JAL-1139 latest version of proguard needed for Java 1.7 builds
[jalview.git] / src / jalview / ws / dbsources / EbiFileRetrievedProxy.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
10  *  
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
15  * 
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
17  */
18 package jalview.ws.dbsources;
19
20 import java.io.BufferedReader;
21 import java.io.File;
22 import java.io.FileReader;
23 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxyImpl;
24
25 public abstract class EbiFileRetrievedProxy extends DbSourceProxyImpl
26 {
27
28   /**
29    * temp path to retrieved file
30    */
31   protected String file = null;
32
33   public StringBuffer getRawRecords()
34   {
35     if (file == null)
36       return null;
37     StringBuffer bf = null;
38     try
39     {
40       File f = new File(file);
41       if (f.exists())
42       {
43         bf = new StringBuffer();
44         BufferedReader breader = new BufferedReader(new FileReader(f));
45         String line = null;
46         while (breader.ready() && (line = breader.readLine()) != null)
47         {
48           bf.append(line);
49         }
50         breader.close();
51       }
52     } catch (Exception e)
53     {
54       System.err.println("Warning: problems reading temp file " + file);
55       return null;
56     }
57     return bf;
58   }
59
60 }