src/jalview/jbgui/GTreePanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.jbgui;\r
  20 \r
  21 import java.awt.*;\r
  22 import java.awt.event.*;\r
  23 import javax.swing.*;\r
  24 \r
  25 public class GTreePanel\r
  26     extends JInternalFrame\r
  27 {\r
  28   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();\r
  29   public JScrollPane scrollPane = new JScrollPane();\r
  30   JMenuBar jMenuBar1 = new JMenuBar();\r
  31   JMenu jMenu1 = new JMenu();\r
  32   JMenuItem saveAsNewick = new JMenuItem();\r
  33   JMenuItem printMenu = new JMenuItem();\r
  34   JMenu jMenu2 = new JMenu();\r
  35   public JMenuItem font = new JMenuItem();\r
  36   public JCheckBoxMenuItem bootstrapMenu = new JCheckBoxMenuItem();\r
  37   public JCheckBoxMenuItem distanceMenu = new JCheckBoxMenuItem();\r
  38   public JCheckBoxMenuItem fitToWindow = new JCheckBoxMenuItem();\r
  39   public JCheckBoxMenuItem placeholdersMenu = new JCheckBoxMenuItem();\r
  40   JMenuItem pngTree = new JMenuItem();\r
  41   JMenuItem epsTree = new JMenuItem();\r
  42   JMenu saveAsMenu = new JMenu();\r
  43   JMenuItem textbox = new JMenuItem();\r
  44   JMenuItem originalSeqData = new JMenuItem();\r
  45   public GTreePanel()\r
  46   {\r
  47     try\r
  48     {\r
  49       jbInit();\r
  50       this.setJMenuBar(jMenuBar1);\r
  51     }\r
  52     catch (Exception e)\r
  53     {\r
  54       e.printStackTrace();\r
  55     }\r
  56   }\r
  57 \r
  58   private void jbInit()\r
  59       throws Exception\r
  60   {\r
  61     this.getContentPane().setLayout(borderLayout1);\r
  62     this.setBackground(Color.white);\r
  63     this.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));\r
  64     scrollPane.setOpaque(false);\r
  65     jMenu1.setText("File");\r
  66     saveAsNewick.setText("Newick Format");\r
  67     saveAsNewick.addActionListener(new ActionListener()\r
  68     {\r
  69       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  70       {\r
  71         saveAsNewick_actionPerformed(e);\r
  72       }\r
  73     });\r
  74     printMenu.setText("Print");\r
  75     printMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
  76     {\r
  77       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  78       {\r
  79         printMenu_actionPerformed(e);\r
  80       }\r
  81     });\r
  82     jMenu2.setText("View");\r
  83     font.setText("Font...");\r
  84     font.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
  85     {\r
  86       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  87       {\r
  88         font_actionPerformed(e);\r
  89       }\r
  90     });\r
  91     bootstrapMenu.setText("Show Bootstrap Values");\r
  92     bootstrapMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
  93     {\r
  94       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  95       {\r
  96         bootstrapMenu_actionPerformed(e);\r
  97       }\r
  98     });\r
  99     distanceMenu.setText("Show Distances");\r
 100     distanceMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 101     {\r
 102       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 103       {\r
 104         distanceMenu_actionPerformed(e);\r
 105       }\r
 106     });\r
 107     fitToWindow.setSelected(true);\r
 108     fitToWindow.setText("Fit To Window");\r
 109     fitToWindow.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 110     {\r
 111       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 112       {\r
 113         fitToWindow_actionPerformed(e);\r
 114       }\r
 115     });\r
 116     epsTree.setText("EPS");\r
 117     epsTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 118     {\r
 119       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 120       {\r
 121         epsTree_actionPerformed(e);\r
 122       }\r
 123     });\r
 124     pngTree.setText("PNG");\r
 125     pngTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 126     {\r
 127       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 128       {\r
 129         pngTree_actionPerformed(e);\r
 130       }\r
 131     });\r
 132     saveAsMenu.setText("Save as");\r
 133     placeholdersMenu.setToolTipText(\r
 134         "Marks leaves of tree not associated with a sequence");\r
 135     placeholdersMenu.setText("Mark Unlinked Leaves");\r
 136     placeholdersMenu.addActionListener(new ActionListener()\r
 137     {\r
 138       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 139       {\r
 140         placeholdersMenu_actionPerformed(e);\r
 141       }\r
 142     });\r
 143     textbox.setText("Output to Textbox...");\r
 144     textbox.addActionListener(new ActionListener()\r
 145     {\r
 146       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 147       {\r
 148         textbox_actionPerformed(e);\r
 149       }\r
 150     });\r
 151     originalSeqData.setText("Tree was made from this...");\r
 152     originalSeqData.addActionListener(new ActionListener()\r
 153     {\r
 154       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 155       {\r
 156         originalSeqData_actionPerformed(e);\r
 157       }\r
 158     });\r
 159     this.getContentPane().add(scrollPane, BorderLayout.CENTER);\r
 160     jMenuBar1.add(jMenu1);\r
 161     jMenuBar1.add(jMenu2);\r
 162     jMenu1.add(saveAsMenu);\r
 163     jMenu1.add(textbox);\r
 164     jMenu1.add(printMenu);\r
 165     jMenu1.add(originalSeqData);\r
 166     jMenu2.add(fitToWindow);\r
 167     jMenu2.add(font);\r
 168     jMenu2.add(distanceMenu);\r
 169     jMenu2.add(bootstrapMenu);\r
 170     jMenu2.add(placeholdersMenu);\r
 171     saveAsMenu.add(saveAsNewick);\r
 172     saveAsMenu.add(epsTree);\r
 173     saveAsMenu.add(pngTree);\r
 174   }\r
 175 \r
 176   public void printMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 177   {\r
 178   }\r
 179 \r
 180   public void font_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 181   {\r
 182   }\r
 183 \r
 184   public void distanceMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 185   {\r
 186   }\r
 187 \r
 188   public void bootstrapMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 189   {\r
 190   }\r
 191 \r
 192   public void fitToWindow_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 193   {\r
 194   }\r
 195 \r
 196   public void pngTree_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 197   {\r
 198   }\r
 199 \r
 200   public void epsTree_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 201   {\r
 202   }\r
 203 \r
 204   public void saveAsNewick_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 205   {\r
 206   }\r
 207 \r
 208   public void placeholdersMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 209   {\r
 210   }\r
 211 \r
 212   public void textbox_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 213   {\r
 214   }\r
 215 \r
 216   public void fullid_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 217   {\r
 218 \r
 219   }\r
 220 \r
 221   public void originalSeqData_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 222   {\r
 223 \r
 224   }\r
 225 }\r