src/jalview/rest/FetchSequenceEndpoint.java

   1 package jalview.rest;
   2
   3 import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
   4 import javax.servlet.http.HttpServletResponse;
   5
   6 import jalview.gui.Desktop;
   7 import jalview.gui.SequenceFetcher;
   8 import jalview.util.DBRefUtils;
   9
  10 public class FetchSequenceEndpoint extends EndpointAsync
  11 {
  12   protected String name = "fetchsequence";
  13
  14   @Override
  15   protected void initialise(HttpServletRequest request,
  16           HttpServletResponse response)
  17   {
  18     // note that endpointName should always be "fetchsequence"
  19
  20     String[] parameters = getEndpointPathParameters(request);
  21
  22     // check we can run fetchsequence
  23     if (parameters.length < 2)
  24     {
  25       returnError(request, response,
  26               "requires 2 path parameters: dbname, ids");
  27       return;
  28     }
  29
  30     String dbName = parameters[0];
  31     String dbId = parameters[1];
  32
  33     setId(request, dbName + "::" + dbId);
  34     if (checkStatus(request, response))
  35       return;
  36
  37     String db = DBRefUtils.getCanonicalName(dbName);
  38     Desktop desktop = Desktop.instance;
  39     SequenceFetcher sf = new SequenceFetcher(desktop, db, dbId);
  40     setCompletableFuture(sf.ok_actionPerformed(true));
  41   }
  42
  43   protected void process(HttpServletRequest request,
  44           HttpServletResponse response)
  45   {
  46     // all the work being done by the SequenceFetcher!
  47   }
  48 }