JAL-1139 latest version of proguard needed for Java 1.7 builds
[jalview.git] / src / jalview / ws / dbsources / RfamFull.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
10  *  
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
15  * 
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
17  */
18 package jalview.ws.dbsources;
19
20 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy;
21
22 /**
23  * Flyweight class specifying retrieval of Full family alignments from RFAM
24  * 
25  * @author Lauren Michelle Lui
26  * 
27  */
28 public class RfamFull extends Rfam implements DbSourceProxy
29 {
30   public RfamFull()
31   {
32     super();
33   }
34
35   /*
36    * (non-Javadoc)
37    * 
38    * @see jalview.ws.dbsources.Rfam#getXFAMURL()
39    */
40   protected String getXFAMURL()
41   {
42     return "http://rfam.sanger.ac.uk/family/alignment/download/format?alnType=full&nseLabels=0&format=stockholm&acc=";
43   }
44
45   /*
46    * (non-Javadoc)
47    * 
48    * @see jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy#getDbName()
49    */
50   public String getDbName()
51   {
52     return "RFAM (Full)";
53   }
54
55   public String getDbSource()
56   {
57     return getDbName(); // so we have unique DbSource string.
58   }
59
60   public String getTestQuery()
61   {
62     // Can be retrieved from http://rfam.janelia.org/cgi-bin/getdesc?acc=RF00014
63     // or
64     // http://rfam.sanger.ac.uk/family/alignment/download/format?alnType=full&nseLabels=0&format=stockholm&acc=RF00014
65     return "RF00014";
66   }
67
68   public String getDbVersion()
69   {
70     return null;
71   }
72
73 }