src/jalview/ws2/actions/alignment/AlignmentResult.java

   1 package jalview.ws2.actions.alignment;
   2
   3 import java.util.List;
   4
   5 import jalview.datamodel.AlignmentI;
   6 import jalview.datamodel.AlignmentOrder;
   7 import jalview.datamodel.HiddenColumns;
   8 import jalview.ws2.actions.api.TaskEventListener;
   9
  10 /**
  11  * A data container storing the output of multiple sequence alignment services.
  12  * The object is constructed by an {@link AlignmentTask} on completion and
  13  * passed to the handler {@link TaskEventListener#taskCompleted(TaskI, Object)}
  14  * method as a result.
  15  *
  16  * @author mmwarowny
  17  */
  18 public class AlignmentResult
  19 {
  20   final AlignmentI aln;
  21
  22   final List<AlignmentOrder> alorders;
  23
  24   final HiddenColumns hidden;
  25
  26   AlignmentResult(AlignmentI aln, List<AlignmentOrder> alorders,
  27       HiddenColumns hidden)
  28   {
  29     this.aln = aln;
  30     this.alorders = alorders;
  31     this.hidden = hidden;
  32   }
  33
  34   public AlignmentI getAlignment()
  35   {
  36     return aln;
  37   }
  38
  39   public List<AlignmentOrder> getAlignmentOrders()
  40   {
  41     return alorders;
  42   }
  43
  44   public HiddenColumns getHiddenColumns()
  45   {
  46     return hidden;
  47   }
  48 }