src/jalview/schemabinding/version2/SequenceType.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $(date) The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
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  11  *
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  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  *******************************************************************************/
  21 /*
  22  * This class was automatically generated with
  23  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  24  * Schema.
  25  * $Id$
  26  */
  27
  28 package jalview.schemabinding.version2;
  29
  30 //---------------------------------/
  31 //- Imported classes and packages -/
  32 //---------------------------------/
  33
  34 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;
  35 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  36
  37 /**
  38  * Class SequenceType.
  39  *
  40  * @version $Revision$ $Date$
  41  */
  42 public class SequenceType implements java.io.Serializable
  43 {
  44
  45   // --------------------------/
  46   // - Class/Member Variables -/
  47   // --------------------------/
  48
  49   /**
  50    * Field _id.
  51    */
  52   private java.lang.String _id;
  53
  54   /**
  55    * Field _description.
  56    */
  57   private java.lang.String _description;
  58
  59   /**
  60    * Field _sequence.
  61    */
  62   private java.lang.String _sequence;
  63
  64   /**
  65    * Field _name.
  66    */
  67   private java.lang.String _name;
  68
  69   // ----------------/
  70   // - Constructors -/
  71   // ----------------/
  72
  73   public SequenceType()
  74   {
  75     super();
  76   }
  77
  78   // -----------/
  79   // - Methods -/
  80   // -----------/
  81
  82   /**
  83    * Returns the value of field 'description'.
  84    *
  85    * @return the value of field 'Description'.
  86    */
  87   public java.lang.String getDescription()
  88   {
  89     return this._description;
  90   }
  91
  92   /**
  93    * Returns the value of field 'id'.
  94    *
  95    * @return the value of field 'Id'.
  96    */
  97   public java.lang.String getId()
  98   {
  99     return this._id;
 100   }
 101
 102   /**
 103    * Returns the value of field 'name'.
 104    *
 105    * @return the value of field 'Name'.
 106    */
 107   public java.lang.String getName()
 108   {
 109     return this._name;
 110   }
 111
 112   /**
 113    * Returns the value of field 'sequence'.
 114    *
 115    * @return the value of field 'Sequence'.
 116    */
 117   public java.lang.String getSequence()
 118   {
 119     return this._sequence;
 120   }
 121
 122   /**
 123    * Method isValid.
 124    *
 125    * @return true if this object is valid according to the schema
 126    */
 127   public boolean isValid()
 128   {
 129     try
 130     {
 131       validate();
 132     } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)
 133     {
 134       return false;
 135     }
 136     return true;
 137   }
 138
 139   /**
 140    *
 141    *
 142    * @param out
 143    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 144    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 145    *           marshaling
 146    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 147    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 148    */
 149   public void marshal(final java.io.Writer out)
 150           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 151           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 152   {
 153     Marshaller.marshal(this, out);
 154   }
 155
 156   /**
 157    *
 158    *
 159    * @param handler
 160    * @throws java.io.IOException
 161    *           if an IOException occurs during marshaling
 162    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 163    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 164    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 165    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 166    *           marshaling
 167    */
 168   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)
 169           throws java.io.IOException,
 170           org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 171           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 172   {
 173     Marshaller.marshal(this, handler);
 174   }
 175
 176   /**
 177    * Sets the value of field 'description'.
 178    *
 179    * @param description
 180    *          the value of field 'description'.
 181    */
 182   public void setDescription(final java.lang.String description)
 183   {
 184     this._description = description;
 185   }
 186
 187   /**
 188    * Sets the value of field 'id'.
 189    *
 190    * @param id
 191    *          the value of field 'id'.
 192    */
 193   public void setId(final java.lang.String id)
 194   {
 195     this._id = id;
 196   }
 197
 198   /**
 199    * Sets the value of field 'name'.
 200    *
 201    * @param name
 202    *          the value of field 'name'.
 203    */
 204   public void setName(final java.lang.String name)
 205   {
 206     this._name = name;
 207   }
 208
 209   /**
 210    * Sets the value of field 'sequence'.
 211    *
 212    * @param sequence
 213    *          the value of field 'sequence'.
 214    */
 215   public void setSequence(final java.lang.String sequence)
 216   {
 217     this._sequence = sequence;
 218   }
 219
 220   /**
 221    * Method unmarshal.
 222    *
 223    * @param reader
 224    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException
 225    *           if object is null or if any SAXException is thrown during
 226    *           marshaling
 227    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 228    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 229    * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.SequenceType
 230    */
 231   public static jalview.schemabinding.version2.SequenceType unmarshal(
 232           final java.io.Reader reader)
 233           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,
 234           org.exolab.castor.xml.ValidationException
 235   {
 236     return (jalview.schemabinding.version2.SequenceType) Unmarshaller
 237             .unmarshal(jalview.schemabinding.version2.SequenceType.class,
 238                     reader);
 239   }
 240
 241   /**
 242    *
 243    *
 244    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 245    *           if this object is an invalid instance according to the schema
 246    */
 247   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException
 248   {
 249     org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();
 250     validator.validate(this);
 251   }
 252
 253 }