src/jalview/util/ArrayUtils.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.util;
  22
  23 import java.util.Arrays;
  24
  25 public class ArrayUtils
  26 {
  27   /**
  28    * Reverse the given array 'in situ'
  29    *
  30    * @param arr
  31    */
  32   public static void reverseIntArray(int[] arr)
  33   {
  34     if (arr != null)
  35     {
  36       /*
  37        * swap [k] with [end-k] up to the half way point in the array
  38        * if length is odd, the middle entry is left untouched by the excitement
  39        */
  40       int last = arr.length - 1;
  41       for (int k = 0; k < arr.length / 2; k++)
  42       {
  43         int temp = arr[k];
  44         arr[k] = arr[last - k];
  45         arr[last - k] = temp;
  46       }
  47     }
  48   }
  49
  50   public static <T> T[] concatArrays(T[]... arrays)
  51   {
  52     if (arrays == null)
  53       return null;
  54     if (arrays.length == 1)
  55       return arrays[0];
  56
  57     T[] result = arrays[0];
  58     for (int i = 1; i < arrays.length; i++)
  59     {
  60       result = concatTwoArrays(result, arrays[i]);
  61     }
  62     return result;
  63   }
  64
  65   private static <T> T[] concatTwoArrays(T[] array1, T[] array2)
  66   {
  67     T[] result = Arrays.copyOf(array1, array1.length + array2.length);
  68     System.arraycopy(array2, 0, result, array1.length, array2.length);
  69     return result;
  70   }
  71
  72 }