src/jalview/schemabinding/version2/Alcodon.java

   1 /*
   2  * This class was automatically generated with
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
   4  * Schema.
   5  * $Id$
   6  */
   7
   8 package jalview.schemabinding.version2;
   9
  10 //---------------------------------/
  11 //- Imported classes and packages -/
  12 //---------------------------------/
  13
  14 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  15 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  16
  17 /**
  18  * Class Alcodon.
  19  *
  20  * @version $Revision$ $Date$
  21  */
  22 public class Alcodon implements java.io.Serializable
  23 {
  24
  25   // --------------------------/
  26   // - Class/Member Variables -/
  27   // --------------------------/
  28
  29   /**
  30    * Field _pos1.
  31    */
  32   private long _pos1;
  33
  34   /**
  35    * keeps track of state for field: _pos1
  36    */
  37   private boolean _has_pos1;
  38
  39   /**
  40    * Field _pos2.
  41    */
  42   private long _pos2;
  43
  44   /**
  45    * keeps track of state for field: _pos2
  46    */
  47   private boolean _has_pos2;
  48
  49   /**
  50    * Field _pos3.
  51    */
  52   private long _pos3;
  53
  54   /**
  55    * keeps track of state for field: _pos3
  56    */
  57   private boolean _has_pos3;
  58
  59   // ----------------/
  60   // - Constructors -/
  61   // ----------------/
  62
  63   public Alcodon()
  64   {
  65     super();
  66   }
  67
  68   // -----------/
  69   // - Methods -/
  70   // -----------/
  71
  72   /**
  73      */
  74   public void deletePos1()
  75   {
  76     this._has_pos1 = false;
  77   }
  78
  79   /**
  80      */
  81   public void deletePos2()
  82   {
  83     this._has_pos2 = false;
  84   }
  85
  86   /**
  87      */
  88   public void deletePos3()
  89   {
  90     this._has_pos3 = false;
  91   }
  92
  93   /**
  94    * Returns the value of field 'pos1'.
  95    *
  96    * @return the value of field 'Pos1'.
  97    */
  98   public long getPos1()
  99   {
 100     return this._pos1;
 101   }
 102
 103   /**
 104    * Returns the value of field 'pos2'.
 105    *
 106    * @return the value of field 'Pos2'.
 107    */
 108   public long getPos2()
 109   {
 110     return this._pos2;
 111   }
 112
 113   /**
 114    * Returns the value of field 'pos3'.
 115    *
 116    * @return the value of field 'Pos3'.
 117    */
 118   public long getPos3()
 119   {
 120     return this._pos3;
 121   }
 122
 123   /**
 124    * Method hasPos1.
 125    *
 126    * @return true if at least one Pos1 has been added
 127    */
 128   public boolean hasPos1()
 129   {
 130     return this._has_pos1;
 131   }
 132
 133   /**
 134    * Method hasPos2.
 135    *
 136    * @return true if at least one Pos2 has been added
 137    */
 138   public boolean hasPos2()
 139   {
 140     return this._has_pos2;
 141   }
 142
 143   /**
 144    * Method hasPos3.
 145    *
 146    * @return true if at least one Pos3 has been added
 147    */
 148   public boolean hasPos3()
 149   {
 150     return this._has_pos3;
 151   }
 152
 153   /**
 154    * Method isValid.
 155    *
 156    * @return true if this object is valid according to the schema
 157    */
 158   public boolean isValid()
 159   {
 160     try
 161     {
 162       validate();
 163     } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)
 164     {
 165       return false;
 166     }
 167     return true;
 168   }
 169
 170   /**
 171    *
 172    *
 173    * @param out
 174    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 175    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 176    *           marshaling
 177    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 178    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 179    */
 180   public void marshal(final java.io.Writer out)
 181           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 182           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 183   {
 184     Marshaller.marshal(this, out);
 185   }
 186
 187   /**
 188    *
 189    *
 190    * @param handler
 191    * @throws java.io.IOException
 192    *           if an IOException occurs during marshaling
 193    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 194    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 195    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 196    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 197    *           marshaling
 198    */
 199   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)
 200           throws java.io.IOException,
 201           org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 202           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 203   {
 204     Marshaller.marshal(this, handler);
 205   }
 206
 207   /**
 208    * Sets the value of field 'pos1'.
 209    *
 210    * @param pos1
 211    *          the value of field 'pos1'.
 212    */
 213   public void setPos1(final long pos1)
 214   {
 215     this._pos1 = pos1;
 216     this._has_pos1 = true;
 217   }
 218
 219   /**
 220    * Sets the value of field 'pos2'.
 221    *
 222    * @param pos2
 223    *          the value of field 'pos2'.
 224    */
 225   public void setPos2(final long pos2)
 226   {
 227     this._pos2 = pos2;
 228     this._has_pos2 = true;
 229   }
 230
 231   /**
 232    * Sets the value of field 'pos3'.
 233    *
 234    * @param pos3
 235    *          the value of field 'pos3'.
 236    */
 237   public void setPos3(final long pos3)
 238   {
 239     this._pos3 = pos3;
 240     this._has_pos3 = true;
 241   }
 242
 243   /**
 244    * Method unmarshal.
 245    *
 246    * @param reader
 247    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 248    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 249    *           marshaling
 250    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 251    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 252    * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.Alcodo
 253    */
 254   public static jalview.schemabinding.version2.Alcodon unmarshal(
 255           final java.io.Reader reader)
 256           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 257           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 258   {
 259     return (jalview.schemabinding.version2.Alcodon) Unmarshaller.unmarshal(
 260             jalview.schemabinding.version2.Alcodon.class, reader);
 261   }
 262
 263   /**
 264    *
 265    *
 266    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 267    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 268    */
 269   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 270   {
 271     org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 272     validator.validate(this);
 273   }
 274
 275 }