src/jalview/schemabinding/version2/JSeqDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.schemabinding.version2;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import org.exolab.castor.mapping.AccessMode;\r
  15 import org.exolab.castor.xml.TypeValidator;\r
  16 import org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor;\r
  17 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
  18 \r
  19 /**\r
  20  * Class JSeqDescriptor.\r
  21  * \r
  22  * @version $Revision$ $Date$\r
  23  */\r
  24 public class JSeqDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  25 \r
  26 \r
  27       //--------------------------/\r
  28      //- Class/Member Variables -/\r
  29     //--------------------------/\r
  30 \r
  31     /**\r
  32      * Field nsPrefix\r
  33      */\r
  34     private java.lang.String nsPrefix;\r
  35 \r
  36     /**\r
  37      * Field nsURI\r
  38      */\r
  39     private java.lang.String nsURI;\r
  40 \r
  41     /**\r
  42      * Field xmlName\r
  43      */\r
  44     private java.lang.String xmlName;\r
  45 \r
  46     /**\r
  47      * Field identity\r
  48      */\r
  49     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
  50 \r
  51 \r
  52       //----------------/\r
  53      //- Constructors -/\r
  54     //----------------/\r
  55 \r
  56     public JSeqDescriptor() {\r
  57         super();\r
  58         nsURI = "www.jalview.org";\r
  59         xmlName = "JSeq";\r
  60         \r
  61         //-- set grouping compositor\r
  62         setCompositorAsSequence();\r
  63         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  64         org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler              handler        = null;\r
  65         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  66         //-- initialize attribute descriptors\r
  67         \r
  68         //-- _colour\r
  69         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_colour", "colour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  70         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  71             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  72                 throws IllegalStateException\r
  73             {\r
  74                 JSeq target = (JSeq) object;\r
  75                 if(!target.hasColour())\r
  76                     return null;\r
  77                 return new java.lang.Integer(target.getColour());\r
  78             }\r
  79             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  80                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  81             {\r
  82                 try {\r
  83                     JSeq target = (JSeq) object;\r
  84                     // if null, use delete method for optional primitives \r
  85                     if (value == null) {\r
  86                         target.deleteColour();\r
  87                         return;\r
  88                     }\r
  89                     target.setColour( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
  90                 }\r
  91                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
  92                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  93                 }\r
  94             }\r
  95             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
  96                 return null;\r
  97             }\r
  98         } );\r
  99         desc.setHandler(handler);\r
 100         addFieldDescriptor(desc);\r
 101         \r
 102         //-- validation code for: _colour\r
 103         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 104         { //-- local scope\r
 105             IntegerValidator typeValidator= new IntegerValidator();\r
 106             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 107         }\r
 108         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 109         //-- _start\r
 110         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_start", "start", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 111         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 112             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 113                 throws IllegalStateException\r
 114             {\r
 115                 JSeq target = (JSeq) object;\r
 116                 if(!target.hasStart())\r
 117                     return null;\r
 118                 return new java.lang.Integer(target.getStart());\r
 119             }\r
 120             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 121                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 122             {\r
 123                 try {\r
 124                     JSeq target = (JSeq) object;\r
 125                     // ignore null values for non optional primitives\r
 126                     if (value == null) return;\r
 127                     \r
 128                     target.setStart( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
 129                 }\r
 130                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 131                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 132                 }\r
 133             }\r
 134             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 135                 return null;\r
 136             }\r
 137         } );\r
 138         desc.setHandler(handler);\r
 139         desc.setRequired(true);\r
 140         addFieldDescriptor(desc);\r
 141         \r
 142         //-- validation code for: _start\r
 143         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 144         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 145         { //-- local scope\r
 146             IntegerValidator typeValidator= new IntegerValidator();\r
 147             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 148         }\r
 149         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 150         //-- _end\r
 151         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_end", "end", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 152         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 153             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 154                 throws IllegalStateException\r
 155             {\r
 156                 JSeq target = (JSeq) object;\r
 157                 if(!target.hasEnd())\r
 158                     return null;\r
 159                 return new java.lang.Integer(target.getEnd());\r
 160             }\r
 161             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 162                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 163             {\r
 164                 try {\r
 165                     JSeq target = (JSeq) object;\r
 166                     // ignore null values for non optional primitives\r
 167                     if (value == null) return;\r
 168                     \r
 169                     target.setEnd( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
 170                 }\r
 171                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 172                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 173                 }\r
 174             }\r
 175             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 176                 return null;\r
 177             }\r
 178         } );\r
 179         desc.setHandler(handler);\r
 180         desc.setRequired(true);\r
 181         addFieldDescriptor(desc);\r
 182         \r
 183         //-- validation code for: _end\r
 184         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 185         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 186         { //-- local scope\r
 187             IntegerValidator typeValidator= new IntegerValidator();\r
 188             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 189         }\r
 190         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 191         //-- _id\r
 192         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 193         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 194             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 195                 throws IllegalStateException\r
 196             {\r
 197                 JSeq target = (JSeq) object;\r
 198                 if(!target.hasId())\r
 199                     return null;\r
 200                 return new java.lang.Integer(target.getId());\r
 201             }\r
 202             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 203                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 204             {\r
 205                 try {\r
 206                     JSeq target = (JSeq) object;\r
 207                     // ignore null values for non optional primitives\r
 208                     if (value == null) return;\r
 209                     \r
 210                     target.setId( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
 211                 }\r
 212                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 213                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 214                 }\r
 215             }\r
 216             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 217                 return null;\r
 218             }\r
 219         } );\r
 220         desc.setHandler(handler);\r
 221         desc.setRequired(true);\r
 222         addFieldDescriptor(desc);\r
 223         \r
 224         //-- validation code for: _id\r
 225         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 226         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 227         { //-- local scope\r
 228             IntegerValidator typeValidator= new IntegerValidator();\r
 229             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 230         }\r
 231         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 232         //-- _hidden\r
 233         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_hidden", "hidden", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 234         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 235             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 236                 throws IllegalStateException\r
 237             {\r
 238                 JSeq target = (JSeq) object;\r
 239                 if(!target.hasHidden())\r
 240                     return null;\r
 241                 return (target.getHidden() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 242             }\r
 243             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 244                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 245             {\r
 246                 try {\r
 247                     JSeq target = (JSeq) object;\r
 248                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 249                     if (value == null) {\r
 250                         target.deleteHidden();\r
 251                         return;\r
 252                     }\r
 253                     target.setHidden( ((java.lang.Boolean)value).booleanValue());\r
 254                 }\r
 255                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 256                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 257                 }\r
 258             }\r
 259             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 260                 return null;\r
 261             }\r
 262         } );\r
 263         desc.setHandler(handler);\r
 264         addFieldDescriptor(desc);\r
 265         \r
 266         //-- validation code for: _hidden\r
 267         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 268         { //-- local scope\r
 269             BooleanValidator typeValidator = new BooleanValidator();\r
 270             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 271         }\r
 272         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 273         //-- initialize element descriptors\r
 274         \r
 275         //-- _featuresList\r
 276         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.Features.class, "_featuresList", "features", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 277         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 278             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 279                 throws IllegalStateException\r
 280             {\r
 281                 JSeq target = (JSeq) object;\r
 282                 return target.getFeatures();\r
 283             }\r
 284             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 285                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 286             {\r
 287                 try {\r
 288                     JSeq target = (JSeq) object;\r
 289                     target.addFeatures( (jalview.schemabinding.version2.Features) value);\r
 290                 }\r
 291                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 292                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 293                 }\r
 294             }\r
 295             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 296                 return new jalview.schemabinding.version2.Features();\r
 297             }\r
 298         } );\r
 299         desc.setHandler(handler);\r
 300         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 301         desc.setMultivalued(true);\r
 302         addFieldDescriptor(desc);\r
 303         \r
 304         //-- validation code for: _featuresList\r
 305         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 306         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 307         { //-- local scope\r
 308         }\r
 309         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 310         //-- _pdbidsList\r
 311         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.Pdbids.class, "_pdbidsList", "pdbids", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 312         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 313             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 314                 throws IllegalStateException\r
 315             {\r
 316                 JSeq target = (JSeq) object;\r
 317                 return target.getPdbids();\r
 318             }\r
 319             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 320                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 321             {\r
 322                 try {\r
 323                     JSeq target = (JSeq) object;\r
 324                     target.addPdbids( (jalview.schemabinding.version2.Pdbids) value);\r
 325                 }\r
 326                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 327                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 328                 }\r
 329             }\r
 330             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 331                 return new jalview.schemabinding.version2.Pdbids();\r
 332             }\r
 333         } );\r
 334         desc.setHandler(handler);\r
 335         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 336         desc.setMultivalued(true);\r
 337         addFieldDescriptor(desc);\r
 338         \r
 339         //-- validation code for: _pdbidsList\r
 340         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 341         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 342         { //-- local scope\r
 343         }\r
 344         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 345         //-- _hiddenSequencesList\r
 346         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_hiddenSequencesList", "hiddenSequences", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 347         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 348             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 349                 throws IllegalStateException\r
 350             {\r
 351                 JSeq target = (JSeq) object;\r
 352                 return target.getHiddenSequences();\r
 353             }\r
 354             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 355                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 356             {\r
 357                 try {\r
 358                     JSeq target = (JSeq) object;\r
 359                     // ignore null values for non optional primitives\r
 360                     if (value == null) return;\r
 361                     \r
 362                     target.addHiddenSequences( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
 363                 }\r
 364                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
 365                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 366                 }\r
 367             }\r
 368             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
 369                 return null;\r
 370             }\r
 371         } );\r
 372         desc.setHandler(handler);\r
 373         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 374         desc.setMultivalued(true);\r
 375         addFieldDescriptor(desc);\r
 376         \r
 377         //-- validation code for: _hiddenSequencesList\r
 378         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 379         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 380         { //-- local scope\r
 381             IntegerValidator typeValidator= new IntegerValidator();\r
 382             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 383         }\r
 384         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 385     } //-- jalview.schemabinding.version2.JSeqDescriptor()\r
 386 \r
 387 \r
 388       //-----------/\r
 389      //- Methods -/\r
 390     //-----------/\r
 391 \r
 392     /**\r
 393      * Method getAccessMode\r
 394      * \r
 395      * \r
 396      * \r
 397      * @return AccessMode\r
 398      */\r
 399     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 400     {\r
 401         return null;\r
 402     } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode() \r
 403 \r
 404     /**\r
 405      * Method getExtends\r
 406      * \r
 407      * \r
 408      * \r
 409      * @return ClassDescriptor\r
 410      */\r
 411     public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 412     {\r
 413         return null;\r
 414     } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends() \r
 415 \r
 416     /**\r
 417      * Method getIdentity\r
 418      * \r
 419      * \r
 420      * \r
 421      * @return FieldDescriptor\r
 422      */\r
 423     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 424     {\r
 425         return identity;\r
 426     } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity() \r
 427 \r
 428     /**\r
 429      * Method getJavaClass\r
 430      * \r
 431      * \r
 432      * \r
 433      * @return Class\r
 434      */\r
 435     public java.lang.Class getJavaClass()\r
 436     {\r
 437         return jalview.schemabinding.version2.JSeq.class;\r
 438     } //-- java.lang.Class getJavaClass() \r
 439 \r
 440     /**\r
 441      * Method getNameSpacePrefix\r
 442      * \r
 443      * \r
 444      * \r
 445      * @return String\r
 446      */\r
 447     public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 448     {\r
 449         return nsPrefix;\r
 450     } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix() \r
 451 \r
 452     /**\r
 453      * Method getNameSpaceURI\r
 454      * \r
 455      * \r
 456      * \r
 457      * @return String\r
 458      */\r
 459     public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 460     {\r
 461         return nsURI;\r
 462     } //-- java.lang.String getNameSpaceURI() \r
 463 \r
 464     /**\r
 465      * Method getValidator\r
 466      * \r
 467      * \r
 468      * \r
 469      * @return TypeValidator\r
 470      */\r
 471     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 472     {\r
 473         return this;\r
 474     } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator() \r
 475 \r
 476     /**\r
 477      * Method getXMLName\r
 478      * \r
 479      * \r
 480      * \r
 481      * @return String\r
 482      */\r
 483     public java.lang.String getXMLName()\r
 484     {\r
 485         return xmlName;\r
 486     } //-- java.lang.String getXMLName() \r
 487 \r
 488 }\r