src/jalview/ws/jws2/ParameterUtils.java

   1 package jalview.ws.jws2;
   2
   3 import java.util.HashSet;
   4 import java.util.List;
   5
   6 import compbio.metadata.*;
   7 public class ParameterUtils
   8 {
   9
  10   public static Option copyOption(Option option)
  11   {
  12     Option copy = new Option(option.getName(), option.getDescription());
  13     setOptionFrom(copy, option);
  14     return copy;
  15   }
  16   public static void setOptionFrom(Option copy, Option option)
  17   {
  18     copy.setName(option.getName());
  19     copy.setDescription(option.getDescription());
  20     copy.setFurtherDetails(option.getFurtherDetails());
  21     copy.setRequired(option.isRequired());
  22     List<String> names = option.getOptionNames();
  23     if (names!=null){
  24       if (names.size()==1)
  25       {
  26         HashSet<String> st = new HashSet();
  27         st.add(names.get(0));
  28         copy.setOptionNames(st);
  29       } else {
  30       copy.addOptionNames(names.toArray(new String[]{}));
  31       }
  32     }
  33     try {
  34       if (option.getDefaultValue()!=null)
  35       {
  36         copy.setDefaultValue(option.getDefaultValue());
  37       }
  38     } catch (Exception ex)
  39     {
  40       ex.printStackTrace();
  41     }
  42   }
  43
  44   public static ValueConstrain copyValueConstrain(ValueConstrain vc)
  45   {
  46     try {ValueConstrain copy = new ValueConstrain();
  47     if (vc.getMax()!=null) {
  48       copy.setMax(vc.getMax().toString());
  49     }
  50     if (vc.getMin()!=null) {
  51       copy.setMin(vc.getMin().toString());
  52     }
  53     if (vc.getType()!=null) {
  54       copy.setType(vc.getType());
  55     }
  56     return copy;
  57     }
  58     catch (Exception e)
  59     {
  60       e.printStackTrace();
  61       throw new Error("Implementation error: could not copy ValueConstrain!");
  62     }
  63   }
  64   public static Parameter copyParameter(Parameter parameter)
  65   {
  66     Parameter copy = new Parameter(parameter.getName(), parameter.getDescription());
  67     if (parameter.getValidValue()!=null) {
  68       copy.setValidValue(copyValueConstrain(parameter.getValidValue()));
  69     }
  70     List<String> pv = parameter.getPossibleValues();
  71     if (pv!=null)
  72     {
  73       copy.addPossibleValues(pv.toArray(new String[]{}));
  74     }
  75     setOptionFrom(copy, parameter);
  76     return copy;
  77   }
  78
  79 }