src/jalview/jbgui/GPCAPanel.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.jbgui;
  22
  23 import java.awt.BorderLayout;
  24 import java.awt.Color;
  25 import java.awt.FlowLayout;
  26 import java.awt.Font;
  27 import java.awt.GridLayout;
  28 import java.awt.event.ActionEvent;
  29 import java.awt.event.ActionListener;
  30
  31 import javax.swing.JButton;
  32 import javax.swing.JCheckBoxMenuItem;
  33 import javax.swing.JComboBox;
  34 import javax.swing.JInternalFrame;
  35 import javax.swing.JLabel;
  36 import javax.swing.JMenu;
  37 import javax.swing.JMenuBar;
  38 import javax.swing.JMenuItem;
  39 import javax.swing.JPanel;
  40 import javax.swing.event.MenuEvent;
  41 import javax.swing.event.MenuListener;
  42
  43 import jalview.util.ImageMaker.TYPE;
  44 import jalview.util.MessageManager;
  45
  46 public class GPCAPanel extends JInternalFrame
  47 {
  48   private static final Font VERDANA_12 = new Font("Verdana", 0, 12);
  49
  50   protected JComboBox<String> xCombobox = new JComboBox<>();
  51
  52   protected JComboBox<String> yCombobox = new JComboBox<>();
  53
  54   protected JComboBox<String> zCombobox = new JComboBox<>();
  55
  56   protected JMenu viewMenu = new JMenu();
  57
  58   protected JCheckBoxMenuItem showLabels = new JCheckBoxMenuItem();
  59
  60   protected JMenu associateViewsMenu = new JMenu();
  61
  62   protected JLabel statusBar = new JLabel();
  63
  64   protected JPanel statusPanel = new JPanel();
  65
  66   protected JMenuItem originalSeqData;
  67
  68   /**
  69    * Constructor
  70    */
  71   public GPCAPanel()
  72   {
  73     try
  74     {
  75       jbInit();
  76     } catch (Exception e)
  77     {
  78       e.printStackTrace();
  79     }
  80
  81     for (int i = 1; i < 8; i++)
  82     {
  83       xCombobox.addItem("dim " + i);
  84       yCombobox.addItem("dim " + i);
  85       zCombobox.addItem("dim " + i);
  86     }
  87   }
  88
  89   private void jbInit() throws Exception
  90   {
  91     setFrameIcon(null);
  92     setName("jalview-pca");
  93     this.getContentPane().setLayout(new BorderLayout());
  94     JPanel jPanel2 = new JPanel();
  95     jPanel2.setLayout(new FlowLayout());
  96     JLabel jLabel1 = new JLabel();
  97     jLabel1.setFont(VERDANA_12);
  98     jLabel1.setText("x=");
  99     JLabel jLabel2 = new JLabel();
 100     jLabel2.setFont(VERDANA_12);
 101     jLabel2.setText("y=");
 102     JLabel jLabel3 = new JLabel();
 103     jLabel3.setFont(VERDANA_12);
 104     jLabel3.setText("z=");
 105     jPanel2.setBackground(Color.white);
 106     jPanel2.setBorder(null);
 107     zCombobox.setFont(VERDANA_12);
 108     zCombobox.addActionListener(new ActionListener()
 109     {
 110       @Override
 111       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 112       {
 113         doDimensionChange();
 114       }
 115     });
 116     yCombobox.setFont(VERDANA_12);
 117     yCombobox.addActionListener(new ActionListener()
 118     {
 119       @Override
 120       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 121       {
 122         doDimensionChange();
 123       }
 124     });
 125     xCombobox.setFont(VERDANA_12);
 126     xCombobox.addActionListener(new ActionListener()
 127     {
 128       @Override
 129       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 130       {
 131         doDimensionChange();
 132       }
 133     });
 134     JButton resetButton = new JButton();
 135     resetButton.setFont(VERDANA_12);
 136     resetButton.setText(MessageManager.getString("action.reset"));
 137     resetButton.addActionListener(new ActionListener()
 138     {
 139       @Override
 140       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 141       {
 142         resetButton_actionPerformed();
 143       }
 144     });
 145     JMenu fileMenu = new JMenu();
 146     fileMenu.setText(MessageManager.getString("action.file"));
 147     JMenu saveMenu = new JMenu();
 148     saveMenu.setText(MessageManager.getString("action.save_as"));
 149     JMenuItem eps = new JMenuItem("EPS");
 150     eps.addActionListener(new ActionListener()
 151     {
 152       @Override
 153       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 154       {
 155         makePCAImage(TYPE.EPS);
 156       }
 157     });
 158     JMenuItem png = new JMenuItem("PNG");
 159     png.addActionListener(new ActionListener()
 160     {
 161       @Override
 162       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 163       {
 164         makePCAImage(TYPE.PNG);
 165       }
 166     });
 167     JMenuItem outputValues = new JMenuItem();
 168     outputValues.setText(MessageManager.getString("label.output_values"));
 169     outputValues.addActionListener(new ActionListener()
 170     {
 171       @Override
 172       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 173       {
 174         outputValues_actionPerformed();
 175       }
 176     });
 177     JMenuItem outputPoints = new JMenuItem();
 178     outputPoints.setText(MessageManager.getString("label.output_points"));
 179     outputPoints.addActionListener(new ActionListener()
 180     {
 181       @Override
 182       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 183       {
 184         outputPoints_actionPerformed();
 185       }
 186     });
 187     JMenuItem outputProjPoints = new JMenuItem();
 188     outputProjPoints.setText(
 189             MessageManager.getString("label.output_transformed_points"));
 190     outputProjPoints.addActionListener(new ActionListener()
 191     {
 192       @Override
 193       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 194       {
 195         outputProjPoints_actionPerformed();
 196       }
 197     });
 198     JMenuItem print = new JMenuItem();
 199     print.setText(MessageManager.getString("action.print"));
 200     print.addActionListener(new ActionListener()
 201     {
 202       @Override
 203       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 204       {
 205         print_actionPerformed();
 206       }
 207     });
 208     viewMenu.setText(MessageManager.getString("action.view"));
 209     viewMenu.addMenuListener(new MenuListener()
 210     {
 211       @Override
 212       public void menuSelected(MenuEvent e)
 213       {
 214         viewMenu_menuSelected();
 215       }
 216
 217       @Override
 218       public void menuDeselected(MenuEvent e)
 219       {
 220       }
 221
 222       @Override
 223       public void menuCanceled(MenuEvent e)
 224       {
 225       }
 226     });
 227     showLabels.setText(MessageManager.getString("label.show_labels"));
 228     showLabels.addActionListener(new ActionListener()
 229     {
 230       @Override
 231       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 232       {
 233         showLabels_actionPerformed();
 234       }
 235     });
 236     JMenuItem bgcolour = new JMenuItem();
 237     bgcolour.setText(MessageManager.getString("action.background_colour"));
 238     bgcolour.addActionListener(new ActionListener()
 239     {
 240       @Override
 241       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 242       {
 243         bgcolour_actionPerformed();
 244       }
 245     });
 246     originalSeqData = new JMenuItem();
 247     originalSeqData.setText(MessageManager.getString("label.input_data"));
 248     originalSeqData.addActionListener(new ActionListener()
 249     {
 250       @Override
 251       public void actionPerformed(ActionEvent e)
 252       {
 253         originalSeqData_actionPerformed();
 254       }
 255     });
 256     associateViewsMenu.setText(
 257             MessageManager.getString("label.associate_nodes_with"));
 258
 259     statusPanel.setLayout(new GridLayout());
 260     statusBar.setFont(VERDANA_12);
 261     // statusPanel.setBackground(Color.lightGray);
 262     // statusBar.setBackground(Color.lightGray);
 263     // statusPanel.add(statusBar, null);
 264     JPanel panelBar = new JPanel(new BorderLayout());
 265     panelBar.add(jPanel2, BorderLayout.NORTH);
 266     panelBar.add(statusPanel, BorderLayout.SOUTH);
 267     this.getContentPane().add(panelBar, BorderLayout.SOUTH);
 268     jPanel2.add(jLabel1, null);
 269     jPanel2.add(xCombobox, null);
 270     jPanel2.add(jLabel2, null);
 271     jPanel2.add(yCombobox, null);
 272     jPanel2.add(jLabel3, null);
 273     jPanel2.add(zCombobox, null);
 274     jPanel2.add(resetButton, null);
 275
 276     JMenuBar jMenuBar1 = new JMenuBar();
 277     jMenuBar1.add(fileMenu);
 278     jMenuBar1.add(viewMenu);
 279     setJMenuBar(jMenuBar1);
 280     fileMenu.add(saveMenu);
 281     fileMenu.add(outputValues);
 282     fileMenu.add(print);
 283     fileMenu.add(originalSeqData);
 284     fileMenu.add(outputPoints);
 285     fileMenu.add(outputProjPoints);
 286     saveMenu.add(eps);
 287     saveMenu.add(png);
 288     viewMenu.add(showLabels);
 289     viewMenu.add(bgcolour);
 290     viewMenu.add(associateViewsMenu);
 291   }
 292
 293   protected void resetButton_actionPerformed()
 294   {
 295   }
 296
 297   protected void outputPoints_actionPerformed()
 298   {
 299   }
 300
 301   protected void outputProjPoints_actionPerformed()
 302   {
 303   }
 304
 305   public void makePCAImage(TYPE imageType)
 306   {
 307   }
 308
 309   protected void outputValues_actionPerformed()
 310   {
 311   }
 312
 313   protected void print_actionPerformed()
 314   {
 315   }
 316
 317   protected void showLabels_actionPerformed()
 318   {
 319   }
 320
 321   protected void bgcolour_actionPerformed()
 322   {
 323   }
 324
 325   protected void originalSeqData_actionPerformed()
 326   {
 327   }
 328
 329   protected void viewMenu_menuSelected()
 330   {
 331   }
 332
 333   protected void doDimensionChange()
 334   {
 335   }
 336 }