src/jalview/jbgui/GTreePanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.jbgui;\r
  20 \r
  21 import java.awt.*;\r
  22 import java.awt.event.*;\r
  23 import javax.swing.*;\r
  24 import javax.swing.event.MenuListener;\r
  25 import javax.swing.event.MenuEvent;\r
  26 \r
  27 public class GTreePanel\r
  28     extends JInternalFrame\r
  29 {\r
  30   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();\r
  31   public JScrollPane scrollPane = new JScrollPane();\r
  32   JMenuBar jMenuBar1 = new JMenuBar();\r
  33   JMenu fileMenu = new JMenu();\r
  34   JMenuItem saveAsNewick = new JMenuItem();\r
  35   JMenuItem printMenu = new JMenuItem();\r
  36   protected JMenu viewMenu = new JMenu();\r
  37   public JMenuItem font = new JMenuItem();\r
  38   public JCheckBoxMenuItem bootstrapMenu = new JCheckBoxMenuItem();\r
  39   public JCheckBoxMenuItem distanceMenu = new JCheckBoxMenuItem();\r
  40   public JCheckBoxMenuItem fitToWindow = new JCheckBoxMenuItem();\r
  41   public JCheckBoxMenuItem placeholdersMenu = new JCheckBoxMenuItem();\r
  42   JMenuItem pngTree = new JMenuItem();\r
  43   JMenuItem epsTree = new JMenuItem();\r
  44   JMenu saveAsMenu = new JMenu();\r
  45   JMenuItem textbox = new JMenuItem();\r
  46   public JMenuItem originalSeqData = new JMenuItem();\r
  47   protected JMenu associateLeavesMenu = new JMenu();\r
  48   public GTreePanel()\r
  49   {\r
  50     try\r
  51     {\r
  52       jbInit();\r
  53       this.setJMenuBar(jMenuBar1);\r
  54     }\r
  55     catch (Exception e)\r
  56     {\r
  57       e.printStackTrace();\r
  58     }\r
  59   }\r
  60 \r
  61   private void jbInit()\r
  62       throws Exception\r
  63   {\r
  64     this.getContentPane().setLayout(borderLayout1);\r
  65     this.setBackground(Color.white);\r
  66     this.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 12));\r
  67     scrollPane.setOpaque(false);\r
  68     fileMenu.setText("File");\r
  69     saveAsNewick.setText("Newick Format");\r
  70     saveAsNewick.addActionListener(new ActionListener()\r
  71     {\r
  72       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  73       {\r
  74         saveAsNewick_actionPerformed(e);\r
  75       }\r
  76     });\r
  77     printMenu.setText("Print");\r
  78     printMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
  79     {\r
  80       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  81       {\r
  82         printMenu_actionPerformed(e);\r
  83       }\r
  84     });\r
  85     viewMenu.setText("View");\r
  86     viewMenu.addMenuListener(new MenuListener()\r
  87     {\r
  88       public void menuSelected(MenuEvent e)\r
  89       {\r
  90         viewMenu_menuSelected();\r
  91       }\r
  92 \r
  93       public void menuDeselected(MenuEvent e)\r
  94       {\r
  95       }\r
  96 \r
  97       public void menuCanceled(MenuEvent e)\r
  98       {\r
  99       }\r
 100     });\r
 101     font.setText("Font...");\r
 102     font.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 103     {\r
 104       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 105       {\r
 106         font_actionPerformed(e);\r
 107       }\r
 108     });\r
 109     bootstrapMenu.setText("Show Bootstrap Values");\r
 110     bootstrapMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 111     {\r
 112       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 113       {\r
 114         bootstrapMenu_actionPerformed(e);\r
 115       }\r
 116     });\r
 117     distanceMenu.setText("Show Distances");\r
 118     distanceMenu.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 119     {\r
 120       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 121       {\r
 122         distanceMenu_actionPerformed(e);\r
 123       }\r
 124     });\r
 125     fitToWindow.setSelected(true);\r
 126     fitToWindow.setText("Fit To Window");\r
 127     fitToWindow.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 128     {\r
 129       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 130       {\r
 131         fitToWindow_actionPerformed(e);\r
 132       }\r
 133     });\r
 134     epsTree.setText("EPS");\r
 135     epsTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 136     {\r
 137       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 138       {\r
 139         epsTree_actionPerformed(e);\r
 140       }\r
 141     });\r
 142     pngTree.setText("PNG");\r
 143     pngTree.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
 144     {\r
 145       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 146       {\r
 147         pngTree_actionPerformed(e);\r
 148       }\r
 149     });\r
 150     saveAsMenu.setText("Save as");\r
 151     placeholdersMenu.setToolTipText(\r
 152         "Marks leaves of tree not associated with a sequence");\r
 153     placeholdersMenu.setText("Mark Unlinked Leaves");\r
 154     placeholdersMenu.addActionListener(new ActionListener()\r
 155     {\r
 156       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 157       {\r
 158         placeholdersMenu_actionPerformed(e);\r
 159       }\r
 160     });\r
 161     textbox.setText("Output to Textbox...");\r
 162     textbox.addActionListener(new ActionListener()\r
 163     {\r
 164       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 165       {\r
 166         textbox_actionPerformed(e);\r
 167       }\r
 168     });\r
 169     originalSeqData.setText("Input Data...");\r
 170     originalSeqData.addActionListener(new ActionListener()\r
 171     {\r
 172       public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 173       {\r
 174         originalSeqData_actionPerformed(e);\r
 175       }\r
 176     });\r
 177     associateLeavesMenu.setText("Associate Leaves With");\r
 178     this.getContentPane().add(scrollPane, BorderLayout.CENTER);\r
 179     jMenuBar1.add(fileMenu);\r
 180     jMenuBar1.add(viewMenu);\r
 181     fileMenu.add(saveAsMenu);\r
 182     fileMenu.add(textbox);\r
 183     fileMenu.add(printMenu);\r
 184     fileMenu.add(originalSeqData);\r
 185     viewMenu.add(fitToWindow);\r
 186     viewMenu.add(font);\r
 187     viewMenu.add(distanceMenu);\r
 188     viewMenu.add(bootstrapMenu);\r
 189     viewMenu.add(placeholdersMenu);\r
 190     viewMenu.add(associateLeavesMenu);\r
 191     saveAsMenu.add(saveAsNewick);\r
 192     saveAsMenu.add(epsTree);\r
 193     saveAsMenu.add(pngTree);\r
 194   }\r
 195 \r
 196   public void printMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 197   {\r
 198   }\r
 199 \r
 200   public void font_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 201   {\r
 202   }\r
 203 \r
 204   public void distanceMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 205   {\r
 206   }\r
 207 \r
 208   public void bootstrapMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 209   {\r
 210   }\r
 211 \r
 212   public void fitToWindow_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 213   {\r
 214   }\r
 215 \r
 216   public void pngTree_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 217   {\r
 218   }\r
 219 \r
 220   public void epsTree_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 221   {\r
 222   }\r
 223 \r
 224   public void saveAsNewick_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 225   {\r
 226   }\r
 227 \r
 228   public void placeholdersMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 229   {\r
 230   }\r
 231 \r
 232   public void textbox_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 233   {\r
 234   }\r
 235 \r
 236   public void fullid_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 237   {\r
 238 \r
 239   }\r
 240 \r
 241   public void originalSeqData_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 242   {\r
 243 \r
 244   }\r
 245 \r
 246   public void viewMenu_menuSelected()\r
 247   {\r
 248   }\r
 249 }\r