src/jalview/util/FileUtils.java

   1 package jalview.util;
   2
   3 import java.io.File;
   4 import java.io.IOException;
   5
   6 /**
   7  * Miscellaneous file-related functions
   8  */
   9 public final class FileUtils
  10 {
  11
  12   /**
  13    * Answers the executable file for the given command, or null if not found or
  14    * not executable. The path to the executable is the command name prefixed by
  15    * the given folder path, optionally with .exe appended.
  16    *
  17    * @param cmd
  18    *          command short name, for example hmmbuild
  19    * @param binaryPath
  20    *          parent folder for the executable
  21    * @return
  22    */
  23   public static File getExecutable(String cmd, String binaryPath)
  24   {
  25     File file = new File(binaryPath, cmd);
  26     if (!file.canExecute())
  27     {
  28       file = new File(binaryPath, cmd + ".exe");
  29       {
  30         if (!file.canExecute())
  31         {
  32           file = null;
  33         }
  34       }
  35     }
  36     return file;
  37   }
  38
  39   /**
  40    * A convenience method to create a temporary file that is deleted on exit of
  41    * the JVM
  42    *
  43    * @param prefix
  44    * @param suffix
  45    * @return
  46    * @throws IOException
  47    */
  48   public static File createTempFile(String prefix, String suffix)
  49           throws IOException
  50   {
  51     File f = File.createTempFile(prefix, suffix);
  52     f.deleteOnExit();
  53     return f;
  54   }
  55
  56 }