src/jalview/schemes/ColourSchemeI.java

   1 package jalview.schemes;\r
   2 \r
   3 import jalview.datamodel.*;\r
   4 import java.awt.*;\r
   5 import java.util.*;\r
   6 \r
   7 public interface ColourSchemeI\r
   8 {\r
   9   public Color   findColour(String aa);\r
  10   public Vector  getColours(SequenceI s, Vector aa);\r
  11   public Color   getColour (SequenceI s, int pos, Vector aa);\r
  12   public Vector  getColours(SequenceGroup sg, Vector aa);\r
  13   public Color   findColour(SequenceI seq, String s,int j, Vector aa);\r
  14 \r
  15   public boolean canThreshold();\r
  16   public boolean isUserDefinable();\r
  17 }\r