src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/AnnotationDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import jalview.schemabinding.version2.Annotation;\r
  15 \r
  16 /**\r
  17  * Class AnnotationDescriptor.\r
  18  * \r
  19  * @version $Revision$ $Date$\r
  20  */\r
  21 public class AnnotationDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  22 \r
  23 \r
  24       //--------------------------/\r
  25      //- Class/Member Variables -/\r
  26     //--------------------------/\r
  27 \r
  28     /**\r
  29      * Field _elementDefinition.\r
  30      */\r
  31     private boolean _elementDefinition;\r
  32 \r
  33     /**\r
  34      * Field _nsPrefix.\r
  35      */\r
  36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  37 \r
  38     /**\r
  39      * Field _nsURI.\r
  40      */\r
  41     private java.lang.String _nsURI;\r
  42 \r
  43     /**\r
  44      * Field _xmlName.\r
  45      */\r
  46     private java.lang.String _xmlName;\r
  47 \r
  48     /**\r
  49      * Field _identity.\r
  50      */\r
  51     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor _identity;\r
  52 \r
  53 \r
  54       //----------------/\r
  55      //- Constructors -/\r
  56     //----------------/\r
  57 \r
  58     public AnnotationDescriptor() {\r
  59         super();\r
  60         _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";\r
  61         _xmlName = "Annotation";\r
  62         _elementDefinition = true;\r
  63         \r
  64         //-- set grouping compositor\r
  65         setCompositorAsSequence();\r
  66         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  67         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  68         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  69         //-- initialize attribute descriptors\r
  70         \r
  71         //-- _graph\r
  72         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_graph", "graph", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  73         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  74             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  75                 throws IllegalStateException\r
  76             {\r
  77                 Annotation target = (Annotation) object;\r
  78                 if (!target.hasGraph()) { return null; }\r
  79                 return (target.getGraph() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
  80             }\r
  81             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  82                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  83             {\r
  84                 try {\r
  85                     Annotation target = (Annotation) object;\r
  86                     // ignore null values for non optional primitives\r
  87                     if (value == null) { return; }\r
  88                     \r
  89                     target.setGraph( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
  90                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  91                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  92                 }\r
  93             }\r
  94             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
  95                 return null;\r
  96             }\r
  97         };\r
  98         desc.setHandler(handler);\r
  99         desc.setRequired(true);\r
 100         desc.setMultivalued(false);\r
 101         addFieldDescriptor(desc);\r
 102         \r
 103         //-- validation code for: _graph\r
 104         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 105         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 106         { //-- local scope\r
 107             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 108             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 109             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 110         }\r
 111         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 112         //-- _graphType\r
 113         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_graphType", "graphType", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 114         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 115             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 116                 throws IllegalStateException\r
 117             {\r
 118                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 119                 if (!target.hasGraphType()) { return null; }\r
 120                 return new java.lang.Integer(target.getGraphType());\r
 121             }\r
 122             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 123                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 124             {\r
 125                 try {\r
 126                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 127                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 128                     if (value == null) {\r
 129                         target.deleteGraphType();\r
 130                         return;\r
 131                     }\r
 132                     target.setGraphType( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 133                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 134                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 135                 }\r
 136             }\r
 137             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 138                 return null;\r
 139             }\r
 140         };\r
 141         desc.setHandler(handler);\r
 142         desc.setMultivalued(false);\r
 143         addFieldDescriptor(desc);\r
 144         \r
 145         //-- validation code for: _graphType\r
 146         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 147         { //-- local scope\r
 148             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 149             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 150             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 151             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 152             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 153         }\r
 154         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 155         //-- _sequenceRef\r
 156         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_sequenceRef", "sequenceRef", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 157         desc.setImmutable(true);\r
 158         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 159             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 160                 throws IllegalStateException\r
 161             {\r
 162                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 163                 return target.getSequenceRef();\r
 164             }\r
 165             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 166                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 167             {\r
 168                 try {\r
 169                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 170                     target.setSequenceRef( (java.lang.String) value);\r
 171                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 172                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 173                 }\r
 174             }\r
 175             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 176                 return null;\r
 177             }\r
 178         };\r
 179         desc.setHandler(handler);\r
 180         desc.setMultivalued(false);\r
 181         addFieldDescriptor(desc);\r
 182         \r
 183         //-- validation code for: _sequenceRef\r
 184         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 185         { //-- local scope\r
 186             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 187             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 188             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 189             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 190         }\r
 191         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 192         //-- _graphColour\r
 193         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_graphColour", "graphColour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 194         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 195             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 196                 throws IllegalStateException\r
 197             {\r
 198                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 199                 if (!target.hasGraphColour()) { return null; }\r
 200                 return new java.lang.Integer(target.getGraphColour());\r
 201             }\r
 202             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 203                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 204             {\r
 205                 try {\r
 206                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 207                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 208                     if (value == null) {\r
 209                         target.deleteGraphColour();\r
 210                         return;\r
 211                     }\r
 212                     target.setGraphColour( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 213                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 214                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 215                 }\r
 216             }\r
 217             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 218                 return null;\r
 219             }\r
 220         };\r
 221         desc.setHandler(handler);\r
 222         desc.setMultivalued(false);\r
 223         addFieldDescriptor(desc);\r
 224         \r
 225         //-- validation code for: _graphColour\r
 226         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 227         { //-- local scope\r
 228             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 229             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 230             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 231             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 232             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 233         }\r
 234         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 235         //-- _graphGroup\r
 236         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_graphGroup", "graphGroup", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 237         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 238             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 239                 throws IllegalStateException\r
 240             {\r
 241                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 242                 if (!target.hasGraphGroup()) { return null; }\r
 243                 return new java.lang.Integer(target.getGraphGroup());\r
 244             }\r
 245             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 246                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 247             {\r
 248                 try {\r
 249                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 250                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 251                     if (value == null) {\r
 252                         target.deleteGraphGroup();\r
 253                         return;\r
 254                     }\r
 255                     target.setGraphGroup( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 256                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 257                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 258                 }\r
 259             }\r
 260             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 261                 return null;\r
 262             }\r
 263         };\r
 264         desc.setHandler(handler);\r
 265         desc.setMultivalued(false);\r
 266         addFieldDescriptor(desc);\r
 267         \r
 268         //-- validation code for: _graphGroup\r
 269         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 270         { //-- local scope\r
 271             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 272             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 273             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 274             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 275             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 276         }\r
 277         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 278         //-- _id\r
 279         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 280         desc.setImmutable(true);\r
 281         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 282             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 283                 throws IllegalStateException\r
 284             {\r
 285                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 286                 return target.getId();\r
 287             }\r
 288             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 289                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 290             {\r
 291                 try {\r
 292                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 293                     target.setId( (java.lang.String) value);\r
 294                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 295                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 296                 }\r
 297             }\r
 298             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 299                 return null;\r
 300             }\r
 301         };\r
 302         desc.setHandler(handler);\r
 303         desc.setMultivalued(false);\r
 304         addFieldDescriptor(desc);\r
 305         \r
 306         //-- validation code for: _id\r
 307         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 308         { //-- local scope\r
 309             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 310             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 311             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 312             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 313         }\r
 314         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 315         //-- _scoreOnly\r
 316         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_scoreOnly", "scoreOnly", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 317         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 318             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 319                 throws IllegalStateException\r
 320             {\r
 321                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 322                 if (!target.hasScoreOnly()) { return null; }\r
 323                 return (target.getScoreOnly() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 324             }\r
 325             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 326                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 327             {\r
 328                 try {\r
 329                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 330                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 331                     if (value == null) {\r
 332                         target.deleteScoreOnly();\r
 333                         return;\r
 334                     }\r
 335                     target.setScoreOnly( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 336                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 337                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 338                 }\r
 339             }\r
 340             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 341                 return null;\r
 342             }\r
 343         };\r
 344         desc.setHandler(handler);\r
 345         desc.setMultivalued(false);\r
 346         addFieldDescriptor(desc);\r
 347         \r
 348         //-- validation code for: _scoreOnly\r
 349         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 350         { //-- local scope\r
 351             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 352             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 353             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 354         }\r
 355         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 356         //-- _score\r
 357         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Double.TYPE, "_score", "score", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 358         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 359             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 360                 throws IllegalStateException\r
 361             {\r
 362                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 363                 if (!target.hasScore()) { return null; }\r
 364                 return new java.lang.Double(target.getScore());\r
 365             }\r
 366             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 367                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 368             {\r
 369                 try {\r
 370                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 371                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 372                     if (value == null) {\r
 373                         target.deleteScore();\r
 374                         return;\r
 375                     }\r
 376                     target.setScore( ((java.lang.Double) value).doubleValue());\r
 377                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 378                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 379                 }\r
 380             }\r
 381             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 382                 return null;\r
 383             }\r
 384         };\r
 385         desc.setHandler(handler);\r
 386         desc.setMultivalued(false);\r
 387         addFieldDescriptor(desc);\r
 388         \r
 389         //-- validation code for: _score\r
 390         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 391         { //-- local scope\r
 392             org.exolab.castor.xml.validators.DoubleValidator typeValidator;\r
 393             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.DoubleValidator();\r
 394             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 395             typeValidator.setMinInclusive(-1.7976931348623157E308);\r
 396             typeValidator.setMaxInclusive(1.7976931348623157E308);\r
 397         }\r
 398         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 399         //-- _visible\r
 400         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_visible", "visible", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 401         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 402             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 403                 throws IllegalStateException\r
 404             {\r
 405                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 406                 if (!target.hasVisible()) { return null; }\r
 407                 return (target.getVisible() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 408             }\r
 409             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 410                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 411             {\r
 412                 try {\r
 413                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 414                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 415                     if (value == null) {\r
 416                         target.deleteVisible();\r
 417                         return;\r
 418                     }\r
 419                     target.setVisible( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 420                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 421                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 422                 }\r
 423             }\r
 424             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 425                 return null;\r
 426             }\r
 427         };\r
 428         desc.setHandler(handler);\r
 429         desc.setMultivalued(false);\r
 430         addFieldDescriptor(desc);\r
 431         \r
 432         //-- validation code for: _visible\r
 433         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 434         { //-- local scope\r
 435             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 436             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 437             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 438         }\r
 439         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 440         //-- initialize element descriptors\r
 441         \r
 442         //-- _annotationElementList\r
 443         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement.class, "_annotationElementList", "annotationElement", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 444         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 445             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 446                 throws IllegalStateException\r
 447             {\r
 448                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 449                 return target.getAnnotationElement();\r
 450             }\r
 451             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 452                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 453             {\r
 454                 try {\r
 455                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 456                     target.addAnnotationElement( (jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement) value);\r
 457                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 458                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 459                 }\r
 460             }\r
 461             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 462                 try {\r
 463                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 464                     target.removeAllAnnotationElement();\r
 465                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 466                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 467                 }\r
 468             }\r
 469             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 470                 return new jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement();\r
 471             }\r
 472         };\r
 473         desc.setHandler(handler);\r
 474         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 475         desc.setMultivalued(true);\r
 476         addFieldDescriptor(desc);\r
 477         \r
 478         //-- validation code for: _annotationElementList\r
 479         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 480         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 481         { //-- local scope\r
 482         }\r
 483         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 484         //-- _label\r
 485         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_label", "label", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 486         desc.setImmutable(true);\r
 487         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 488             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 489                 throws IllegalStateException\r
 490             {\r
 491                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 492                 return target.getLabel();\r
 493             }\r
 494             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 495                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 496             {\r
 497                 try {\r
 498                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 499                     target.setLabel( (java.lang.String) value);\r
 500                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 501                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 502                 }\r
 503             }\r
 504             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 505                 return null;\r
 506             }\r
 507         };\r
 508         desc.setHandler(handler);\r
 509         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 510         desc.setRequired(true);\r
 511         desc.setMultivalued(false);\r
 512         addFieldDescriptor(desc);\r
 513         \r
 514         //-- validation code for: _label\r
 515         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 516         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 517         { //-- local scope\r
 518             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 519             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 520             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 521             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 522         }\r
 523         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 524         //-- _description\r
 525         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_description", "description", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 526         desc.setImmutable(true);\r
 527         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 528             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 529                 throws IllegalStateException\r
 530             {\r
 531                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 532                 return target.getDescription();\r
 533             }\r
 534             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 535                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 536             {\r
 537                 try {\r
 538                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 539                     target.setDescription( (java.lang.String) value);\r
 540                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 541                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 542                 }\r
 543             }\r
 544             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 545                 return null;\r
 546             }\r
 547         };\r
 548         desc.setHandler(handler);\r
 549         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 550         desc.setMultivalued(false);\r
 551         addFieldDescriptor(desc);\r
 552         \r
 553         //-- validation code for: _description\r
 554         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 555         { //-- local scope\r
 556             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 557             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 558             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 559             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 560         }\r
 561         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 562         //-- _thresholdLine\r
 563         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine.class, "_thresholdLine", "thresholdLine", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 564         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 565             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 566                 throws IllegalStateException\r
 567             {\r
 568                 Annotation target = (Annotation) object;\r
 569                 return target.getThresholdLine();\r
 570             }\r
 571             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 572                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 573             {\r
 574                 try {\r
 575                     Annotation target = (Annotation) object;\r
 576                     target.setThresholdLine( (jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine) value);\r
 577                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 578                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 579                 }\r
 580             }\r
 581             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 582                 return new jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine();\r
 583             }\r
 584         };\r
 585         desc.setHandler(handler);\r
 586         desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");\r
 587         desc.setMultivalued(false);\r
 588         addFieldDescriptor(desc);\r
 589         \r
 590         //-- validation code for: _thresholdLine\r
 591         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 592         { //-- local scope\r
 593         }\r
 594         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 595     }\r
 596 \r
 597 \r
 598       //-----------/\r
 599      //- Methods -/\r
 600     //-----------/\r
 601 \r
 602     /**\r
 603      * Method getAccessMode.\r
 604      * \r
 605      * @return the access mode specified for this class.\r
 606      */\r
 607     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 608     ) {\r
 609         return null;\r
 610     }\r
 611 \r
 612     /**\r
 613      * Method getIdentity.\r
 614      * \r
 615      * @return the identity field, null if this class has no\r
 616      * identity.\r
 617      */\r
 618     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 619     ) {\r
 620         return _identity;\r
 621     }\r
 622 \r
 623     /**\r
 624      * Method getJavaClass.\r
 625      * \r
 626      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 627      */\r
 628     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 629     ) {\r
 630         return jalview.schemabinding.version2.Annotation.class;\r
 631     }\r
 632 \r
 633     /**\r
 634      * Method getNameSpacePrefix.\r
 635      * \r
 636      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 637      */\r
 638     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 639     ) {\r
 640         return _nsPrefix;\r
 641     }\r
 642 \r
 643     /**\r
 644      * Method getNameSpaceURI.\r
 645      * \r
 646      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 647      * unmarshaling as XML.\r
 648      */\r
 649     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 650     ) {\r
 651         return _nsURI;\r
 652     }\r
 653 \r
 654     /**\r
 655      * Method getValidator.\r
 656      * \r
 657      * @return a specific validator for the class described by this\r
 658      * ClassDescriptor.\r
 659      */\r
 660     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 661     ) {\r
 662         return this;\r
 663     }\r
 664 \r
 665     /**\r
 666      * Method getXMLName.\r
 667      * \r
 668      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 669      */\r
 670     public java.lang.String getXMLName(\r
 671     ) {\r
 672         return _xmlName;\r
 673     }\r
 674 \r
 675     /**\r
 676      * Method isElementDefinition.\r
 677      * \r
 678      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 679      * of a global\r
 680      * element or element with anonymous type definition.\r
 681      */\r
 682     public boolean isElementDefinition(\r
 683     ) {\r
 684         return _elementDefinition;\r
 685     }\r
 686 \r
 687 }\r