src/jalview/rest/HighlightSequenceEndpoint.java

   1 package jalview.rest;
   2
   3 import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
   4 import javax.servlet.http.HttpServletResponse;
   5
   6 public class HighlightSequenceEndpoint extends Endpoint
   7 {
   8   public HighlightSequenceEndpoint(API api)
   9   {
  10     super(api, name);
  11   }
  12
  13   protected static final String name = "highlight";
  14
  15   public void processEndpoint(HttpServletRequest request,
  16           HttpServletResponse response)
  17   {
  18     String[] parameters = getEndpointPathParameters(request);
  19
  20     // check we can run highlight
  21     if (parameters.length < 1)
  22     {
  23       returnError(request, response, "requires 1 path parameters: ranges");
  24       return;
  25     }
  26
  27     String rangesString = parameters[0];
  28     String[] rangeStrings = rangesString.split(",");
  29     int[][] ranges = new int[rangeStrings.length][2];
  30     for (int i = 0; i < rangeStrings.length; i++)
  31     {
  32       String range = rangeStrings[i];
  33       try
  34       {
  35         int hyphenpos = range.indexOf('-');
  36         if (hyphenpos < 0)
  37         {
  38           ranges[i][0] = Integer.parseInt(range);
  39           ranges[i][1] = ranges[i][0];
  40         }
  41         else
  42         {
  43           ranges[i][0] = Integer.parseInt(range.substring(0, hyphenpos));
  44           ranges[i][1] = Integer.parseInt(range.substring(hyphenpos));
  45         }
  46       } catch (NumberFormatException nfe)
  47       {
  48         returnError(request, response,
  49                 "couldn't parse ranges component '" + range + "'");
  50         return;
  51       }
  52     }
  53
  54   }
  55 }