src/jalview/structure/StructureMappingcommandSet.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.structure;
  22
  23 /**
  24  * holder for script commands generated for a particular structure mapping
  25  *
  26  * @author jimp
  27  *
  28  */
  29 public class StructureMappingcommandSet
  30 {
  31   /**
  32    * structure file for which these commands were generated
  33    */
  34   public String mapping;
  35
  36   /**
  37    * set of commands
  38    */
  39   public String[] commands;
  40
  41   /**
  42    * some object that indicates what the commands can be parsed by (eg
  43    * JmolCommands.class implies these are Jmol commands)
  44    */
  45   public Object handledBy;
  46
  47   /**
  48    * record the originating command generator, the structure mapping involved,
  49    * and the set of commands to be passed.
  50    *
  51    * @param handledBy
  52    * @param files
  53    * @param commands
  54    */
  55   public StructureMappingcommandSet(Object handledBy, String files,
  56           String[] commands)
  57   {
  58     this.mapping = files;
  59     this.handledBy = handledBy;
  60     this.commands = commands;
  61   }
  62 }