src/jalview/schemabinding/version2/AnnotationDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.schemabinding.version2;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import org.exolab.castor.mapping.AccessMode;\r
  15 import org.exolab.castor.xml.TypeValidator;\r
  16 import org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor;\r
  17 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
  18 \r
  19 /**\r
  20  * Class AnnotationDescriptor.\r
  21  * \r
  22  * @version $Revision$ $Date$\r
  23  */\r
  24 public class AnnotationDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  25 \r
  26 \r
  27       //--------------------------/\r
  28      //- Class/Member Variables -/\r
  29     //--------------------------/\r
  30 \r
  31     /**\r
  32      * Field nsPrefix\r
  33      */\r
  34     private java.lang.String nsPrefix;\r
  35 \r
  36     /**\r
  37      * Field nsURI\r
  38      */\r
  39     private java.lang.String nsURI;\r
  40 \r
  41     /**\r
  42      * Field xmlName\r
  43      */\r
  44     private java.lang.String xmlName;\r
  45 \r
  46     /**\r
  47      * Field identity\r
  48      */\r
  49     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
  50 \r
  51 \r
  52       //----------------/\r
  53      //- Constructors -/\r
  54     //----------------/\r
  55 \r
  56     public AnnotationDescriptor() {\r
  57         super();\r
  58         nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  59         xmlName = "Annotation";\r
  60         \r
  61         //-- set grouping compositor\r
  62         setCompositorAsSequence();\r
  63         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  64         org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler              handler        = null;\r
  65         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  66         //-- initialize attribute descriptors\r
  67         \r
  68         //-- _graph\r
  69         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_graph", "graph", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  70         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  71             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  72                 throws IllegalStateException\r
  73             {\r
  74                 Annotation target = (Annotation) object;\r
  75                 if(!target.hasGraph())\r
  76                     return null;\r
  77                 return (target.getGraph() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
  78             }\r
  79             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  80                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  81             {\r
  82                 try {\r
  83                     Annotation target = (Annotation) object;\r
  84                     // ignore null values for non optional primitives\r
  85                     if (value == null) return;\r
  86                     \r
  87                     target.setGraph( ((java.lang.Boolean)value).booleanValue());\r
  88                 }\r
  89                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
  90                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  91                 }\r
  92             }\r
  93             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
  94                 return null;\r
  95             }\r
  96         } );\r
  97         desc.setHandler(handler);\r
  98         desc.setRequired(true);\r
  99         addFieldDescriptor(desc);\r
 100         \r
 101         //-- validation code for: _graph\r
 102         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 103         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 104         { //-- local scope\r
 105             BooleanValidator typeValidator = new BooleanValidator();\r
 106             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 107         }\r
 108         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 109         //-- _graphType\r
 110         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_graphType", "graphType", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 111         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 112             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 113                 throws IllegalStateException\r
 114             {\r
 115                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 116                 if(!target.hasGraphType())\r
 117                     return null;\r
 118                 return new java.lang.Integer(target.getGraphType());\r
 119             }\r
 120             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 121                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 122             {\r
 123                 try {\r
 124                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 125                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 126                     if (value == null) {\r
 127                         target.deleteGraphType();\r
 128                         return;\r
 129                     }\r
 130                     target.setGraphType( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
 131                 }\r
 132                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 133                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 134                 }\r
 135             }\r
 136             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 137                 return null;\r
 138             }\r
 139         } );\r
 140         desc.setHandler(handler);\r
 141         addFieldDescriptor(desc);\r
 142         \r
 143         //-- validation code for: _graphType\r
 144         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 145         { //-- local scope\r
 146             IntegerValidator typeValidator= new IntegerValidator();\r
 147             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 148         }\r
 149         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 150         //-- _sequenceRef\r
 151         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_sequenceRef", "sequenceRef", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 152         desc.setImmutable(true);\r
 153         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 154             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 155                 throws IllegalStateException\r
 156             {\r
 157                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 158                 return target.getSequenceRef();\r
 159             }\r
 160             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 161                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 162             {\r
 163                 try {\r
 164                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 165                     target.setSequenceRef( (java.lang.String) value);\r
 166                 }\r
 167                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 168                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 169                 }\r
 170             }\r
 171             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 172                 return null;\r
 173             }\r
 174         } );\r
 175         desc.setHandler(handler);\r
 176         addFieldDescriptor(desc);\r
 177         \r
 178         //-- validation code for: _sequenceRef\r
 179         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 180         { //-- local scope\r
 181             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 182             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 183             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 184         }\r
 185         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 186         //-- initialize element descriptors\r
 187         \r
 188         //-- _annotationElementList\r
 189         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement.class, "_annotationElementList", "annotationElement", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 190         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 191             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 192                 throws IllegalStateException\r
 193             {\r
 194                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 195                 return target.getAnnotationElement();\r
 196             }\r
 197             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 198                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 199             {\r
 200                 try {\r
 201                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 202                     target.addAnnotationElement( (jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement) value);\r
 203                 }\r
 204                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 205                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 206                 }\r
 207             }\r
 208             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 209                 return new jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement();\r
 210             }\r
 211         } );\r
 212         desc.setHandler(handler);\r
 213         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 214         desc.setRequired(true);\r
 215         desc.setMultivalued(true);\r
 216         addFieldDescriptor(desc);\r
 217         \r
 218         //-- validation code for: _annotationElementList\r
 219         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 220         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 221         { //-- local scope\r
 222         }\r
 223         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 224         //-- _label\r
 225         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_label", "label", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 226         desc.setImmutable(true);\r
 227         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 228             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 229                 throws IllegalStateException\r
 230             {\r
 231                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 232                 return target.getLabel();\r
 233             }\r
 234             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 235                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 236             {\r
 237                 try {\r
 238                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 239                     target.setLabel( (java.lang.String) value);\r
 240                 }\r
 241                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 242                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 243                 }\r
 244             }\r
 245             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 246                 return null;\r
 247             }\r
 248         } );\r
 249         desc.setHandler(handler);\r
 250         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 251         desc.setRequired(true);\r
 252         desc.setMultivalued(false);\r
 253         addFieldDescriptor(desc);\r
 254         \r
 255         //-- validation code for: _label\r
 256         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 257         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 258         { //-- local scope\r
 259             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 260             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 261             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 262         }\r
 263         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 264         //-- _description\r
 265         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_description", "description", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 266         desc.setImmutable(true);\r
 267         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 268             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 269                 throws IllegalStateException\r
 270             {\r
 271                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 272                 return target.getDescription();\r
 273             }\r
 274             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 275                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 276             {\r
 277                 try {\r
 278                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 279                     target.setDescription( (java.lang.String) value);\r
 280                 }\r
 281                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 282                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 283                 }\r
 284             }\r
 285             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 286                 return null;\r
 287             }\r
 288         } );\r
 289         desc.setHandler(handler);\r
 290         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 291         desc.setRequired(true);\r
 292         desc.setMultivalued(false);\r
 293         addFieldDescriptor(desc);\r
 294         \r
 295         //-- validation code for: _description\r
 296         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 297         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 298         { //-- local scope\r
 299             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 300             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 301             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 302         }\r
 303         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 304         //-- _thresholdLine\r
 305         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine.class, "_thresholdLine", "thresholdLine", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 306         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 307             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 308                 throws IllegalStateException\r
 309             {\r
 310                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 311                 return target.getThresholdLine();\r
 312             }\r
 313             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 314                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 315             {\r
 316                 try {\r
 317                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 318                     target.setThresholdLine( (jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine) value);\r
 319                 }\r
 320                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 321                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 322                 }\r
 323             }\r
 324             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 325                 return new jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine();\r
 326             }\r
 327         } );\r
 328         desc.setHandler(handler);\r
 329         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 330         desc.setMultivalued(false);\r
 331         addFieldDescriptor(desc);\r
 332         \r
 333         //-- validation code for: _thresholdLine\r
 334         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 335         { //-- local scope\r
 336         }\r
 337         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 338     } //-- jalview.schemabinding.version2.AnnotationDescriptor()\r
 339 \r
 340 \r
 341       //-----------/\r
 342      //- Methods -/\r
 343     //-----------/\r
 344 \r
 345     /**\r
 346      * Method getAccessMode\r
 347      * \r
 348      * \r
 349      * \r
 350      * @return AccessMode\r
 351      */\r
 352     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 353     {\r
 354         return null;\r
 355     } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode() \r
 356 \r
 357     /**\r
 358      * Method getExtends\r
 359      * \r
 360      * \r
 361      * \r
 362      * @return ClassDescriptor\r
 363      */\r
 364     public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 365     {\r
 366         return null;\r
 367     } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends() \r
 368 \r
 369     /**\r
 370      * Method getIdentity\r
 371      * \r
 372      * \r
 373      * \r
 374      * @return FieldDescriptor\r
 375      */\r
 376     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 377     {\r
 378         return identity;\r
 379     } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity() \r
 380 \r
 381     /**\r
 382      * Method getJavaClass\r
 383      * \r
 384      * \r
 385      * \r
 386      * @return Class\r
 387      */\r
 388     public java.lang.Class getJavaClass()\r
 389     {\r
 390         return jalview.schemabinding.version2.Annotation.class;\r
 391     } //-- java.lang.Class getJavaClass() \r
 392 \r
 393     /**\r
 394      * Method getNameSpacePrefix\r
 395      * \r
 396      * \r
 397      * \r
 398      * @return String\r
 399      */\r
 400     public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 401     {\r
 402         return nsPrefix;\r
 403     } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix() \r
 404 \r
 405     /**\r
 406      * Method getNameSpaceURI\r
 407      * \r
 408      * \r
 409      * \r
 410      * @return String\r
 411      */\r
 412     public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 413     {\r
 414         return nsURI;\r
 415     } //-- java.lang.String getNameSpaceURI() \r
 416 \r
 417     /**\r
 418      * Method getValidator\r
 419      * \r
 420      * \r
 421      * \r
 422      * @return TypeValidator\r
 423      */\r
 424     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 425     {\r
 426         return this;\r
 427     } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator() \r
 428 \r
 429     /**\r
 430      * Method getXMLName\r
 431      * \r
 432      * \r
 433      * \r
 434      * @return String\r
 435      */\r
 436     public java.lang.String getXMLName()\r
 437     {\r
 438         return xmlName;\r
 439     } //-- java.lang.String getXMLName() \r
 440 \r
 441 }\r