src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AnnotationColoursDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21 // ---------------------------------/\r
  22 // - Imported classes and packages -/\r
  23 // ---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class AnnotationColoursDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class AnnotationColoursDescriptor extends\r
  33         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  34 {\r
  35 \r
  36   // --------------------------/\r
  37   // - Class/Member Variables -/\r
  38   // --------------------------/\r
  39 \r
  40   /**\r
  41    * Field _elementDefinition.\r
  42    */\r
  43   private boolean _elementDefinition;\r
  44 \r
  45   /**\r
  46    * Field _nsPrefix.\r
  47    */\r
  48   private java.lang.String _nsPrefix;\r
  49 \r
  50   /**\r
  51    * Field _nsURI.\r
  52    */\r
  53   private java.lang.String _nsURI;\r
  54 \r
  55   /**\r
  56    * Field _xmlName.\r
  57    */\r
  58   private java.lang.String _xmlName;\r
  59 \r
  60   // ----------------/\r
  61   // - Constructors -/\r
  62   // ----------------/\r
  63 \r
  64   public AnnotationColoursDescriptor()\r
  65   {\r
  66     super();\r
  67     _nsURI = "www.jalview.org";\r
  68     _xmlName = "AnnotationColours";\r
  69     _elementDefinition = true;\r
  70     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  71     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;\r
  72     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  73     // -- initialize attribute descriptors\r
  74 \r
  75     // -- _aboveThreshold\r
  76     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
  77             java.lang.Integer.TYPE, "_aboveThreshold", "aboveThreshold",\r
  78             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  79     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  80     {\r
  81       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  82               throws IllegalStateException\r
  83       {\r
  84         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
  85         if (!target.hasAboveThreshold())\r
  86         {\r
  87           return null;\r
  88         }\r
  89         return new java.lang.Integer(target.getAboveThreshold());\r
  90       }\r
  91 \r
  92       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  93               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  94       {\r
  95         try\r
  96         {\r
  97           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
  98           // if null, use delete method for optional primitives\r
  99           if (value == null)\r
 100           {\r
 101             target.deleteAboveThreshold();\r
 102             return;\r
 103           }\r
 104           target.setAboveThreshold(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 105         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 106         {\r
 107           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 108         }\r
 109       }\r
 110 \r
 111       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 112       {\r
 113         return null;\r
 114       }\r
 115     };\r
 116     desc.setHandler(handler);\r
 117     desc.setMultivalued(false);\r
 118     addFieldDescriptor(desc);\r
 119 \r
 120     // -- validation code for: _aboveThreshold\r
 121     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 122     { // -- local scope\r
 123       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 124       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 125       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 126       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 127       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 128     }\r
 129     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 130     // -- _annotation\r
 131     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 132             java.lang.String.class, "_annotation", "annotation",\r
 133             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 134     desc.setImmutable(true);\r
 135     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 136     {\r
 137       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 138               throws IllegalStateException\r
 139       {\r
 140         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 141         return target.getAnnotation();\r
 142       }\r
 143 \r
 144       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 145               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 146       {\r
 147         try\r
 148         {\r
 149           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 150           target.setAnnotation((java.lang.String) value);\r
 151         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 152         {\r
 153           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 154         }\r
 155       }\r
 156 \r
 157       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 158       {\r
 159         return null;\r
 160       }\r
 161     };\r
 162     desc.setHandler(handler);\r
 163     desc.setMultivalued(false);\r
 164     addFieldDescriptor(desc);\r
 165 \r
 166     // -- validation code for: _annotation\r
 167     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 168     { // -- local scope\r
 169       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 170       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 171       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 172       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 173     }\r
 174     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 175     // -- _minColour\r
 176     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 177             java.lang.Integer.TYPE, "_minColour", "minColour",\r
 178             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 179     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 180     {\r
 181       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 182               throws IllegalStateException\r
 183       {\r
 184         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 185         if (!target.hasMinColour())\r
 186         {\r
 187           return null;\r
 188         }\r
 189         return new java.lang.Integer(target.getMinColour());\r
 190       }\r
 191 \r
 192       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 193               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 194       {\r
 195         try\r
 196         {\r
 197           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 198           // if null, use delete method for optional primitives\r
 199           if (value == null)\r
 200           {\r
 201             target.deleteMinColour();\r
 202             return;\r
 203           }\r
 204           target.setMinColour(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 205         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 206         {\r
 207           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 208         }\r
 209       }\r
 210 \r
 211       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 212       {\r
 213         return null;\r
 214       }\r
 215     };\r
 216     desc.setHandler(handler);\r
 217     desc.setMultivalued(false);\r
 218     addFieldDescriptor(desc);\r
 219 \r
 220     // -- validation code for: _minColour\r
 221     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 222     { // -- local scope\r
 223       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 224       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 225       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 226       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 227       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 228     }\r
 229     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 230     // -- _maxColour\r
 231     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 232             java.lang.Integer.TYPE, "_maxColour", "maxColour",\r
 233             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 234     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 235     {\r
 236       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 237               throws IllegalStateException\r
 238       {\r
 239         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 240         if (!target.hasMaxColour())\r
 241         {\r
 242           return null;\r
 243         }\r
 244         return new java.lang.Integer(target.getMaxColour());\r
 245       }\r
 246 \r
 247       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 248               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 249       {\r
 250         try\r
 251         {\r
 252           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 253           // if null, use delete method for optional primitives\r
 254           if (value == null)\r
 255           {\r
 256             target.deleteMaxColour();\r
 257             return;\r
 258           }\r
 259           target.setMaxColour(((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 260         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 261         {\r
 262           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 263         }\r
 264       }\r
 265 \r
 266       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 267       {\r
 268         return null;\r
 269       }\r
 270     };\r
 271     desc.setHandler(handler);\r
 272     desc.setMultivalued(false);\r
 273     addFieldDescriptor(desc);\r
 274 \r
 275     // -- validation code for: _maxColour\r
 276     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 277     { // -- local scope\r
 278       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 279       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 280       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 281       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 282       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 283     }\r
 284     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 285     // -- _colourScheme\r
 286     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 287             java.lang.String.class, "_colourScheme", "colourScheme",\r
 288             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 289     desc.setImmutable(true);\r
 290     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 291     {\r
 292       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 293               throws IllegalStateException\r
 294       {\r
 295         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 296         return target.getColourScheme();\r
 297       }\r
 298 \r
 299       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 300               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 301       {\r
 302         try\r
 303         {\r
 304           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 305           target.setColourScheme((java.lang.String) value);\r
 306         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 307         {\r
 308           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 309         }\r
 310       }\r
 311 \r
 312       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 313       {\r
 314         return null;\r
 315       }\r
 316     };\r
 317     desc.setHandler(handler);\r
 318     desc.setMultivalued(false);\r
 319     addFieldDescriptor(desc);\r
 320 \r
 321     // -- validation code for: _colourScheme\r
 322     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 323     { // -- local scope\r
 324       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 325       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 326       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 327       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 328     }\r
 329     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 330     // -- _threshold\r
 331     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(\r
 332             java.lang.Float.TYPE, "_threshold", "threshold",\r
 333             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 334     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 335     {\r
 336       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 337               throws IllegalStateException\r
 338       {\r
 339         AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 340         if (!target.hasThreshold())\r
 341         {\r
 342           return null;\r
 343         }\r
 344         return new java.lang.Float(target.getThreshold());\r
 345       }\r
 346 \r
 347       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 348               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 349       {\r
 350         try\r
 351         {\r
 352           AnnotationColours target = (AnnotationColours) object;\r
 353           // if null, use delete method for optional primitives\r
 354           if (value == null)\r
 355           {\r
 356             target.deleteThreshold();\r
 357             return;\r
 358           }\r
 359           target.setThreshold(((java.lang.Float) value).floatValue());\r
 360         } catch (java.lang.Exception ex)\r
 361         {\r
 362           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 363         }\r
 364       }\r
 365 \r
 366       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 367       {\r
 368         return null;\r
 369       }\r
 370     };\r
 371     desc.setHandler(handler);\r
 372     desc.setMultivalued(false);\r
 373     addFieldDescriptor(desc);\r
 374 \r
 375     // -- validation code for: _threshold\r
 376     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 377     { // -- local scope\r
 378       org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;\r
 379       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();\r
 380       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 381       typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);\r
 382       typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);\r
 383     }\r
 384     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 385     // -- initialize element descriptors\r
 386 \r
 387   }\r
 388 \r
 389   // -----------/\r
 390   // - Methods -/\r
 391   // -----------/\r
 392 \r
 393   /**\r
 394    * Method getAccessMode.\r
 395    * \r
 396    * @return the access mode specified for this class.\r
 397    */\r
 398   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 399   {\r
 400     return null;\r
 401   }\r
 402 \r
 403   /**\r
 404    * Method getIdentity.\r
 405    * \r
 406    * @return the identity field, null if this class has no identity.\r
 407    */\r
 408   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 409   {\r
 410     return super.getIdentity();\r
 411   }\r
 412 \r
 413   /**\r
 414    * Method getJavaClass.\r
 415    * \r
 416    * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 417    */\r
 418   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 419   {\r
 420     return jalview.schemabinding.version2.AnnotationColours.class;\r
 421   }\r
 422 \r
 423   /**\r
 424    * Method getNameSpacePrefix.\r
 425    * \r
 426    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 427    */\r
 428   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 429   {\r
 430     return _nsPrefix;\r
 431   }\r
 432 \r
 433   /**\r
 434    * Method getNameSpaceURI.\r
 435    * \r
 436    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.\r
 437    */\r
 438   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 439   {\r
 440     return _nsURI;\r
 441   }\r
 442 \r
 443   /**\r
 444    * Method getValidator.\r
 445    * \r
 446    * @return a specific validator for the class described by this\r
 447    *         ClassDescriptor.\r
 448    */\r
 449   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 450   {\r
 451     return this;\r
 452   }\r
 453 \r
 454   /**\r
 455    * Method getXMLName.\r
 456    * \r
 457    * @return the XML Name for the Class being described.\r
 458    */\r
 459   public java.lang.String getXMLName()\r
 460   {\r
 461     return _xmlName;\r
 462   }\r
 463 \r
 464   /**\r
 465    * Method isElementDefinition.\r
 466    * \r
 467    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global\r
 468    *         element or element with anonymous type definition.\r
 469    */\r
 470   public boolean isElementDefinition()\r
 471   {\r
 472     return _elementDefinition;\r
 473   }\r
 474 \r
 475 }\r