JAL-1628 method to hide insertions to current sequence selection
[jalview.git] / src / jalview / ws / params / ParamDatastoreI.java
1 /*
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18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
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20  */
21 package jalview.ws.params;
22
23 import java.io.IOException;
24 import java.util.List;
25
26 public interface ParamDatastoreI
27 {
28
29   public List<WsParamSetI> getPresets();
30
31   public WsParamSetI getPreset(String name);
32
33   public List<ArgumentI> getServiceParameters();
34
35   public boolean presetExists(String name);
36
37   public void deletePreset(String name);
38
39   /**
40    * writes or overwrites the record for a modifiable WsParamSetI entry with a
41    * given name in the datastore.
42    * 
43    * @param presetName
44    * @param text
45    * @param jobParams
46    *          may throw an illegal argument RunTimeException if the presetName
47    *          overwrites an existing, unmodifiable preset.
48    */
49   public void storePreset(String presetName, String text,
50           List<ArgumentI> jobParams);
51
52   /**
53    * update an existing instance with a new name, descriptive text and
54    * parameters.
55    * 
56    * @param oldName
57    * @param presetName
58    * @param text
59    * @param jobParams
60    */
61   public void updatePreset(String oldName, String presetName, String text,
62           List<ArgumentI> jobParams);
63
64   /**
65    * factory method - builds a service specific parameter object using the given
66    * data
67    * 
68    * @param name
69    * @param description
70    * @param applicable
71    *          URLs
72    * @param parameterfile
73    *          Service specific jalview parameter file (as returned from new
74    *          method)
75    * @return null or valid WsParamSetI object for this service.
76    */
77
78   public WsParamSetI parseServiceParameterFile(String name,
79           String description, String[] serviceURL, String parameters)
80           throws IOException;
81
82   /**
83    * create the service specific parameter file for this pset object.
84    * 
85    * @param pset
86    * @return string representation of the parameters specified by this set.
87    * @throws IOException
88    */
89   public String generateServiceParameterFile(WsParamSetI pset)
90           throws IOException;
91
92 }