modified castor-1.1 library and refactored uk.ac.vamsas
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / descriptors / FeatureDescriptor.java
1 /*\r
2  * This class was automatically generated with \r
3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
4  * Schema.\r
5  * $Id$\r
6  */\r
7 \r
8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
9 \r
10   //---------------------------------/\r
11  //- Imported classes and packages -/\r
12 //---------------------------------/\r
13 \r
14 import jalview.schemabinding.version2.Feature;\r
15 \r
16 /**\r
17  * Class FeatureDescriptor.\r
18  * \r
19  * @version $Revision$ $Date$\r
20  */\r
21 public class FeatureDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
22 \r
23 \r
24       //--------------------------/\r
25      //- Class/Member Variables -/\r
26     //--------------------------/\r
27 \r
28     /**\r
29      * Field _elementDefinition.\r
30      */\r
31     private boolean _elementDefinition;\r
32 \r
33     /**\r
34      * Field _nsPrefix.\r
35      */\r
36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
37 \r
38     /**\r
39      * Field _nsURI.\r
40      */\r
41     private java.lang.String _nsURI;\r
42 \r
43     /**\r
44      * Field _xmlName.\r
45      */\r
46     private java.lang.String _xmlName;\r
47 \r
48     /**\r
49      * Field _identity.\r
50      */\r
51     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor _identity;\r
52 \r
53 \r
54       //----------------/\r
55      //- Constructors -/\r
56     //----------------/\r
57 \r
58     public FeatureDescriptor() {\r
59         super();\r
60         _nsURI = "www.jalview.org";\r
61         _xmlName = "feature";\r
62         _elementDefinition = false;\r
63         \r
64         //-- set grouping compositor\r
65         setCompositorAsSequence();\r
66         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
67         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
68         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
69         //-- initialize attribute descriptors\r
70         \r
71         //-- _begin\r
72         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_begin", "begin", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
73         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
74             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
75                 throws IllegalStateException\r
76             {\r
77                 Feature target = (Feature) object;\r
78                 if (!target.hasBegin()) { return null; }\r
79                 return new java.lang.Integer(target.getBegin());\r
80             }\r
81             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
82                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
83             {\r
84                 try {\r
85                     Feature target = (Feature) object;\r
86                     // ignore null values for non optional primitives\r
87                     if (value == null) { return; }\r
88                     \r
89                     target.setBegin( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
90                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
91                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
92                 }\r
93             }\r
94             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
95                 return null;\r
96             }\r
97         };\r
98         desc.setHandler(handler);\r
99         desc.setRequired(true);\r
100         desc.setMultivalued(false);\r
101         addFieldDescriptor(desc);\r
102         \r
103         //-- validation code for: _begin\r
104         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
105         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
106         { //-- local scope\r
107             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
108             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
109             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
110             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
111             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
112         }\r
113         desc.setValidator(fieldValidator);\r
114         //-- _end\r
115         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_end", "end", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
116         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
117             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
118                 throws IllegalStateException\r
119             {\r
120                 Feature target = (Feature) object;\r
121                 if (!target.hasEnd()) { return null; }\r
122                 return new java.lang.Integer(target.getEnd());\r
123             }\r
124             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
125                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
126             {\r
127                 try {\r
128                     Feature target = (Feature) object;\r
129                     // ignore null values for non optional primitives\r
130                     if (value == null) { return; }\r
131                     \r
132                     target.setEnd( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
133                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
134                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
135                 }\r
136             }\r
137             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
138                 return null;\r
139             }\r
140         };\r
141         desc.setHandler(handler);\r
142         desc.setRequired(true);\r
143         desc.setMultivalued(false);\r
144         addFieldDescriptor(desc);\r
145         \r
146         //-- validation code for: _end\r
147         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
148         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
149         { //-- local scope\r
150             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
151             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
152             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
153             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
154             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
155         }\r
156         desc.setValidator(fieldValidator);\r
157         //-- _type\r
158         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_type", "type", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
159         desc.setImmutable(true);\r
160         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
161             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
162                 throws IllegalStateException\r
163             {\r
164                 Feature target = (Feature) object;\r
165                 return target.getType();\r
166             }\r
167             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
168                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
169             {\r
170                 try {\r
171                     Feature target = (Feature) object;\r
172                     target.setType( (java.lang.String) value);\r
173                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
174                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
175                 }\r
176             }\r
177             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
178                 return null;\r
179             }\r
180         };\r
181         desc.setHandler(handler);\r
182         desc.setRequired(true);\r
183         desc.setMultivalued(false);\r
184         addFieldDescriptor(desc);\r
185         \r
186         //-- validation code for: _type\r
187         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
188         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
189         { //-- local scope\r
190             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
191             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
192             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
193             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
194         }\r
195         desc.setValidator(fieldValidator);\r
196         //-- _description\r
197         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_description", "description", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
198         desc.setImmutable(true);\r
199         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
200             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
201                 throws IllegalStateException\r
202             {\r
203                 Feature target = (Feature) object;\r
204                 return target.getDescription();\r
205             }\r
206             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
207                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
208             {\r
209                 try {\r
210                     Feature target = (Feature) object;\r
211                     target.setDescription( (java.lang.String) value);\r
212                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
213                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
214                 }\r
215             }\r
216             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
217                 return null;\r
218             }\r
219         };\r
220         desc.setHandler(handler);\r
221         desc.setMultivalued(false);\r
222         addFieldDescriptor(desc);\r
223         \r
224         //-- validation code for: _description\r
225         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
226         { //-- local scope\r
227             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
228             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
229             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
230             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
231         }\r
232         desc.setValidator(fieldValidator);\r
233         //-- _status\r
234         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_status", "status", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
235         desc.setImmutable(true);\r
236         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
237             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
238                 throws IllegalStateException\r
239             {\r
240                 Feature target = (Feature) object;\r
241                 return target.getStatus();\r
242             }\r
243             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
244                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
245             {\r
246                 try {\r
247                     Feature target = (Feature) object;\r
248                     target.setStatus( (java.lang.String) value);\r
249                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
250                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
251                 }\r
252             }\r
253             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
254                 return null;\r
255             }\r
256         };\r
257         desc.setHandler(handler);\r
258         desc.setMultivalued(false);\r
259         addFieldDescriptor(desc);\r
260         \r
261         //-- validation code for: _status\r
262         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
263         { //-- local scope\r
264             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
265             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
266             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
267             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
268         }\r
269         desc.setValidator(fieldValidator);\r
270         //-- _featureGroup\r
271         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_featureGroup", "featureGroup", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
272         desc.setImmutable(true);\r
273         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
274             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
275                 throws IllegalStateException\r
276             {\r
277                 Feature target = (Feature) object;\r
278                 return target.getFeatureGroup();\r
279             }\r
280             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
281                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
282             {\r
283                 try {\r
284                     Feature target = (Feature) object;\r
285                     target.setFeatureGroup( (java.lang.String) value);\r
286                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
287                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
288                 }\r
289             }\r
290             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
291                 return null;\r
292             }\r
293         };\r
294         desc.setHandler(handler);\r
295         desc.setMultivalued(false);\r
296         addFieldDescriptor(desc);\r
297         \r
298         //-- validation code for: _featureGroup\r
299         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
300         { //-- local scope\r
301             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
302             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
303             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
304             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
305         }\r
306         desc.setValidator(fieldValidator);\r
307         //-- _score\r
308         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Float.TYPE, "_score", "score", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
309         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
310             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
311                 throws IllegalStateException\r
312             {\r
313                 Feature target = (Feature) object;\r
314                 if (!target.hasScore()) { return null; }\r
315                 return new java.lang.Float(target.getScore());\r
316             }\r
317             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
318                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
319             {\r
320                 try {\r
321                     Feature target = (Feature) object;\r
322                     // if null, use delete method for optional primitives \r
323                     if (value == null) {\r
324                         target.deleteScore();\r
325                         return;\r
326                     }\r
327                     target.setScore( ((java.lang.Float) value).floatValue());\r
328                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
329                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
330                 }\r
331             }\r
332             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
333                 return null;\r
334             }\r
335         };\r
336         desc.setHandler(handler);\r
337         desc.setMultivalued(false);\r
338         addFieldDescriptor(desc);\r
339         \r
340         //-- validation code for: _score\r
341         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
342         { //-- local scope\r
343             org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;\r
344             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();\r
345             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
346             typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);\r
347             typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);\r
348         }\r
349         desc.setValidator(fieldValidator);\r
350         //-- initialize element descriptors\r
351         \r
352         //-- _otherDataList\r
353         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.OtherData.class, "_otherDataList", "otherData", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
354         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
355             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
356                 throws IllegalStateException\r
357             {\r
358                 Feature target = (Feature) object;\r
359                 return target.getOtherData();\r
360             }\r
361             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
362                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
363             {\r
364                 try {\r
365                     Feature target = (Feature) object;\r
366                     target.addOtherData( (jalview.schemabinding.version2.OtherData) value);\r
367                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
368                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
369                 }\r
370             }\r
371             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
372                 try {\r
373                     Feature target = (Feature) object;\r
374                     target.removeAllOtherData();\r
375                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
376                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
377                 }\r
378             }\r
379             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
380                 return new jalview.schemabinding.version2.OtherData();\r
381             }\r
382         };\r
383         desc.setHandler(handler);\r
384         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
385         desc.setMultivalued(true);\r
386         addFieldDescriptor(desc);\r
387         \r
388         //-- validation code for: _otherDataList\r
389         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
390         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
391         { //-- local scope\r
392         }\r
393         desc.setValidator(fieldValidator);\r
394     }\r
395 \r
396 \r
397       //-----------/\r
398      //- Methods -/\r
399     //-----------/\r
400 \r
401     /**\r
402      * Method getAccessMode.\r
403      * \r
404      * @return the access mode specified for this class.\r
405      */\r
406     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
407     ) {\r
408         return null;\r
409     }\r
410 \r
411     /**\r
412      * Method getIdentity.\r
413      * \r
414      * @return the identity field, null if this class has no\r
415      * identity.\r
416      */\r
417     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
418     ) {\r
419         return _identity;\r
420     }\r
421 \r
422     /**\r
423      * Method getJavaClass.\r
424      * \r
425      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
426      */\r
427     public java.lang.Class getJavaClass(\r
428     ) {\r
429         return jalview.schemabinding.version2.Feature.class;\r
430     }\r
431 \r
432     /**\r
433      * Method getNameSpacePrefix.\r
434      * \r
435      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
436      */\r
437     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
438     ) {\r
439         return _nsPrefix;\r
440     }\r
441 \r
442     /**\r
443      * Method getNameSpaceURI.\r
444      * \r
445      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
446      * unmarshaling as XML.\r
447      */\r
448     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
449     ) {\r
450         return _nsURI;\r
451     }\r
452 \r
453     /**\r
454      * Method getValidator.\r
455      * \r
456      * @return a specific validator for the class described by this\r
457      * ClassDescriptor.\r
458      */\r
459     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
460     ) {\r
461         return this;\r
462     }\r
463 \r
464     /**\r
465      * Method getXMLName.\r
466      * \r
467      * @return the XML Name for the Class being described.\r
468      */\r
469     public java.lang.String getXMLName(\r
470     ) {\r
471         return _xmlName;\r
472     }\r
473 \r
474     /**\r
475      * Method isElementDefinition.\r
476      * \r
477      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
478      * of a global\r
479      * element or element with anonymous type definition.\r
480      */\r
481     public boolean isElementDefinition(\r
482     ) {\r
483         return _elementDefinition;\r
484     }\r
485 \r
486 }\r