src/jalview/ws/params/ParamDatastoreI.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
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  17  */
  18 package jalview.ws.params;
  19
  20 import java.io.IOException;
  21 import java.util.List;
  22
  23 public interface ParamDatastoreI
  24 {
  25
  26   public List<WsParamSetI> getPresets();
  27
  28   public WsParamSetI getPreset(String name);
  29
  30   public List<ArgumentI> getServiceParameters();
  31
  32   public boolean presetExists(String name);
  33
  34   public void deletePreset(String name);
  35
  36   /**
  37    * writes or overwrites the record for a modifiable WsParamSetI entry with a
  38    * given name in the datastore.
  39    *
  40    * @param presetName
  41    * @param text
  42    * @param jobParams
  43    *          may throw an illegal argument RunTimeException if the presetName
  44    *          overwrites an existing, unmodifiable preset.
  45    */
  46   public void storePreset(String presetName, String text,
  47           List<ArgumentI> jobParams);
  48
  49   /**
  50    * update an existing instance with a new name, descriptive text and
  51    * parameters.
  52    *
  53    * @param oldName
  54    * @param presetName
  55    * @param text
  56    * @param jobParams
  57    */
  58   public void updatePreset(String oldName, String presetName, String text,
  59           List<ArgumentI> jobParams);
  60
  61   /**
  62    * factory method - builds a service specific parameter object using the given
  63    * data
  64    *
  65    * @param name
  66    * @param description
  67    * @param applicable
  68    *          URLs
  69    * @param parameterfile
  70    *          Service specific jalview parameter file (as returned from new
  71    *          method)
  72    * @return null or valid WsParamSetI object for this service.
  73    */
  74
  75   public WsParamSetI parseServiceParameterFile(String name,
  76           String description, String[] serviceURL, String parameters)
  77           throws IOException;
  78
  79   /**
  80    * create the service specific parameter file for this pset object.
  81    *
  82    * @param pset
  83    * @return string representation of the parameters specified by this set.
  84    * @throws IOException
  85    */
  86   public String generateServiceParameterFile(WsParamSetI pset)
  87           throws IOException;
  88
  89 }