src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/PdbidsDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)\r
   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21   //---------------------------------/\r
  22  //- Imported classes and packages -/\r
  23 //---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.Pdbids;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class PdbidsDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class PdbidsDescriptor extends jalview.schemabinding.version2.descriptors.PdbentryDescriptor {\r
  33 \r
  34 \r
  35       //--------------------------/\r
  36      //- Class/Member Variables -/\r
  37     //--------------------------/\r
  38 \r
  39     /**\r
  40      * Field _elementDefinition.\r
  41      */\r
  42     private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44     /**\r
  45      * Field _nsPrefix.\r
  46      */\r
  47     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49     /**\r
  50      * Field _nsURI.\r
  51      */\r
  52     private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54     /**\r
  55      * Field _xmlName.\r
  56      */\r
  57     private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59 \r
  60       //----------------/\r
  61      //- Constructors -/\r
  62     //----------------/\r
  63 \r
  64     public PdbidsDescriptor() {\r
  65         super();\r
  66         setExtendsWithoutFlatten(new jalview.schemabinding.version2.descriptors.PdbentryDescriptor());\r
  67         _nsURI = "www.jalview.org";\r
  68         _xmlName = "pdbids";\r
  69         _elementDefinition = true;\r
  70         \r
  71         //-- set grouping compositor\r
  72         setCompositorAsSequence();\r
  73         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  74         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  75         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  76         //-- initialize attribute descriptors\r
  77         \r
  78         //-- initialize element descriptors\r
  79         \r
  80         //-- _structureStateList\r
  81         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.schemabinding.version2.StructureState.class, "_structureStateList", "structureState", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
  82         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  83             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  84                 throws IllegalStateException\r
  85             {\r
  86                 Pdbids target = (Pdbids) object;\r
  87                 return target.getStructureState();\r
  88             }\r
  89             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  90                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  91             {\r
  92                 try {\r
  93                     Pdbids target = (Pdbids) object;\r
  94                     target.addStructureState( (jalview.schemabinding.version2.StructureState) value);\r
  95                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  96                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  97                 }\r
  98             }\r
  99             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 100                 try {\r
 101                     Pdbids target = (Pdbids) object;\r
 102                     target.removeAllStructureState();\r
 103                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 104                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 105                 }\r
 106             }\r
 107             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 108                 return new jalview.schemabinding.version2.StructureState();\r
 109             }\r
 110         };\r
 111         desc.setHandler(handler);\r
 112         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 113         desc.setMultivalued(true);\r
 114         addFieldDescriptor(desc);\r
 115         \r
 116         //-- validation code for: _structureStateList\r
 117         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 118         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 119         { //-- local scope\r
 120         }\r
 121         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 122     }\r
 123 \r
 124 \r
 125       //-----------/\r
 126      //- Methods -/\r
 127     //-----------/\r
 128 \r
 129     /**\r
 130      * Method getAccessMode.\r
 131      * \r
 132      * @return the access mode specified for this class.\r
 133      */\r
 134     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 135     ) {\r
 136         return null;\r
 137     }\r
 138 \r
 139     /**\r
 140      * Method getIdentity.\r
 141      * \r
 142      * @return the identity field, null if this class has no\r
 143      * identity.\r
 144      */\r
 145     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 146     ) {\r
 147         return super.getIdentity();\r
 148     }\r
 149 \r
 150     /**\r
 151      * Method getJavaClass.\r
 152      * \r
 153      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 154      */\r
 155     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 156     ) {\r
 157         return jalview.schemabinding.version2.Pdbids.class;\r
 158     }\r
 159 \r
 160     /**\r
 161      * Method getNameSpacePrefix.\r
 162      * \r
 163      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 164      */\r
 165     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 166     ) {\r
 167         return _nsPrefix;\r
 168     }\r
 169 \r
 170     /**\r
 171      * Method getNameSpaceURI.\r
 172      * \r
 173      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 174      * unmarshaling as XML.\r
 175      */\r
 176     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 177     ) {\r
 178         return _nsURI;\r
 179     }\r
 180 \r
 181     /**\r
 182      * Method getValidator.\r
 183      * \r
 184      * @return a specific validator for the class described by this\r
 185      * ClassDescriptor.\r
 186      */\r
 187     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 188     ) {\r
 189         return this;\r
 190     }\r
 191 \r
 192     /**\r
 193      * Method getXMLName.\r
 194      * \r
 195      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 196      */\r
 197     public java.lang.String getXMLName(\r
 198     ) {\r
 199         return _xmlName;\r
 200     }\r
 201 \r
 202     /**\r
 203      * Method isElementDefinition.\r
 204      * \r
 205      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 206      * of a global\r
 207      * element or element with anonymous type definition.\r
 208      */\r
 209     public boolean isElementDefinition(\r
 210     ) {\r
 211         return _elementDefinition;\r
 212     }\r
 213 \r
 214 }\r