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[jalview.git] / src / jalview / schemes / HydrophobicColourScheme.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.schemes;
22
23 import java.awt.Color;
24
25 /**
26  * DOCUMENT ME!
27  * 
28  * @author $author$
29  * @version $Revision$
30  */
31 public class HydrophobicColourScheme extends ScoreColourScheme
32 {
33   /**
34    * Creates a new HydrophobicColourScheme object.
35    */
36   public HydrophobicColourScheme()
37   {
38     super(ResidueProperties.aaIndex, ResidueProperties.hyd,
39             ResidueProperties.hydmin, ResidueProperties.hydmax);
40   }
41
42   /**
43    * DOCUMENT ME!
44    * 
45    * @param c
46    *          DOCUMENT ME!
47    * 
48    * @return DOCUMENT ME!
49    */
50   public Color makeColour(float c)
51   {
52     return new Color(c, (float) 0.0, (float) 1.0 - c);
53   }
54 }