src/jalview/schemes/BuriedColourScheme.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.schemes;
  22
  23 import java.awt.*;
  24
  25 /**
  26  * DOCUMENT ME!
  27  *
  28  * @author $author$
  29  * @version $Revision$
  30  */
  31 public class BuriedColourScheme extends ScoreColourScheme
  32 {
  33   /**
  34    * Creates a new BuriedColourScheme object.
  35    */
  36   public BuriedColourScheme()
  37   {
  38     super(ResidueProperties.aaIndex, ResidueProperties.buried,
  39             ResidueProperties.buriedmin, ResidueProperties.buriedmax);
  40   }
  41
  42   /**
  43    * DOCUMENT ME!
  44    *
  45    * @param c
  46    *          DOCUMENT ME!
  47    *
  48    * @return DOCUMENT ME!
  49    */
  50   public Color makeColour(float c)
  51   {
  52     return new Color(0, (float) (1.0 - c), c);
  53   }
  54 }