src/jalview/schemabinding/version2/VamsasModel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2;\r
  20 \r
  21 // ---------------------------------/\r
  22 // - Imported classes and packages -/\r
  23 // ---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
  26 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
  27 \r
  28 /**\r
  29  * Class VamsasModel.\r
  30  * \r
  31  * @version $Revision$ $Date$\r
  32  */\r
  33 public class VamsasModel extends VAMSAS implements java.io.Serializable\r
  34 {\r
  35 \r
  36   // ----------------/\r
  37   // - Constructors -/\r
  38   // ----------------/\r
  39 \r
  40   public VamsasModel()\r
  41   {\r
  42     super();\r
  43   }\r
  44 \r
  45   // -----------/\r
  46   // - Methods -/\r
  47   // -----------/\r
  48 \r
  49   /**\r
  50    * Method isValid.\r
  51    * \r
  52    * @return true if this object is valid according to the schema\r
  53    */\r
  54   public boolean isValid()\r
  55   {\r
  56     try\r
  57     {\r
  58       validate();\r
  59     } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)\r
  60     {\r
  61       return false;\r
  62     }\r
  63     return true;\r
  64   }\r
  65 \r
  66   /**\r
  67    * \r
  68    * \r
  69    * @param out\r
  70    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
  71    *                 if object is null or if any SAXException is thrown during\r
  72    *                 marshaling\r
  73    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
  74    *                 if this object is an invalid instance according to the\r
  75    *                 schema\r
  76    */\r
  77   public void marshal(final java.io.Writer out)\r
  78           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
  79           org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
  80   {\r
  81     Marshaller.marshal(this, out);\r
  82   }\r
  83 \r
  84   /**\r
  85    * \r
  86    * \r
  87    * @param handler\r
  88    * @throws java.io.IOException\r
  89    *                 if an IOException occurs during marshaling\r
  90    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
  91    *                 if this object is an invalid instance according to the\r
  92    *                 schema\r
  93    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
  94    *                 if object is null or if any SAXException is thrown during\r
  95    *                 marshaling\r
  96    */\r
  97   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
  98           throws java.io.IOException,\r
  99           org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
 100           org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 101   {\r
 102     Marshaller.marshal(this, handler);\r
 103   }\r
 104 \r
 105   /**\r
 106    * Method unmarshal.\r
 107    * \r
 108    * @param reader\r
 109    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
 110    *                 if object is null or if any SAXException is thrown during\r
 111    *                 marshaling\r
 112    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 113    *                 if this object is an invalid instance according to the\r
 114    *                 schema\r
 115    * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.VAMSAS\r
 116    */\r
 117   public static jalview.schemabinding.version2.VAMSAS unmarshal(\r
 118           final java.io.Reader reader)\r
 119           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
 120           org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 121   {\r
 122     return (jalview.schemabinding.version2.VAMSAS) Unmarshaller.unmarshal(\r
 123             jalview.schemabinding.version2.VamsasModel.class, reader);\r
 124   }\r
 125 \r
 126   /**\r
 127    * \r
 128    * \r
 129    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 130    *                 if this object is an invalid instance according to the\r
 131    *                 schema\r
 132    */\r
 133   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 134   {\r
 135     org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
 136     validator.validate(this);\r
 137   }\r
 138 \r
 139 }\r