src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AlcodonDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21 // ---------------------------------/\r
  22 // - Imported classes and packages -/\r
  23 // ---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.Alcodon;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class AlcodonDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class AlcodonDescriptor extends\r
  33         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  34 {\r
  35 \r
  36   // --------------------------/\r
  37   // - Class/Member Variables -/\r
  38   // --------------------------/\r
  39 \r
  40   /**\r
  41    * Field _elementDefinition.\r
  42    */\r
  43   private boolean _elementDefinition;\r
  44 \r
  45   /**\r
  46    * Field _nsPrefix.\r
  47    */\r
  48   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  49 \r
  50   /**\r
  51    * Field _nsURI.\r
  52    */\r
  53   private java.lang.String _nsURI;\r
  54 \r
  55   /**\r
  56    * Field _xmlName.\r
  57    */\r
  58   private java.lang.String _xmlName;\r
  59 \r
  60   // ----------------/\r
  61   // - Constructors -/\r
  62   // ----------------/\r
  63 \r
  64   public AlcodonDescriptor()\r
  65   {\r
  66     super();\r
  67     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  68     _xmlName = "alcodon";\r
  69     _elementDefinition = true;\r
  70     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  71     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  72     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  73     // -- initialize attribute descriptors\r
  74 \r
  75     // -- _pos1\r
  76     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  77             java.lang.Long.TYPE, "_pos1", "pos1",\r
  78             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  79     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  80     {\r
  81       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  82               throws IllegalStateException\r
  83       {\r
  84         Alcodon target = (Alcodon) object;\r
  85         if (!target.hasPos1())\r
  86         {\r
  87           return null;\r
  88         }\r
  89         return new java.lang.Long(target.getPos1());\r
  90       }\r
  91 \r
  92       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  93               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  94       {\r
  95         try\r
  96         {\r
  97           Alcodon target = (Alcodon) object;\r
  98           // if null, use delete method for optional primitives\r
  99           if (value == null)\r
 100           {\r
 101             target.deletePos1();\r
 102             return;\r
 103           }\r
 104           target.setPos1(((java.lang.Long) value).longValue());\r
 105         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 106         {\r
 107           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 108         }\r
 109       }\r
 110 \r
 111       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 112       {\r
 113         return null;\r
 114       }\r
 115     };\r
 116     desc.setHandler(handler);\r
 117     desc.setMultivalued(false);\r
 118     addFieldDescriptor(desc);\r
 119 \r
 120     // -- validation code for: _pos1\r
 121     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 122     { // -- local scope\r
 123       org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;\r
 124       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();\r
 125       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 126     }\r
 127     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 128     // -- _pos2\r
 129     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 130             java.lang.Long.TYPE, "_pos2", "pos2",\r
 131             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 132     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 133     {\r
 134       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 135               throws IllegalStateException\r
 136       {\r
 137         Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 138         if (!target.hasPos2())\r
 139         {\r
 140           return null;\r
 141         }\r
 142         return new java.lang.Long(target.getPos2());\r
 143       }\r
 144 \r
 145       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 146               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 147       {\r
 148         try\r
 149         {\r
 150           Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 151           // if null, use delete method for optional primitives\r
 152           if (value == null)\r
 153           {\r
 154             target.deletePos2();\r
 155             return;\r
 156           }\r
 157           target.setPos2(((java.lang.Long) value).longValue());\r
 158         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 159         {\r
 160           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 161         }\r
 162       }\r
 163 \r
 164       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 165       {\r
 166         return null;\r
 167       }\r
 168     };\r
 169     desc.setHandler(handler);\r
 170     desc.setMultivalued(false);\r
 171     addFieldDescriptor(desc);\r
 172 \r
 173     // -- validation code for: _pos2\r
 174     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 175     { // -- local scope\r
 176       org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;\r
 177       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();\r
 178       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 179     }\r
 180     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 181     // -- _pos3\r
 182     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 183             java.lang.Long.TYPE, "_pos3", "pos3",\r
 184             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 185     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 186     {\r
 187       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 188               throws IllegalStateException\r
 189       {\r
 190         Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 191         if (!target.hasPos3())\r
 192         {\r
 193           return null;\r
 194         }\r
 195         return new java.lang.Long(target.getPos3());\r
 196       }\r
 197 \r
 198       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 199               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 200       {\r
 201         try\r
 202         {\r
 203           Alcodon target = (Alcodon) object;\r
 204           // if null, use delete method for optional primitives\r
 205           if (value == null)\r
 206           {\r
 207             target.deletePos3();\r
 208             return;\r
 209           }\r
 210           target.setPos3(((java.lang.Long) value).longValue());\r
 211         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 212         {\r
 213           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 214         }\r
 215       }\r
 216 \r
 217       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 218       {\r
 219         return null;\r
 220       }\r
 221     };\r
 222     desc.setHandler(handler);\r
 223     desc.setMultivalued(false);\r
 224     addFieldDescriptor(desc);\r
 225 \r
 226     // -- validation code for: _pos3\r
 227     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 228     { // -- local scope\r
 229       org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator typeValidator;\r
 230       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.LongValidator();\r
 231       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 232     }\r
 233     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 234     // -- initialize element descriptors\r
 235 \r
 236   }\r
 237 \r
 238   // -----------/\r
 239   // - Methods -/\r
 240   // -----------/\r
 241 \r
 242   /**\r
 243    * Method getAccessMode.\r
 244    * \r
 245    * @return the access mode specified for this class.\r
 246    */\r
 247   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 248   {\r
 249     return null;\r
 250   }\r
 251 \r
 252   /**\r
 253    * Method getIdentity.\r
 254    * \r
 255    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 256    */\r
 257   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 258   {\r
 259     return super.getIdentity();\r
 260   }\r
 261 \r
 262   /**\r
 263    * Method getJavaClass.\r
 264    * \r
 265    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 266    */\r
 267   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 268   {\r
 269     return jalview.schemabinding.version2.Alcodon.class;\r
 270   }\r
 271 \r
 272   /**\r
 273    * Method getNameSpacePrefix.\r
 274    * \r
 275    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 276    */\r
 277   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 278   {\r
 279     return _nsPrefix;\r
 280   }\r
 281 \r
 282   /**\r
 283    * Method getNameSpaceURI.\r
 284    * \r
 285    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 286    */\r
 287   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 288   {\r
 289     return _nsURI;\r
 290   }\r
 291 \r
 292   /**\r
 293    * Method getValidator.\r
 294    * \r
 295    * @return a specific validator for the class described by this\r
 296    *         ClassDescriptor.\r
 297    */\r
 298   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 299   {\r
 300     return this;\r
 301   }\r
 302 \r
 303   /**\r
 304    * Method getXMLName.\r
 305    * \r
 306    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 307    */\r
 308   public java.lang.String getXMLName()\r
 309   {\r
 310     return _xmlName;\r
 311   }\r
 312 \r
 313   /**\r
 314    * Method isElementDefinition.\r
 315    * \r
 316    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 317    *         element or element with anonymous type definition.\r
 318    */\r
 319   public boolean isElementDefinition()\r
 320   {\r
 321     return _elementDefinition;\r
 322   }\r
 323 \r
 324 }\r