JAL-1628 method to hide insertions to current sequence selection
[jalview.git] / src / jalview / ws / dbsources / EbiFileRetrievedProxy.java
1 /*
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16  * 
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18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
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20  */
21 package jalview.ws.dbsources;
22
23 import java.io.BufferedReader;
24 import java.io.File;
25 import java.io.FileReader;
26 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxyImpl;
27
28 public abstract class EbiFileRetrievedProxy extends DbSourceProxyImpl
29 {
30
31   /**
32    * temp path to retrieved file
33    */
34   protected String file = null;
35
36   public StringBuffer getRawRecords()
37   {
38     if (file == null)
39       return null;
40     StringBuffer bf = null;
41     try
42     {
43       File f = new File(file);
44       if (f.exists())
45       {
46         bf = new StringBuffer();
47         BufferedReader breader = new BufferedReader(new FileReader(f));
48         String line = null;
49         while (breader.ready() && (line = breader.readLine()) != null)
50         {
51           bf.append(line);
52         }
53         breader.close();
54       }
55     } catch (Exception e)
56     {
57       System.err.println("Warning: problems reading temp file " + file);
58       return null;
59     }
60     return bf;
61   }
62
63 }