     jPanel4.add(jPanel6, java.awt.BorderLayout.NORTH);\r
123     jScrollPane1.getViewport().add(textfield);\r
124   }\r
125 \r
126   protected void findNext_actionPerformed(ActionEvent e)\r
127   {\r
128   }\r
129 \r
130   protected void findAll_actionPerformed(ActionEvent e)\r
131   {\r
132   }\r
133 \r
134   protected void textfield_actionPerformed(ActionEvent e)\r
135   {\r
136   }\r
137 \r
138   void textfield_keyTyped(KeyEvent e)\r
139   {\r
140     findNext.setEnabled(true);\r
141   }\r
142 \r
143   public void createNewGroup_actionPerformed(ActionEvent e)\r
144   {\r
145   }\r
146 \r
147   public void textfield_caretUpdate(CaretEvent e)\r
148   {\r
149     if (textfield.getText().indexOf("\t") > -1)\r
150     {\r
151       SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
152       {\r
153         public void run()\r
154         {\r
155           String text = textfield.getText();\r
156           text = text.substring(text.lastIndexOf("\t") + 1).trim();\r
157           text = jalview.analysis.AlignSeq.extractGaps(\r
158               jalview.util.Comparison.GapChars, text);\r
159           textfield.setText(text);\r
160         }\r
161       });\r
162     }\r
163   }\r
164 }\r