src/jalview/util/DBRefUtils.java

   1 package jalview.util;
   2
   3 import java.util.Vector;
   4 import java.util.Hashtable;
   5
   6 public class DBRefUtils
   7 {
   8     /**
   9      * Utilities for handling DBRef objects and their collections.
  10      */
  11     public static Vector selectRefs(java.util.Vector dbrefs, String[] sources) {
  12       if (dbrefs==null)
  13         return null;
  14       if (sources==null)
  15         return dbrefs;
  16       Hashtable srcs = new Hashtable();
  17       Vector res=new Vector();
  18       for (int i=0; i<sources.length; i++)
  19         srcs.put(new String(sources[i]), new Integer(i));
  20       for (int i=0, j=dbrefs.size(); i<j; i++)
  21         if (dbrefs.get(i) instanceof jalview.datamodel.DBRefEntry) {
  22           jalview.datamodel.DBRefEntry entry = (jalview.datamodel.DBRefEntry) dbrefs.get(i);
  23           if (srcs.containsKey(entry.getSource()))
  24             res.add(entry);
  25         }
  26       if (res.size()>0)
  27         return res;
  28       res = null;
  29       // there are probable  memory leaks in the hashtable!
  30       return null;
  31     }
  32   }