formatting
[jalview.git] / src / jalview / jbgui / GTreePanel.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
10  * 
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
15  * 
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
17  */
18 package jalview.jbgui;
19
20 import java.awt.*;
21 import java.awt.event.*;
22 import javax.swing.*;
23 import javax.swing.event.*;
24
25 public class GTreePanel extends JInternalFrame
26 {
27   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();
28
29   public JScrollPane scrollPane = new JScrollPane();
30
31   JMenuBar jMenuBar1 = new JMenuBar();
32
33   JMenu fileMenu = new JMenu();
34
35   JMenuItem saveAsNewick = new JMenuItem();
36
37   JMenuItem printMenu = new JMenuItem();
38
39   protected JMenu viewMenu = new JMenu();
40
41   public JMenuItem font = new JMenuItem();
42
43   public JMenuItem sortAssocViews = new JMenuItem();
44
45   public JCheckBoxMenuItem bootstrapMenu = new JCheckBoxMenuItem();
46
47   public JCheckBoxMenuItem distanceMenu = new JCheckBoxMenuItem();
48
49   public JCheckBoxMenuItem fitToWindow = new JCheckBoxMenuItem();
50
51   public JCheckBoxMenuItem placeholdersMenu = new JCheckBoxMenuItem();
52
53   JMenuItem pngTree = new JMenuItem();
54
55   JMenuItem epsTree = new JMenuItem();
56
57   JMenu saveAsMenu = new JMenu();
58
59   JMenuItem textbox = new JMenuItem();
60
61   public JMenuItem originalSeqData = new JMenuItem();
62
63   protected JMenu associateLeavesMenu = new JMenu();
64
65   public GTreePanel()
66   {
67     try
68     {
69       jbInit();
70       this.setJMenuBar(jMenuBar1);
71     } catch (Exception e)
72     {
73       e.printStackTrace();
74     }
75   }
76
77   private void jbInit() throws Exception
78   {
79     this.getContentPane().setLayout(borderLayout1);
80     this.setBackground(Color.white);
81     this.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));
82     scrollPane.setOpaque(false);
83     fileMenu.setText("File");
84     saveAsNewick.setText("Newick Format");
85     saveAsNewick.addActionListener(new ActionListener()
86     {
87       public void actionPerformed(ActionEvent e)
88       {
89         saveAsNewick_actionPerformed(e);
90       }
91     });
92     printMenu.setText("Print");
93     printMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
94     {
95       public void actionPerformed(ActionEvent e)
96       {
97         printMenu_actionPerformed(e);
98       }
99     });
100     viewMenu.setText("View");
101     viewMenu.addMenuListener(new MenuListener()
102     {
103       public void menuSelected(MenuEvent e)
104       {
105         viewMenu_menuSelected();
106       }
107
108       public void menuDeselected(MenuEvent e)
109       {
110       }
111
112       public void menuCanceled(MenuEvent e)
113       {
114       }
115     });
116     sortAssocViews.setText("Sort Alignment By Tree");
117     sortAssocViews.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
118     {
119       public void actionPerformed(ActionEvent e)
120       {
121         sortByTree_actionPerformed(e);
122       }
123     });
124     font.setText("Font...");
125     font.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
126     {
127       public void actionPerformed(ActionEvent e)
128       {
129         font_actionPerformed(e);
130       }
131     });
132     bootstrapMenu.setText("Show Bootstrap Values");
133     bootstrapMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
134     {
135       public void actionPerformed(ActionEvent e)
136       {
137         bootstrapMenu_actionPerformed(e);
138       }
139     });
140     distanceMenu.setText("Show Distances");
141     distanceMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
142     {
143       public void actionPerformed(ActionEvent e)
144       {
145         distanceMenu_actionPerformed(e);
146       }
147     });
148     fitToWindow.setSelected(true);
149     fitToWindow.setText("Fit To Window");
150     fitToWindow.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
151     {
152       public void actionPerformed(ActionEvent e)
153       {
154         fitToWindow_actionPerformed(e);
155       }
156     });
157     epsTree.setText("EPS");
158     epsTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
159     {
160       public void actionPerformed(ActionEvent e)
161       {
162         epsTree_actionPerformed(e);
163       }
164     });
165     pngTree.setText("PNG");
166     pngTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
167     {
168       public void actionPerformed(ActionEvent e)
169       {
170         pngTree_actionPerformed(e);
171       }
172     });
173     saveAsMenu.setText("Save as");
174     placeholdersMenu
175             .setToolTipText("Marks leaves of tree not associated with a sequence");
176     placeholdersMenu.setText("Mark Unlinked Leaves");
177     placeholdersMenu.addActionListener(new ActionListener()
178     {
179       public void actionPerformed(ActionEvent e)
180       {
181         placeholdersMenu_actionPerformed(e);
182       }
183     });
184     textbox.setText("Output to Textbox...");
185     textbox.addActionListener(new ActionListener()
186     {
187       public void actionPerformed(ActionEvent e)
188       {
189         textbox_actionPerformed(e);
190       }
191     });
192     originalSeqData.setText("Input Data...");
193     originalSeqData.addActionListener(new ActionListener()
194     {
195       public void actionPerformed(ActionEvent e)
196       {
197         originalSeqData_actionPerformed(e);
198       }
199     });
200     associateLeavesMenu.setText("Associate Leaves With");
201     this.getContentPane().add(scrollPane, BorderLayout.CENTER);
202     jMenuBar1.add(fileMenu);
203     jMenuBar1.add(viewMenu);
204     fileMenu.add(saveAsMenu);
205     fileMenu.add(textbox);
206     fileMenu.add(printMenu);
207     fileMenu.add(originalSeqData);
208     viewMenu.add(fitToWindow);
209     viewMenu.add(font);
210     viewMenu.add(distanceMenu);
211     viewMenu.add(bootstrapMenu);
212     viewMenu.add(placeholdersMenu);
213     viewMenu.add(sortAssocViews);
214     viewMenu.add(associateLeavesMenu);
215     saveAsMenu.add(saveAsNewick);
216     saveAsMenu.add(epsTree);
217     saveAsMenu.add(pngTree);
218   }
219
220   public void printMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
221   {
222   }
223
224   public void font_actionPerformed(ActionEvent e)
225   {
226   }
227
228   public void distanceMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
229   {
230   }
231
232   public void bootstrapMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
233   {
234   }
235
236   public void fitToWindow_actionPerformed(ActionEvent e)
237   {
238   }
239
240   public void pngTree_actionPerformed(ActionEvent e)
241   {
242   }
243
244   public void epsTree_actionPerformed(ActionEvent e)
245   {
246   }
247
248   public void saveAsNewick_actionPerformed(ActionEvent e)
249   {
250   }
251
252   public void placeholdersMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
253   {
254   }
255
256   public void textbox_actionPerformed(ActionEvent e)
257   {
258   }
259
260   public void fullid_actionPerformed(ActionEvent e)
261   {
262
263   }
264
265   public void originalSeqData_actionPerformed(ActionEvent e)
266   {
267
268   }
269
270   public void viewMenu_menuSelected()
271   {
272   }
273   public void sortByTree_actionPerformed(ActionEvent e)
274   {
275
276   }
277
278 }