src/jalview/ws/dbsources/Intermine.java

   1 package jalview.ws.dbsources;
   2
   3 import jalview.datamodel.AlignmentI;
   4 import jalview.datamodel.DBRefSource;
   5 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy;
   6 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxyImpl;
   7
   8 import com.stevesoft.pat.Regex;
   9
  10 public class Intermine extends DbSourceProxyImpl implements DbSourceProxy
  11 {
  12
  13   @Override
  14   public String getDbSource()
  15   {
  16     return DBRefSource.INTERMINE;
  17   }
  18
  19   @Override
  20   public String getDbName()
  21   {
  22     return "Intermine";
  23   }
  24
  25   @Override
  26   public String getDbVersion()
  27   {
  28     // TODO Auto-generated method stub
  29     return null;
  30   }
  31
  32   @Override
  33   public String getAccessionSeparator()
  34   {
  35     // TODO Auto-generated method stub
  36     return null;
  37   }
  38
  39   @Override
  40   public Regex getAccessionValidator()
  41   {
  42     // TODO Auto-generated method stub
  43     return null;
  44   }
  45
  46   // @Override
  47   // public Hashtable getDbSourceProperties()
  48   // {
  49   // // TODO Auto-generated method stub
  50   // return null;
  51   // }
  52
  53   @Override
  54   public String getTestQuery()
  55   {
  56     // TODO Auto-generated method stub
  57     return null;
  58   }
  59
  60   @Override
  61   public boolean isValidReference(String accession)
  62   {
  63     // TODO Auto-generated method stub
  64     return false;
  65   }
  66
  67   @Override
  68   public AlignmentI getSequenceRecords(String queries) throws Exception
  69   {
  70     // TODO Auto-generated method stub
  71     return null;
  72   }
  73
  74   @Override
  75   public boolean queryInProgress()
  76   {
  77     // TODO Auto-generated method stub
  78     return false;
  79   }
  80
  81   @Override
  82   public StringBuffer getRawRecords()
  83   {
  84     // TODO Auto-generated method stub
  85     return null;
  86   }
  87
  88   @Override
  89   public boolean isA(Object dbsourceproperty)
  90   {
  91     // TODO Auto-generated method stub
  92     return false;
  93   }
  94
  95   @Override
  96   public int getTier()
  97   {
  98     // TODO Auto-generated method stub
  99     return 0;
 100   }
 101
 102 }