src/jalview/schemabinding/version2/FeatureDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with\r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.schemabinding.version2;\r
   9 \r
  10 //---------------------------------/\r
  11 //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
  15 \r
  16 /**\r
  17  * Class FeatureDescriptor.\r
  18  *\r
  19  * @version $Revision$ $Date$\r
  20  */\r
  21 public class FeatureDescriptor\r
  22     extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  23 {\r
  24 \r
  25   //--------------------------/\r
  26   //- Class/Member Variables -/\r
  27   //--------------------------/\r
  28 \r
  29   /**\r
  30    * Field nsPrefix\r
  31    */\r
  32   private java.lang.String nsPrefix;\r
  33 \r
  34   /**\r
  35    * Field nsURI\r
  36    */\r
  37   private java.lang.String nsURI;\r
  38 \r
  39   /**\r
  40    * Field xmlName\r
  41    */\r
  42   private java.lang.String xmlName;\r
  43 \r
  44   /**\r
  45    * Field identity\r
  46    */\r
  47   private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
  48 \r
  49   //----------------/\r
  50   //- Constructors -/\r
  51   //----------------/\r
  52 \r
  53   public FeatureDescriptor()\r
  54   {\r
  55     super();\r
  56     nsURI = "www.jalview.org";\r
  57     xmlName = "feature";\r
  58 \r
  59     //-- set grouping compositor\r
  60     setCompositorAsSequence();\r
  61     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  62     org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler handler = null;\r
  63     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  64     //-- initialize attribute descriptors\r
  65 \r
  66     //-- _begin\r
  67     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
  68         Integer.TYPE, "_begin", "begin",\r
  69         org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  70     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  71     {\r
  72       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  73           throws IllegalStateException\r
  74       {\r
  75         Feature target = (Feature) object;\r
  76         if (!target.hasBegin())\r
  77         {\r
  78           return null;\r
  79         }\r
  80         return new java.lang.Integer(target.getBegin());\r
  81       }\r
  82 \r
  83       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  84           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  85       {\r
  86         try\r
  87         {\r
  88           Feature target = (Feature) object;\r
  89           // ignore null values for non optional primitives\r
  90           if (value == null)\r
  91           {\r
  92             return;\r
  93           }\r
  94 \r
  95           target.setBegin( ( (java.lang.Integer) value).intValue());\r
  96         }\r
  97         catch (java.lang.Exception ex)\r
  98         {\r
  99           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 100         }\r
 101       }\r
 102 \r
 103       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 104       {\r
 105         return null;\r
 106       }\r
 107     });\r
 108     desc.setHandler(handler);\r
 109     desc.setRequired(true);\r
 110     addFieldDescriptor(desc);\r
 111 \r
 112     //-- validation code for: _begin\r
 113     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 114     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 115     { //-- local scope\r
 116       IntegerValidator typeValidator = new IntegerValidator();\r
 117       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 118     }\r
 119     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 120     //-- _end\r
 121     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 122         Integer.TYPE, "_end", "end", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 123     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 124     {\r
 125       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 126           throws IllegalStateException\r
 127       {\r
 128         Feature target = (Feature) object;\r
 129         if (!target.hasEnd())\r
 130         {\r
 131           return null;\r
 132         }\r
 133         return new java.lang.Integer(target.getEnd());\r
 134       }\r
 135 \r
 136       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 137           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 138       {\r
 139         try\r
 140         {\r
 141           Feature target = (Feature) object;\r
 142           // ignore null values for non optional primitives\r
 143           if (value == null)\r
 144           {\r
 145             return;\r
 146           }\r
 147 \r
 148           target.setEnd( ( (java.lang.Integer) value).intValue());\r
 149         }\r
 150         catch (java.lang.Exception ex)\r
 151         {\r
 152           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 153         }\r
 154       }\r
 155 \r
 156       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 157       {\r
 158         return null;\r
 159       }\r
 160     });\r
 161     desc.setHandler(handler);\r
 162     desc.setRequired(true);\r
 163     addFieldDescriptor(desc);\r
 164 \r
 165     //-- validation code for: _end\r
 166     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 167     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 168     { //-- local scope\r
 169       IntegerValidator typeValidator = new IntegerValidator();\r
 170       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 171     }\r
 172     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 173     //-- _type\r
 174     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 175         String.class, "_type", "type", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 176     desc.setImmutable(true);\r
 177     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 178     {\r
 179       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 180           throws IllegalStateException\r
 181       {\r
 182         Feature target = (Feature) object;\r
 183         return target.getType();\r
 184       }\r
 185 \r
 186       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 187           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 188       {\r
 189         try\r
 190         {\r
 191           Feature target = (Feature) object;\r
 192           target.setType( (java.lang.String) value);\r
 193         }\r
 194         catch (java.lang.Exception ex)\r
 195         {\r
 196           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 197         }\r
 198       }\r
 199 \r
 200       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 201       {\r
 202         return null;\r
 203       }\r
 204     });\r
 205     desc.setHandler(handler);\r
 206     desc.setRequired(true);\r
 207     addFieldDescriptor(desc);\r
 208 \r
 209     //-- validation code for: _type\r
 210     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 211     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 212     { //-- local scope\r
 213       StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 214       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 215       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 216     }\r
 217     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 218     //-- _description\r
 219     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 220         String.class, "_description", "description",\r
 221         org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 222     desc.setImmutable(true);\r
 223     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 224     {\r
 225       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 226           throws IllegalStateException\r
 227       {\r
 228         Feature target = (Feature) object;\r
 229         return target.getDescription();\r
 230       }\r
 231 \r
 232       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 233           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 234       {\r
 235         try\r
 236         {\r
 237           Feature target = (Feature) object;\r
 238           target.setDescription( (java.lang.String) value);\r
 239         }\r
 240         catch (java.lang.Exception ex)\r
 241         {\r
 242           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 243         }\r
 244       }\r
 245 \r
 246       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 247       {\r
 248         return null;\r
 249       }\r
 250     });\r
 251     desc.setHandler(handler);\r
 252     addFieldDescriptor(desc);\r
 253 \r
 254     //-- validation code for: _description\r
 255     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 256     { //-- local scope\r
 257       StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 258       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 259       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 260     }\r
 261     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 262     //-- _status\r
 263     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 264         String.class, "_status", "status",\r
 265         org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 266     desc.setImmutable(true);\r
 267     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 268     {\r
 269       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 270           throws IllegalStateException\r
 271       {\r
 272         Feature target = (Feature) object;\r
 273         return target.getStatus();\r
 274       }\r
 275 \r
 276       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 277           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 278       {\r
 279         try\r
 280         {\r
 281           Feature target = (Feature) object;\r
 282           target.setStatus( (java.lang.String) value);\r
 283         }\r
 284         catch (java.lang.Exception ex)\r
 285         {\r
 286           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 287         }\r
 288       }\r
 289 \r
 290       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 291       {\r
 292         return null;\r
 293       }\r
 294     });\r
 295     desc.setHandler(handler);\r
 296     addFieldDescriptor(desc);\r
 297 \r
 298     //-- validation code for: _status\r
 299     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 300     { //-- local scope\r
 301       StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 302       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 303       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 304     }\r
 305     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 306     //-- _featureGroup\r
 307     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 308         String.class, "_featureGroup", "featureGroup",\r
 309         org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 310     desc.setImmutable(true);\r
 311     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 312     {\r
 313       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 314           throws IllegalStateException\r
 315       {\r
 316         Feature target = (Feature) object;\r
 317         return target.getFeatureGroup();\r
 318       }\r
 319 \r
 320       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 321           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 322       {\r
 323         try\r
 324         {\r
 325           Feature target = (Feature) object;\r
 326           target.setFeatureGroup( (java.lang.String) value);\r
 327         }\r
 328         catch (java.lang.Exception ex)\r
 329         {\r
 330           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 331         }\r
 332       }\r
 333 \r
 334       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 335       {\r
 336         return null;\r
 337       }\r
 338     });\r
 339     desc.setHandler(handler);\r
 340     addFieldDescriptor(desc);\r
 341 \r
 342     //-- validation code for: _featureGroup\r
 343     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 344     { //-- local scope\r
 345       StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 346       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 347       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 348     }\r
 349     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 350     //-- _score\r
 351     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(float.class,\r
 352         "_score", "score", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 353     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 354     {\r
 355       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 356           throws IllegalStateException\r
 357       {\r
 358         Feature target = (Feature) object;\r
 359         if (!target.hasScore())\r
 360         {\r
 361           return null;\r
 362         }\r
 363         return new java.lang.Float(target.getScore());\r
 364       }\r
 365 \r
 366       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 367           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 368       {\r
 369         try\r
 370         {\r
 371           Feature target = (Feature) object;\r
 372           // if null, use delete method for optional primitives\r
 373           if (value == null)\r
 374           {\r
 375             target.deleteScore();\r
 376             return;\r
 377           }\r
 378           target.setScore( ( (java.lang.Float) value).floatValue());\r
 379         }\r
 380         catch (java.lang.Exception ex)\r
 381         {\r
 382           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 383         }\r
 384       }\r
 385 \r
 386       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 387       {\r
 388         return null;\r
 389       }\r
 390     });\r
 391     desc.setHandler(handler);\r
 392     addFieldDescriptor(desc);\r
 393 \r
 394     //-- validation code for: _score\r
 395     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 396     { //-- local scope\r
 397       FloatValidator typeValidator = new FloatValidator();\r
 398       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 399     }\r
 400     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 401     //-- initialize element descriptors\r
 402 \r
 403     //-- _otherDataList\r
 404     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.\r
 405         schemabinding.version2.OtherData.class, "_otherDataList", "otherData",\r
 406         org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 407     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 408     {\r
 409       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 410           throws IllegalStateException\r
 411       {\r
 412         Feature target = (Feature) object;\r
 413         return target.getOtherData();\r
 414       }\r
 415 \r
 416       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 417           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 418       {\r
 419         try\r
 420         {\r
 421           Feature target = (Feature) object;\r
 422           target.addOtherData( (jalview.schemabinding.version2.OtherData) value);\r
 423         }\r
 424         catch (java.lang.Exception ex)\r
 425         {\r
 426           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 427         }\r
 428       }\r
 429 \r
 430       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 431       {\r
 432         return new jalview.schemabinding.version2.OtherData();\r
 433       }\r
 434     });\r
 435     desc.setHandler(handler);\r
 436     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 437     desc.setMultivalued(true);\r
 438     addFieldDescriptor(desc);\r
 439 \r
 440     //-- validation code for: _otherDataList\r
 441     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 442     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 443     { //-- local scope\r
 444     }\r
 445     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 446   } //-- jalview.schemabinding.version2.FeatureDescriptor()\r
 447 \r
 448   //-----------/\r
 449   //- Methods -/\r
 450   //-----------/\r
 451 \r
 452   /**\r
 453    * Method getAccessMode\r
 454    *\r
 455    *\r
 456    *\r
 457    * @return AccessMode\r
 458    */\r
 459   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 460   {\r
 461     return null;\r
 462   } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 463 \r
 464   /**\r
 465    * Method getExtends\r
 466    *\r
 467    *\r
 468    *\r
 469    * @return ClassDescriptor\r
 470    */\r
 471   public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 472   {\r
 473     return null;\r
 474   } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 475 \r
 476   /**\r
 477    * Method getIdentity\r
 478    *\r
 479    *\r
 480    *\r
 481    * @return FieldDescriptor\r
 482    */\r
 483   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 484   {\r
 485     return identity;\r
 486   } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 487 \r
 488   /**\r
 489    * Method getJavaClass\r
 490    *\r
 491    *\r
 492    *\r
 493    * @return Class\r
 494    */\r
 495   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 496   {\r
 497     return jalview.schemabinding.version2.Feature.class;\r
 498   } //-- java.lang.Class getJavaClass()\r
 499 \r
 500   /**\r
 501    * Method getNameSpacePrefix\r
 502    *\r
 503    *\r
 504    *\r
 505    * @return String\r
 506    */\r
 507   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 508   {\r
 509     return nsPrefix;\r
 510   } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 511 \r
 512   /**\r
 513    * Method getNameSpaceURI\r
 514    *\r
 515    *\r
 516    *\r
 517    * @return String\r
 518    */\r
 519   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 520   {\r
 521     return nsURI;\r
 522   } //-- java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 523 \r
 524   /**\r
 525    * Method getValidator\r
 526    *\r
 527    *\r
 528    *\r
 529    * @return TypeValidator\r
 530    */\r
 531   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 532   {\r
 533     return this;\r
 534   } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 535 \r
 536   /**\r
 537    * Method getXMLName\r
 538    *\r
 539    *\r
 540    *\r
 541    * @return String\r
 542    */\r
 543   public java.lang.String getXMLName()\r
 544   {\r
 545     return xmlName;\r
 546   } //-- java.lang.String getXMLName()\r
 547 \r
 548 }\r