remove contaminant imports
[jalview.git] / src / jalview / ws / dbsources / PfamFull.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  * \r
5  * This file is part of Jalview.\r
6  * \r
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
10  * \r
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
15  * \r
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
17  */\r
18 package jalview.ws.dbsources;\r
19 \r
20 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy;\r
21 \r
22 /**\r
23  * flyweight class specifying retrieval of Full family alignments from PFAM\r
24  * \r
25  */\r
26 public class PfamFull extends Pfam implements DbSourceProxy\r
27 {\r
28   public PfamFull()\r
29   {\r
30     super();\r
31   }\r
32 \r
33   /*\r
34    * (non-Javadoc)\r
35    * \r
36    * @see jalview.ws.dbsources.Pfam#getPFAMURL()\r
37    */\r
38   protected String getXFAMURL()\r
39   {\r
40     return "http://pfam.sanger.ac.uk/family/alignment/download/format?alnType=full&format=stockholm&order=t&case=l&gaps=default&entry=";\r
41   }\r
42 \r
43   /*\r
44    * (non-Javadoc)\r
45    * \r
46    * @see jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy#getDbName()\r
47    */\r
48   public String getDbName()\r
49   {\r
50     return "PFAM (Full)";\r
51   }\r
52 \r
53   public String getDbSource()\r
54   {\r
55     return getDbName(); // so we have unique DbSource string.\r
56   }\r
57 \r
58   public String getTestQuery()\r
59   {\r
60     return "PF03760";\r
61   }\r
62 \r
63 public String getDbVersion() {\r
64         return null;\r
65 }\r
66 \r
67 }\r