src/jalview/schemabinding/version2/SequenceSetDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with\r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.schemabinding.version2;\r
   9 \r
  10 //---------------------------------/\r
  11 //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
  15 \r
  16 /**\r
  17  * Class SequenceSetDescriptor.\r
  18  *\r
  19  * @version $Revision$ $Date$\r
  20  */\r
  21 public class SequenceSetDescriptor\r
  22     extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  23 {\r
  24 \r
  25   //--------------------------/\r
  26   //- Class/Member Variables -/\r
  27   //--------------------------/\r
  28 \r
  29   /**\r
  30    * Field nsPrefix\r
  31    */\r
  32   private java.lang.String nsPrefix;\r
  33 \r
  34   /**\r
  35    * Field nsURI\r
  36    */\r
  37   private java.lang.String nsURI;\r
  38 \r
  39   /**\r
  40    * Field xmlName\r
  41    */\r
  42   private java.lang.String xmlName;\r
  43 \r
  44   /**\r
  45    * Field identity\r
  46    */\r
  47   private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
  48 \r
  49   //----------------/\r
  50   //- Constructors -/\r
  51   //----------------/\r
  52 \r
  53   public SequenceSetDescriptor()\r
  54   {\r
  55     super();\r
  56     nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  57     xmlName = "SequenceSet";\r
  58 \r
  59     //-- set grouping compositor\r
  60     setCompositorAsSequence();\r
  61     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  62     org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler handler = null;\r
  63     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  64     //-- initialize attribute descriptors\r
  65 \r
  66     //-- _gapChar\r
  67     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
  68         String.class, "_gapChar", "gapChar",\r
  69         org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  70     desc.setImmutable(true);\r
  71     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  72     {\r
  73       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  74           throws IllegalStateException\r
  75       {\r
  76         SequenceSet target = (SequenceSet) object;\r
  77         return target.getGapChar();\r
  78       }\r
  79 \r
  80       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  81           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  82       {\r
  83         try\r
  84         {\r
  85           SequenceSet target = (SequenceSet) object;\r
  86           target.setGapChar( (java.lang.String) value);\r
  87         }\r
  88         catch (java.lang.Exception ex)\r
  89         {\r
  90           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  91         }\r
  92       }\r
  93 \r
  94       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
  95       {\r
  96         return null;\r
  97       }\r
  98     });\r
  99     desc.setHandler(handler);\r
 100     desc.setRequired(true);\r
 101     addFieldDescriptor(desc);\r
 102 \r
 103     //-- validation code for: _gapChar\r
 104     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 105     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 106     { //-- local scope\r
 107       StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
 108       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 109       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 110     }\r
 111     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 112     //-- initialize element descriptors\r
 113 \r
 114     //-- _sequenceList\r
 115     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.\r
 116         schemabinding.version2.Sequence.class, "_sequenceList", "Sequence",\r
 117         org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 118     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 119     {\r
 120       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 121           throws IllegalStateException\r
 122       {\r
 123         SequenceSet target = (SequenceSet) object;\r
 124         return target.getSequence();\r
 125       }\r
 126 \r
 127       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 128           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 129       {\r
 130         try\r
 131         {\r
 132           SequenceSet target = (SequenceSet) object;\r
 133           target.addSequence( (jalview.schemabinding.version2.Sequence) value);\r
 134         }\r
 135         catch (java.lang.Exception ex)\r
 136         {\r
 137           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 138         }\r
 139       }\r
 140 \r
 141       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 142       {\r
 143         return new jalview.schemabinding.version2.Sequence();\r
 144       }\r
 145     });\r
 146     desc.setHandler(handler);\r
 147     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 148     desc.setMultivalued(true);\r
 149     addFieldDescriptor(desc);\r
 150 \r
 151     //-- validation code for: _sequenceList\r
 152     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 153     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 154     { //-- local scope\r
 155     }\r
 156     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 157     //-- _annotationList\r
 158     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.\r
 159         schemabinding.version2.Annotation.class, "_annotationList",\r
 160         "Annotation", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 161     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 162     {\r
 163       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 164           throws IllegalStateException\r
 165       {\r
 166         SequenceSet target = (SequenceSet) object;\r
 167         return target.getAnnotation();\r
 168       }\r
 169 \r
 170       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 171           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 172       {\r
 173         try\r
 174         {\r
 175           SequenceSet target = (SequenceSet) object;\r
 176           target.addAnnotation( (jalview.schemabinding.version2.Annotation)\r
 177                                value);\r
 178         }\r
 179         catch (java.lang.Exception ex)\r
 180         {\r
 181           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 182         }\r
 183       }\r
 184 \r
 185       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 186       {\r
 187         return new jalview.schemabinding.version2.Annotation();\r
 188       }\r
 189     });\r
 190     desc.setHandler(handler);\r
 191     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 192     desc.setMultivalued(true);\r
 193     addFieldDescriptor(desc);\r
 194 \r
 195     //-- validation code for: _annotationList\r
 196     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 197     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 198     { //-- local scope\r
 199     }\r
 200     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 201   } //-- jalview.schemabinding.version2.SequenceSetDescriptor()\r
 202 \r
 203   //-----------/\r
 204   //- Methods -/\r
 205   //-----------/\r
 206 \r
 207   /**\r
 208    * Method getAccessMode\r
 209    *\r
 210    *\r
 211    *\r
 212    * @return AccessMode\r
 213    */\r
 214   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 215   {\r
 216     return null;\r
 217   } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 218 \r
 219   /**\r
 220    * Method getExtends\r
 221    *\r
 222    *\r
 223    *\r
 224    * @return ClassDescriptor\r
 225    */\r
 226   public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 227   {\r
 228     return null;\r
 229   } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 230 \r
 231   /**\r
 232    * Method getIdentity\r
 233    *\r
 234    *\r
 235    *\r
 236    * @return FieldDescriptor\r
 237    */\r
 238   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 239   {\r
 240     return identity;\r
 241   } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 242 \r
 243   /**\r
 244    * Method getJavaClass\r
 245    *\r
 246    *\r
 247    *\r
 248    * @return Class\r
 249    */\r
 250   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 251   {\r
 252     return jalview.schemabinding.version2.SequenceSet.class;\r
 253   } //-- java.lang.Class getJavaClass()\r
 254 \r
 255   /**\r
 256    * Method getNameSpacePrefix\r
 257    *\r
 258    *\r
 259    *\r
 260    * @return String\r
 261    */\r
 262   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 263   {\r
 264     return nsPrefix;\r
 265   } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 266 \r
 267   /**\r
 268    * Method getNameSpaceURI\r
 269    *\r
 270    *\r
 271    *\r
 272    * @return String\r
 273    */\r
 274   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 275   {\r
 276     return nsURI;\r
 277   } //-- java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 278 \r
 279   /**\r
 280    * Method getValidator\r
 281    *\r
 282    *\r
 283    *\r
 284    * @return TypeValidator\r
 285    */\r
 286   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 287   {\r
 288     return this;\r
 289   } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 290 \r
 291   /**\r
 292    * Method getXMLName\r
 293    *\r
 294    *\r
 295    *\r
 296    * @return String\r
 297    */\r
 298   public java.lang.String getXMLName()\r
 299   {\r
 300     return xmlName;\r
 301   } //-- java.lang.String getXMLName()\r
 302 \r
 303 }\r