src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/TreeDescriptor.java

   1 /*******************************************************************************
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $(date) The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  *******************************************************************************/
  21 /*
  22  * This class was automatically generated with
  23  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
  24  * Schema.
  25  * $Id$
  26  */
  27
  28 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
  29
  30 //---------------------------------/
  31 //- Imported classes and packages -/
  32 //---------------------------------/
  33
  34 import jalview.schemabinding.version2.Tree;
  35
  36 /**
  37  * Class TreeDescriptor.
  38  *
  39  * @version $Revision$ $Date$
  40  */
  41 public class TreeDescriptor extends
  42         org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl
  43 {
  44
  45   // --------------------------/
  46   // - Class/Member Variables -/
  47   // --------------------------/
  48
  49   /**
  50    * Field _elementDefinition.
  51    */
  52   private boolean _elementDefinition;
  53
  54   /**
  55    * Field _nsPrefix.
  56    */
  57   private java.lang.String _nsPrefix;
  58
  59   /**
  60    * Field _nsURI.
  61    */
  62   private java.lang.String _nsURI;
  63
  64   /**
  65    * Field _xmlName.
  66    */
  67   private java.lang.String _xmlName;
  68
  69   // ----------------/
  70   // - Constructors -/
  71   // ----------------/
  72
  73   public TreeDescriptor()
  74   {
  75     super();
  76     _nsURI = "www.jalview.org";
  77     _xmlName = "tree";
  78     _elementDefinition = true;
  79
  80     // -- set grouping compositor
  81     setCompositorAsSequence();
  82     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  83     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  84     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  85     // -- initialize attribute descriptors
  86
  87     // -- _fontName
  88     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  89             java.lang.String.class, "_fontName", "fontName",
  90             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  91     desc.setImmutable(true);
  92     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  93     {
  94       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  95               throws IllegalStateException
  96       {
  97         Tree target = (Tree) object;
  98         return target.getFontName();
  99       }
 100
 101       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 102               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 103       {
 104         try
 105         {
 106           Tree target = (Tree) object;
 107           target.setFontName((java.lang.String) value);
 108         } catch (java.lang.Exception ex)
 109         {
 110           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 111         }
 112       }
 113
 114       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 115       {
 116         return null;
 117       }
 118     };
 119     desc.setHandler(handler);
 120     desc.setMultivalued(false);
 121     addFieldDescriptor(desc);
 122
 123     // -- validation code for: _fontName
 124     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 125     { // -- local scope
 126       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 127       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 128       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 129       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 130     }
 131     desc.setValidator(fieldValidator);
 132     // -- _fontSize
 133     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 134             java.lang.Integer.TYPE, "_fontSize", "fontSize",
 135             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 136     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 137     {
 138       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 139               throws IllegalStateException
 140       {
 141         Tree target = (Tree) object;
 142         if (!target.hasFontSize())
 143         {
 144           return null;
 145         }
 146         return new java.lang.Integer(target.getFontSize());
 147       }
 148
 149       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 150               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 151       {
 152         try
 153         {
 154           Tree target = (Tree) object;
 155           // if null, use delete method for optional primitives
 156           if (value == null)
 157           {
 158             target.deleteFontSize();
 159             return;
 160           }
 161           target.setFontSize(((java.lang.Integer) value).intValue());
 162         } catch (java.lang.Exception ex)
 163         {
 164           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 165         }
 166       }
 167
 168       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 169       {
 170         return null;
 171       }
 172     };
 173     desc.setHandler(handler);
 174     desc.setMultivalued(false);
 175     addFieldDescriptor(desc);
 176
 177     // -- validation code for: _fontSize
 178     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 179     { // -- local scope
 180       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 181       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 182       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 183       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 184       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 185     }
 186     desc.setValidator(fieldValidator);
 187     // -- _fontStyle
 188     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 189             java.lang.Integer.TYPE, "_fontStyle", "fontStyle",
 190             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 191     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 192     {
 193       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 194               throws IllegalStateException
 195       {
 196         Tree target = (Tree) object;
 197         if (!target.hasFontStyle())
 198         {
 199           return null;
 200         }
 201         return new java.lang.Integer(target.getFontStyle());
 202       }
 203
 204       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 205               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 206       {
 207         try
 208         {
 209           Tree target = (Tree) object;
 210           // if null, use delete method for optional primitives
 211           if (value == null)
 212           {
 213             target.deleteFontStyle();
 214             return;
 215           }
 216           target.setFontStyle(((java.lang.Integer) value).intValue());
 217         } catch (java.lang.Exception ex)
 218         {
 219           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 220         }
 221       }
 222
 223       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 224       {
 225         return null;
 226       }
 227     };
 228     desc.setHandler(handler);
 229     desc.setMultivalued(false);
 230     addFieldDescriptor(desc);
 231
 232     // -- validation code for: _fontStyle
 233     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 234     { // -- local scope
 235       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 236       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 237       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 238       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 239       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 240     }
 241     desc.setValidator(fieldValidator);
 242     // -- _threshold
 243     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 244             java.lang.Float.TYPE, "_threshold", "threshold",
 245             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 246     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 247     {
 248       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 249               throws IllegalStateException
 250       {
 251         Tree target = (Tree) object;
 252         if (!target.hasThreshold())
 253         {
 254           return null;
 255         }
 256         return new java.lang.Float(target.getThreshold());
 257       }
 258
 259       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 260               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 261       {
 262         try
 263         {
 264           Tree target = (Tree) object;
 265           // if null, use delete method for optional primitives
 266           if (value == null)
 267           {
 268             target.deleteThreshold();
 269             return;
 270           }
 271           target.setThreshold(((java.lang.Float) value).floatValue());
 272         } catch (java.lang.Exception ex)
 273         {
 274           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 275         }
 276       }
 277
 278       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 279       {
 280         return null;
 281       }
 282     };
 283     desc.setHandler(handler);
 284     desc.setMultivalued(false);
 285     addFieldDescriptor(desc);
 286
 287     // -- validation code for: _threshold
 288     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 289     { // -- local scope
 290       org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator typeValidator;
 291       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.FloatValidator();
 292       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 293       typeValidator.setMinInclusive((float) -3.4028235E38);
 294       typeValidator.setMaxInclusive((float) 3.4028235E38);
 295     }
 296     desc.setValidator(fieldValidator);
 297     // -- _showBootstrap
 298     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 299             java.lang.Boolean.TYPE, "_showBootstrap", "showBootstrap",
 300             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 301     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 302     {
 303       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 304               throws IllegalStateException
 305       {
 306         Tree target = (Tree) object;
 307         if (!target.hasShowBootstrap())
 308         {
 309           return null;
 310         }
 311         return (target.getShowBootstrap() ? java.lang.Boolean.TRUE
 312                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 313       }
 314
 315       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 316               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 317       {
 318         try
 319         {
 320           Tree target = (Tree) object;
 321           // if null, use delete method for optional primitives
 322           if (value == null)
 323           {
 324             target.deleteShowBootstrap();
 325             return;
 326           }
 327           target.setShowBootstrap(((java.lang.Boolean) value)
 328                   .booleanValue());
 329         } catch (java.lang.Exception ex)
 330         {
 331           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 332         }
 333       }
 334
 335       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 336       {
 337         return null;
 338       }
 339     };
 340     desc.setHandler(handler);
 341     desc.setMultivalued(false);
 342     addFieldDescriptor(desc);
 343
 344     // -- validation code for: _showBootstrap
 345     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 346     { // -- local scope
 347       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 348       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 349       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 350     }
 351     desc.setValidator(fieldValidator);
 352     // -- _showDistances
 353     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 354             java.lang.Boolean.TYPE, "_showDistances", "showDistances",
 355             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 356     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 357     {
 358       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 359               throws IllegalStateException
 360       {
 361         Tree target = (Tree) object;
 362         if (!target.hasShowDistances())
 363         {
 364           return null;
 365         }
 366         return (target.getShowDistances() ? java.lang.Boolean.TRUE
 367                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 368       }
 369
 370       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 371               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 372       {
 373         try
 374         {
 375           Tree target = (Tree) object;
 376           // if null, use delete method for optional primitives
 377           if (value == null)
 378           {
 379             target.deleteShowDistances();
 380             return;
 381           }
 382           target.setShowDistances(((java.lang.Boolean) value)
 383                   .booleanValue());
 384         } catch (java.lang.Exception ex)
 385         {
 386           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 387         }
 388       }
 389
 390       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 391       {
 392         return null;
 393       }
 394     };
 395     desc.setHandler(handler);
 396     desc.setMultivalued(false);
 397     addFieldDescriptor(desc);
 398
 399     // -- validation code for: _showDistances
 400     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 401     { // -- local scope
 402       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 403       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 404       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 405     }
 406     desc.setValidator(fieldValidator);
 407     // -- _markUnlinked
 408     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 409             java.lang.Boolean.TYPE, "_markUnlinked", "markUnlinked",
 410             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 411     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 412     {
 413       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 414               throws IllegalStateException
 415       {
 416         Tree target = (Tree) object;
 417         if (!target.hasMarkUnlinked())
 418         {
 419           return null;
 420         }
 421         return (target.getMarkUnlinked() ? java.lang.Boolean.TRUE
 422                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 423       }
 424
 425       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 426               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 427       {
 428         try
 429         {
 430           Tree target = (Tree) object;
 431           // if null, use delete method for optional primitives
 432           if (value == null)
 433           {
 434             target.deleteMarkUnlinked();
 435             return;
 436           }
 437           target.setMarkUnlinked(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 438         } catch (java.lang.Exception ex)
 439         {
 440           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 441         }
 442       }
 443
 444       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 445       {
 446         return null;
 447       }
 448     };
 449     desc.setHandler(handler);
 450     desc.setMultivalued(false);
 451     addFieldDescriptor(desc);
 452
 453     // -- validation code for: _markUnlinked
 454     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 455     { // -- local scope
 456       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 457       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 458       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 459     }
 460     desc.setValidator(fieldValidator);
 461     // -- _fitToWindow
 462     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 463             java.lang.Boolean.TYPE, "_fitToWindow", "fitToWindow",
 464             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 465     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 466     {
 467       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 468               throws IllegalStateException
 469       {
 470         Tree target = (Tree) object;
 471         if (!target.hasFitToWindow())
 472         {
 473           return null;
 474         }
 475         return (target.getFitToWindow() ? java.lang.Boolean.TRUE
 476                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 477       }
 478
 479       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 480               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 481       {
 482         try
 483         {
 484           Tree target = (Tree) object;
 485           // if null, use delete method for optional primitives
 486           if (value == null)
 487           {
 488             target.deleteFitToWindow();
 489             return;
 490           }
 491           target.setFitToWindow(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 492         } catch (java.lang.Exception ex)
 493         {
 494           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 495         }
 496       }
 497
 498       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 499       {
 500         return null;
 501       }
 502     };
 503     desc.setHandler(handler);
 504     desc.setMultivalued(false);
 505     addFieldDescriptor(desc);
 506
 507     // -- validation code for: _fitToWindow
 508     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 509     { // -- local scope
 510       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 511       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 512       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 513     }
 514     desc.setValidator(fieldValidator);
 515     // -- _currentTree
 516     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 517             java.lang.Boolean.TYPE, "_currentTree", "currentTree",
 518             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 519     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 520     {
 521       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 522               throws IllegalStateException
 523       {
 524         Tree target = (Tree) object;
 525         if (!target.hasCurrentTree())
 526         {
 527           return null;
 528         }
 529         return (target.getCurrentTree() ? java.lang.Boolean.TRUE
 530                 : java.lang.Boolean.FALSE);
 531       }
 532
 533       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 534               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 535       {
 536         try
 537         {
 538           Tree target = (Tree) object;
 539           // if null, use delete method for optional primitives
 540           if (value == null)
 541           {
 542             target.deleteCurrentTree();
 543             return;
 544           }
 545           target.setCurrentTree(((java.lang.Boolean) value).booleanValue());
 546         } catch (java.lang.Exception ex)
 547         {
 548           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 549         }
 550       }
 551
 552       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 553       {
 554         return null;
 555       }
 556     };
 557     desc.setHandler(handler);
 558     desc.setMultivalued(false);
 559     addFieldDescriptor(desc);
 560
 561     // -- validation code for: _currentTree
 562     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 563     { // -- local scope
 564       org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;
 565       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();
 566       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 567     }
 568     desc.setValidator(fieldValidator);
 569     // -- _id
 570     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 571             java.lang.String.class, "_id", "id",
 572             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 573     super.setIdentity(desc);
 574     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 575     {
 576       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 577               throws IllegalStateException
 578       {
 579         Tree target = (Tree) object;
 580         return target.getId();
 581       }
 582
 583       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 584               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 585       {
 586         try
 587         {
 588           Tree target = (Tree) object;
 589           target.setId((java.lang.String) value);
 590         } catch (java.lang.Exception ex)
 591         {
 592           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 593         }
 594       }
 595
 596       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 597       {
 598         return new java.lang.String();
 599       }
 600     };
 601     desc.setHandler(handler);
 602     desc.setMultivalued(false);
 603     addFieldDescriptor(desc);
 604
 605     // -- validation code for: _id
 606     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 607     { // -- local scope
 608       org.exolab.castor.xml.validators.IdValidator typeValidator;
 609       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IdValidator();
 610       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 611     }
 612     desc.setValidator(fieldValidator);
 613     // -- _width
 614     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 615             java.lang.Integer.TYPE, "_width", "width",
 616             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 617     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 618     {
 619       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 620               throws IllegalStateException
 621       {
 622         Tree target = (Tree) object;
 623         if (!target.hasWidth())
 624         {
 625           return null;
 626         }
 627         return new java.lang.Integer(target.getWidth());
 628       }
 629
 630       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 631               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 632       {
 633         try
 634         {
 635           Tree target = (Tree) object;
 636           // if null, use delete method for optional primitives
 637           if (value == null)
 638           {
 639             target.deleteWidth();
 640             return;
 641           }
 642           target.setWidth(((java.lang.Integer) value).intValue());
 643         } catch (java.lang.Exception ex)
 644         {
 645           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 646         }
 647       }
 648
 649       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 650       {
 651         return null;
 652       }
 653     };
 654     desc.setHandler(handler);
 655     desc.setMultivalued(false);
 656     addFieldDescriptor(desc);
 657
 658     // -- validation code for: _width
 659     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 660     { // -- local scope
 661       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 662       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 663       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 664       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 665       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 666     }
 667     desc.setValidator(fieldValidator);
 668     // -- _height
 669     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 670             java.lang.Integer.TYPE, "_height", "height",
 671             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 672     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 673     {
 674       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 675               throws IllegalStateException
 676       {
 677         Tree target = (Tree) object;
 678         if (!target.hasHeight())
 679         {
 680           return null;
 681         }
 682         return new java.lang.Integer(target.getHeight());
 683       }
 684
 685       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 686               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 687       {
 688         try
 689         {
 690           Tree target = (Tree) object;
 691           // if null, use delete method for optional primitives
 692           if (value == null)
 693           {
 694             target.deleteHeight();
 695             return;
 696           }
 697           target.setHeight(((java.lang.Integer) value).intValue());
 698         } catch (java.lang.Exception ex)
 699         {
 700           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 701         }
 702       }
 703
 704       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 705       {
 706         return null;
 707       }
 708     };
 709     desc.setHandler(handler);
 710     desc.setMultivalued(false);
 711     addFieldDescriptor(desc);
 712
 713     // -- validation code for: _height
 714     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 715     { // -- local scope
 716       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 717       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 718       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 719       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 720       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 721     }
 722     desc.setValidator(fieldValidator);
 723     // -- _xpos
 724     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 725             java.lang.Integer.TYPE, "_xpos", "xpos",
 726             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 727     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 728     {
 729       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 730               throws IllegalStateException
 731       {
 732         Tree target = (Tree) object;
 733         if (!target.hasXpos())
 734         {
 735           return null;
 736         }
 737         return new java.lang.Integer(target.getXpos());
 738       }
 739
 740       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 741               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 742       {
 743         try
 744         {
 745           Tree target = (Tree) object;
 746           // if null, use delete method for optional primitives
 747           if (value == null)
 748           {
 749             target.deleteXpos();
 750             return;
 751           }
 752           target.setXpos(((java.lang.Integer) value).intValue());
 753         } catch (java.lang.Exception ex)
 754         {
 755           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 756         }
 757       }
 758
 759       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 760       {
 761         return null;
 762       }
 763     };
 764     desc.setHandler(handler);
 765     desc.setMultivalued(false);
 766     addFieldDescriptor(desc);
 767
 768     // -- validation code for: _xpos
 769     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 770     { // -- local scope
 771       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 772       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 773       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 774       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 775       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 776     }
 777     desc.setValidator(fieldValidator);
 778     // -- _ypos
 779     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 780             java.lang.Integer.TYPE, "_ypos", "ypos",
 781             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
 782     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 783     {
 784       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 785               throws IllegalStateException
 786       {
 787         Tree target = (Tree) object;
 788         if (!target.hasYpos())
 789         {
 790           return null;
 791         }
 792         return new java.lang.Integer(target.getYpos());
 793       }
 794
 795       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 796               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 797       {
 798         try
 799         {
 800           Tree target = (Tree) object;
 801           // if null, use delete method for optional primitives
 802           if (value == null)
 803           {
 804             target.deleteYpos();
 805             return;
 806           }
 807           target.setYpos(((java.lang.Integer) value).intValue());
 808         } catch (java.lang.Exception ex)
 809         {
 810           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 811         }
 812       }
 813
 814       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 815       {
 816         return null;
 817       }
 818     };
 819     desc.setHandler(handler);
 820     desc.setMultivalued(false);
 821     addFieldDescriptor(desc);
 822
 823     // -- validation code for: _ypos
 824     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 825     { // -- local scope
 826       org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;
 827       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();
 828       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 829       typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);
 830       typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);
 831     }
 832     desc.setValidator(fieldValidator);
 833     // -- initialize element descriptors
 834
 835     // -- _title
 836     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 837             java.lang.String.class, "_title", "title",
 838             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 839     desc.setImmutable(true);
 840     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 841     {
 842       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 843               throws IllegalStateException
 844       {
 845         Tree target = (Tree) object;
 846         return target.getTitle();
 847       }
 848
 849       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 850               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 851       {
 852         try
 853         {
 854           Tree target = (Tree) object;
 855           target.setTitle((java.lang.String) value);
 856         } catch (java.lang.Exception ex)
 857         {
 858           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 859         }
 860       }
 861
 862       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 863       {
 864         return null;
 865       }
 866     };
 867     desc.setHandler(handler);
 868     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 869     desc.setMultivalued(false);
 870     addFieldDescriptor(desc);
 871
 872     // -- validation code for: _title
 873     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 874     { // -- local scope
 875       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 876       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 877       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 878       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 879     }
 880     desc.setValidator(fieldValidator);
 881     // -- _newick
 882     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 883             java.lang.String.class, "_newick", "newick",
 884             org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 885     desc.setImmutable(true);
 886     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 887     {
 888       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 889               throws IllegalStateException
 890       {
 891         Tree target = (Tree) object;
 892         return target.getNewick();
 893       }
 894
 895       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 896               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 897       {
 898         try
 899         {
 900           Tree target = (Tree) object;
 901           target.setNewick((java.lang.String) value);
 902         } catch (java.lang.Exception ex)
 903         {
 904           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 905         }
 906       }
 907
 908       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 909       {
 910         return null;
 911       }
 912     };
 913     desc.setHandler(handler);
 914     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");
 915     desc.setMultivalued(false);
 916     addFieldDescriptor(desc);
 917
 918     // -- validation code for: _newick
 919     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 920     { // -- local scope
 921       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 922       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 923       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 924       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 925     }
 926     desc.setValidator(fieldValidator);
 927   }
 928
 929   // -----------/
 930   // - Methods -/
 931   // -----------/
 932
 933   /**
 934    * Method getAccessMode.
 935    *
 936    * @return the access mode specified for this class.
 937    */
 938   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 939   {
 940     return null;
 941   }
 942
 943   /**
 944    * Method getIdentity.
 945    *
 946    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 947    */
 948   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 949   {
 950     return super.getIdentity();
 951   }
 952
 953   /**
 954    * Method getJavaClass.
 955    *
 956    * @return the Java class represented by this descriptor.
 957    */
 958   public java.lang.Class getJavaClass()
 959   {
 960     return jalview.schemabinding.version2.Tree.class;
 961   }
 962
 963   /**
 964    * Method getNameSpacePrefix.
 965    *
 966    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 967    */
 968   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 969   {
 970     return _nsPrefix;
 971   }
 972
 973   /**
 974    * Method getNameSpaceURI.
 975    *
 976    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 977    */
 978   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 979   {
 980     return _nsURI;
 981   }
 982
 983   /**
 984    * Method getValidator.
 985    *
 986    * @return a specific validator for the class described by this
 987    *         ClassDescriptor.
 988    */
 989   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 990   {
 991     return this;
 992   }
 993
 994   /**
 995    * Method getXMLName.
 996    *
 997    * @return the XML Name for the Class being described.
 998    */
 999   public java.lang.String getXMLName()
1000   {
1001     return _xmlName;
1002   }
1003
1004   /**
1005    * Method isElementDefinition.
1006    *
1007    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
1008    *         element or element with anonymous type definition.
1009    */
1010   public boolean isElementDefinition()
1011   {
1012     return _elementDefinition;
1013   }
1014
1015 }